Октамер-связывающий белок, не содержащий домена POU - Non-POU domain-containing octamer-binding protein

Эта статья о гене, кодирующем человеческий белок. Для использования в других целях см. ноно (значения).
НЕТ НЕТ
Белок NONO PDB 2cpj.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыНЕТ НЕТ, NMT55, NRB54, P54, P54NRB, PPP1R114, MRXS34, домен, не содержащий POU, связывающий октамер, домен, не содержащий POU, содержащий связывание октамера
Внешние идентификаторыOMIM: 300084 MGI: 1855692 ГомолоГен: 7212 Генные карты: НЕТ НЕТ
Расположение гена (человек)
Х-хромосома (человек)
Chr.Х-хромосома (человек)[1]
Х-хромосома (человек)
Геномное местоположение для NONO
Геномное местоположение для NONO
ГруппаXq13.1Начинать71,283,192 бп[1]
Конец71,301,168 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NONO 210470 x at fs.png

PBB GE NONO 208698 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

4841

53610

Ансамбль

ENSG00000147140

ENSMUSG00000031311

UniProt

Q15233

Q99K48

RefSeq (мРНК)

NM_007363
NM_001145408
NM_001145409
NM_001145410

NM_001252518
NM_023144

RefSeq (белок)

NP_001138880
NP_001138881
NP_001138882
NP_031389

NP_001239447
NP_075633

Расположение (UCSC)Chr X: 71,28 - 71,3 МбChr X: 101.43 - 101.45 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Октамер-связывающий белок, не содержащий домена POU (NonO) - это белок что у людей кодируется НЕТ НЕТ ген.[5][6][7]

Белок NonO принадлежит к семейству белков поведения дрозофилы / сплайсинга человека (DBHS).[8] Белки семейства DHBS включают в себя SFPQ (фактор сплайсинга, богатый пролином и глутамином; он же PSF), NONO (белок, не содержащий домена POU, октамер-связывающий белок; он же p54nrb) и PSPC1 (компонент 1 параспекла; он же PSP1) и NONA беспозвоночных (белок без переходный A) и Hrp65.[9]

Взаимодействия

NONO был показан взаимодействовать с SFPQ,[10] SPI1[11] и Рецептор андрогенов.[12]

Функции

NONO участвует во многих ядерных процессах и связывается с обоими ДНК и РНК.[13]

Как и все белки, семейный белок DBHS описывается как многофункциональный ядерный белок.[14] Было показано, что белок NONO участвует во многих биологических функциях, включая сплайсинг пре-мРНК; активация транскрипция; прекращение транскрипции; Раскрутка ДНК, спаривание и поддержание правильного циркадные часы функция.[13][15][16][17][18][19]

Было обнаружено, что NONO связывается с Rasd1 белка, в результате чего димер Rasd1 может действовать, модулируя функцию NONO, подавляя экспрессию CREB гены, NR4A1 и Nr4A2.[20]

NONO связывается с SFPQ, чтобы сформировать гетеродимер который взаимодействует с MATR3 белок.[21] Взаимодействие этих трех белков может быть частью процесса в ядре, который отвечает за удержание дефектных, еще недостаточно зрелых для экспорта или предназначенных для удержания РНК. ядро.[21]

Расположение гена

Белок NONO (человека) кодируется белком NONO ген который расположен на плюсовой нити Х хромосома.[22]

Роль в болезни

Меланома

Было показано, что NONO сильнее выражается в меланома линии клеток и образцы ткани меланомы по сравнению с линиями нормальных клеток человека и нормальной тканью кожи.[23] Исследования показали, что нокаутировать белка NONO из линий клеток меланомы приводит как к снижению скорости пролиферации раковых клеток, так и к значительному снижению потенциальной миграции раковых клеток.[23]

