Nodaviridae - Nodaviridae
Nodaviridae | |
---|---|
Вакуоли в сетчатка из Австралийский бас личинка экспериментально заражена Бетанодавирус | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство: | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Kitrinoviricota |
Класс: | Magsaviricetes |
Порядок: | Nodamuvirales |
Семья: | Nodaviridae |
Nodaviridae это семья без оболочки вирусы с положительной цепью РНК.[1] Позвоночные и беспозвоночные служат естественными хозяевами. Заболевания, связанные с этим семейством, включают: вирусные энцефалопатия и ретинопатия В семействе рыб, разделенных на два рода, девять видов.[2][3]
История
Название семьи происходит от Японский деревня Нодамура, Префектура Иватэ где вирус Нодамура был впервые выделен из Culex tritaeniorhynchus комары.
Вирусология
Структура
Вирус не имеет оболочки и имеет икосаэдрический капсид (число триангуляции = 3) в диапазоне от 29 до 35 нм в диаметре. В капсид состоит из 32 капсомеров.[2]
Геном
Геном линейный, положительно-смысловой, двудольный (состоит из двух сегментов - РНК1 и РНК2), одноцепочечный. РНК состоящий из 4500 нуклеотиды с 5-дюймовым терминалом метилированный cap и неполиаденилированный 3’-конец.[2]
РНК1, длина которой составляет ~ 3,1 килобаз, кодирует белок, который имеет несколько функциональных доменов: митохондриальный целевой домен, трансмембранный домен, домен РНК-зависимой РНК-полимеразы (RdRp), домен самовзаимодействия и домен кэппинга РНК. Кроме того, РНК1 кодирует субгеномную РНК3, которая кодирует белок B2, ингибитор подавления РНК.[2]
РНК2 кодирует белок α, предшественник белка вирусного капсида, который автоматически расщепляется на два зрелых белка, β-белок 38 кДа и γ-белок 5 кДа, при сохранении Asn /Ала сайт во время сборки вируса.[2]
Жизненный цикл
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Попадание в хозяйскую клетку достигается за счет проникновения в хозяйскую клетку. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК с использованием внутренней модели инициации транскрипции субгеномной РНК является методом транскрипции. Позвоночные и беспозвоночные служат естественным хозяином. Пути передачи - контакт и заражение.[2][3]
Таксономия
Члены рода Альфанодавирус изначально были изолированы от насекомых, в то время как представители рода Бетанодавирус были изолированы от рыб. Небольшое количество нодовирусов, по-видимому, находится за пределами любой из этих клад.[2] Пока NoV остается типовым видом Альфанодавирус, Вирус Flock house (FHV) - наиболее изученный из нодавирусов.[2] В этом семействе девять видов, разделенных на два рода:[2]
- Альфанодавирус
- Бетанодавирус
- Вирус нервного некроза камбалы барфиновой
- Вирус нервного некроза морского окуня
- Вирус нервного некроза полосатого Джека
- Вирус нервного некроза тигрового иглобрюха
использованная литература
- ^ Сахул Хамид, AS; Ninawe, AS; Накаи, Т; Chi, SC; Джонсон, KL; Отчет ICTV, Консорциум (январь 2019 г.). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Nodaviridae". Журнал общей вирусологии. 100 (1): 3–4. Дои:10.1099 / jgv.0.001170. PMID 30431412.
- ^ а б c d е ж г час я "Отчет ICTV Nodaviridae".
- ^ а б «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.