OGFOD1 - OGFOD1

OGFOD1
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыOGFOD1, TPA1, 2-оксоглутарат и железозависимый оксигеназный домен, содержащий 1
Внешние идентификаторыOMIM: 615857 MGI: 2442978 ГомолоГен: 41238 Генные карты: OGFOD1
Расположение гена (человек)
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человек)[1]
Хромосома 16 (человек)
Геномное расположение OGFOD1
Геномное расположение OGFOD1
Группа16q13Начните56,451,521 бп[1]
Конец56,479,104 бп[1]
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001093757
NM_177767

RefSeq (белок)

NP_001087226
NP_808435

Расположение (UCSC)Chr 16: 56.45 - 56.48 МбChr 8: 94.04 - 94.07 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

2-оксоглутарат и железозависимый оксигеназный домен, содержащий 1, также известный как OGFOD1, является человеком ген.[5]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции OGFOD1. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Огфод1tm1a (КОМП) Wtsi[10][11] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект высокопроизводительного мутагенеза для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых - в Wellcome Trust Sanger Institute.[12][13][14] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[8][15] Было проведено двадцать пять испытаний гомозиготный мутант взрослых мышей, однако значительных отклонений не наблюдалось.[8]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000087263 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033009 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ «Ген Entrez: 2-оксоглутарат и железозависимый оксигеназный домен, содержащий 1». Получено 2011-08-30.
  6. ^ "Сальмонелла данные о заражении Ogfod1 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  7. ^ "Citrobacter данные о заражении Ogfod1 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  8. ^ а б c Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88 (S248). Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  9. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  10. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  11. ^ "Информатика генома мыши".
  12. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  13. ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  14. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Ячейка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  15. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.

дальнейшее чтение