Рак молочной железы

Исследования в рак груди обнаружили, что потеря или изменение NONO в сочетании с потерей рецептора эстрогена hERα приводит к более агрессивному раку молочной железы, который демонстрирует увеличение обоих опухоль размер и метастазы.[24]

Умственная отсталость, связанная с кардиомиопатией без уплотнения

Исследования на людях и мышах показали, что NONO нулевые мутации вероятно, приведет к развитию клинически распознаваемого Интеллектуальная недееспособность при когнитивном и аффективном дефиците.[25] Позже было обнаружено, что эти патогенные варианты также были тесно связаны с кардиомиопатия с некомпактированием левого желудочка и иногда Аномалия Эбштейна.[26][27]

Структура

Как и другие белки семейства DBHS, белок NONO редко функционирует в одиночку и в основном образует гомо- и гетеродимеры с другими белками DBHS для выполнения своих различных функций.[28] Предполагается, что эти димеры могут иметь разные функции, которые зависят от типа клетки, в которой они находятся.[29]

Предполагается, что это фосфорилирование состояние на NONO, которое действует, чтобы управлять белками многих разнородных функций в ядре.[13]

Тканевая специфичность

NONO находится в ядре большинства млекопитающее ячеек и в основном распространяется внутри нуклеоплазма, его также можно найти сконцентрированным в субъядерных доменах, известных как параспек.[30]

NONO также наблюдался в головном мозге, локализованном в цитоплазма из гиппокамп нейроны которые связаны с транспортом РНК гранулы.[31] Он также сильно экспрессируется в сердечной ткани. [27]

Открытие

Белок NONO был впервые обнаружен в 1993 году исследователями из Лаборатория Колд-Спрингс-Харбор. Из-за того, что белок первоначально был идентифицирован как РНК-связывающий белок, он был назван p54nrb, что означает ядерный РНК-связывающий белок, 54 кДа.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000147140 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031311 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Донг Б., Горовиц Д.С., Кобаяши Р., Крайнер А.Р. (август 1993 г.). «Очистка и клонирование кДНК клетки HeLa p54nrb, ядерного белка с двумя мотивами распознавания РНК и значительной гомологией с человеческим фактором сплайсинга PSF и NONA / BJ6 дрозофилы». Исследования нуклеиновых кислот. 21 (17): 4085–92. Дои:10.1093 / nar / 21.17.4085. ЧВК  310009. PMID  8371983.
  6. ^ Traish AM, Huang YH, Ashba J, Pronovost M, Pavao M, McAneny DB, Moreland RB (август 1997). «Потеря экспрессии ядерного белка 55 кДа (nmt55) при раке груди человека, отрицательном по рецептору эстрогена». Диагностическая молекулярная патология. 6 (4): 209–21. Дои:10.1097/00019606-199708000-00005. PMID  9360842.
  7. ^ "Entrez Gene: NONO, не содержащий POU домен, связывающийся с октамером".
  8. ^ а б Донг Б., Горовиц Д.С., Кобаяши Р., Крайнер А.Р. (август 1993 г.). «Очистка и клонирование кДНК клетки HeLa p54nrb, ядерного белка с двумя мотивами распознавания РНК и значительной гомологией с человеческим фактором сплайсинга PSF и NONA / BJ6 дрозофилы». Исследования нуклеиновых кислот. 21 (17): 4085–92. Дои:10.1093 / nar / 21.17.4085. ЧВК  310009. PMID  8371983.
  9. ^ Пассон Д.М., Ли М., Рэкхэм О., Стэнли В.А., Садовска А., Филиповска А., Фокс А.Х., Bond CS (март 2012 г.). «Структура гетеродимера человеческого NONO и компонента 1 белка параспеклов и анализ его роли в формировании субядерного тела». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 109 (13): 4846–50. Дои:10.1073 / pnas.1120792109. ЧВК  3324020. PMID  22416126.
  10. ^ Пэн Р., Дай Б.Т., Перес И., Барнард, округ Колумбия, Томпсон А.Б., Паттон Дж. Г. (октябрь 2002 г.). «PSF и p54nrb связывают консервативный стержень в мяРНК U5». РНК. 8 (10): 1334–47. Дои:10.1017 / S1355838202022070. ЧВК  1370341. PMID  12403470.
  11. ^ Hallier M, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (май 1996 г.). «Фактор транскрипции Spi-1 / PU.1 связывает РНК и мешает РНК-связывающему белку p54nrb». Журнал биологической химии. 271 (19): 11177–81. Дои:10.1074 / jbc.271.19.11177. PMID  8626664.
  12. ^ Иситани К., Йошида Т., Китагава Х, Охта Х, Нодзава С., Като С. (июль 2003 г.). «p54nrb действует как транскрипционный коактиватор для активации функции 1 рецептора андрогенов человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 306 (3): 660–5. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 01021-0. PMID  12810069.
  13. ^ а б c Шав-Тал Й., Зипори Д. (ноябрь 2002 г.). «PSF и p54nrb / NonO - многофункциональные ядерные белки». FEBS Lett. 531 (2): 109–14. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03447-6. PMID  12417296.
  14. ^ Duvignaud JB, Bédard M, Nagata T, Muto Y, Yokoyama S, Gagné SM, Vincent M (май 2016 г.). «Структура, динамика и взаимодействие p54 (nrb) / NonO RRM1 с 5 'последовательностью РНК сайта сплайсинга». Биохимия. 55 (18): 2553–66. Дои:10.1021 / acs.biochem.5b01240. PMID  27064654.
  15. ^ Басу А., Донг Б., Крайнер А.Р., Хау С.К. (февраль 1997 г.). «Проксимальный энхансер-связывающий белок внутрицистернальной А-частицы активирует транскрипцию и идентичен РНК- и ДНК-связывающему белку p54nrb / NonO». Молекулярная и клеточная биология. 17 (2): 677–86. Дои:10.1128 / mcb.17.2.677. ЧВК  231793. PMID  9001221.
  16. ^ Danckwardt S, Kaufmann I., Gentzel M, Foerstner KU, Gantzert AS, Gehring NH, Neu-Yilik G, Bork P, Keller W., Wilm M, Hentze MW, Kulozik AE (июнь 2007 г.). «Факторы сплайсинга стимулируют полиаденилирование с помощью USE по сигналам образования неканонических 3'-концов». Журнал EMBO. 26 (11): 2658–69. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601699. ЧВК  1888663. PMID  17464285.
  17. ^ Hallier M, Lerga A, Barnache S, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (февраль 1998 г.). «Фактор транскрипции Spi-1 / PU.1 взаимодействует с потенциальным фактором сплайсинга TLS». Журнал биологической химии. 273 (9): 4838–42. Дои:10.1074 / jbc.273.9.4838. PMID  9478924.
  18. ^ Камеока С., Дуке П., Конарска М.М. (апрель 2004 г.). «p54 (nrb) ассоциируется с 5'-сайтом сплайсинга в больших комплексах транскрипции / сплайсинга». Журнал EMBO. 23 (8): 1782–91. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600187. ЧВК  394241. PMID  15057275.
  19. ^ Ковальска Э., Рипперджер Дж. А., Хёггер Д. К., Брюггер П., Бух Т., Бирчлер Т., Мюллер А., Альбрехт Ю., Контальдо С., Браун С. А. (январь 2013 г.). «NONO связывает циркадные часы с клеточным циклом». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 110 (5): 1592–9. Дои:10.1073 / pnas.1213317110. ЧВК  3562797. PMID  23267082.
  20. ^ Онг С.А., Тан Дж.Дж., Тью В.Л., Чен К.С. (01.01.2011). «Rasd1 модулирует коактиваторную функцию NonO в пути циклического АМФ». PLOS ONE. 6 (9): e24401. Дои:10.1371 / journal.pone.0024401. ЧВК  3168489. PMID  21915321.
  21. ^ а б Чжан З., Кармайкл Г.Г. (август 2001 г.). «Судьба дцРНК в ядре: p54 (nrb) -содержащий комплекс опосредует удерживание в ядре РНК, отредактированных беспорядочно от A к I». Клетка. 106 (4): 465–75. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00466-4. PMID  11525732.
  22. ^ «NONO - октамерсвязывающий белок, не содержащий домена POU - Homo sapiens (человек) - ген и белок NONO». www.uniprot.org. Получено 2016-10-14.
  23. ^ а б Шиффнер С., Зимара Н., Шмид Р., Боссерхофф А.К. (август 2011 г.). «p54nrb - новый регулятор прогрессирования злокачественной меланомы». Канцерогенез. 32 (8): 1176–82. Дои:10.1093 / carcin / bgr103. PMID  21642354.
  24. ^ Павао М., Хуанг Ю. Х., Хафер Л. Дж., Морленд РБ, Трэйш А. М. (01.01.2001). «Иммунодетекция изоформ nmt55 / p54nrb при раке груди человека». BMC Рак. 1: 15. Дои:10.1186/1471-2407-1-15. ЧВК  59838. PMID  11710964.
  25. ^ Mircsof D, Langouët M, Rio M, Moutton S, Siquier-Pernet K, Bole-Feysot C и др. (Декабрь 2015 г.). «Мутации в NONO приводят к синдромной умственной отсталости и тормозным синаптическим дефектам». Природа Неврологии. 18 (12): 1731–6. Дои:10.1038 / № 4169. ЧВК  5392243. PMID  26571461.
  26. ^ Рейнштейн Э., Цур С., Коэн Р., Борман С., Бехар Д.М. (ноябрь 2016 г.). «Умственная отсталость и кардиомиопатия без уплотнения с мутацией de novo NONO, идентифицированной с помощью секвенирования экзома». Европейский журнал генетики человека. 24 (11): 1635–1638. Дои:10.1038 / ejhg.2016.72. ЧВК  5110068. PMID  27329731.
  27. ^ а б Скотт Д.А., Эрнандес-Гарсия А., Азамиан М.С., Джордан В.К., Ким Б.Дж., Старкович М. и др. (Январь 2017 г.). «Врожденные пороки сердца и отсутствие уплотнения левого желудочка у мужчин с вариантами потери функции в NONO». Журнал медицинской генетики. 54 (1): 47–53. Дои:10.1136 / jmedgenet-2016-104039. PMID  27550220.
  28. ^ Фокс А.Х., Бонд С.С., Ламонд А.И. (ноябрь 2005 г.). «P54nrb образует гетеродимер с PSP1, который локализуется в парапеклах РНК-зависимым образом». Молекулярная биология клетки. 16 (11): 5304–15. Дои:10.1091 / mbc.E05-06-0587. ЧВК  1266428. PMID  16148043.
  29. ^ Knott GJ, Bond CS, Fox AH (май 2016 г.). «Белки DBHS SFPQ, NONO и PSPC1: многоцелевой молекулярный каркас». Исследования нуклеиновых кислот. 44 (9): 3989–4004. Дои:10.1093 / nar / gkw271. ЧВК  4872119. PMID  27084935.
  30. ^ Фокс А. Х., Ламонд А. И. (июль 2010 г.). "Параспеклы". Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии. 2 (7): a000687. Дои:10.1101 / cshperspect.a000687. ЧВК  2890200. PMID  20573717.
  31. ^ Канаи Ю., Дохмае Н., Хирокава Н. (август 2004 г.). «Кинезин транспортирует РНК: выделение и характеристика гранулы, транспортирующей РНК». Нейрон. 43 (4): 513–25. Дои:10.1016 / j.neuron.2004.07.022. PMID  15312650.

дальнейшее чтение