PAK6 - PAK6

PAK6
Белок PAK6 PDB 2c30.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPAK6, PAK5, p21 (RAC1) активированная киназа 6
Внешние идентификаторыOMIM: 608110 MGI: 2679420 ГомолоГен: 23200 Генные карты: PAK6
Расположение гена (человек)
Хромосома 15 (человек)
Chr.Хромосома 15 (человек)[1]
Хромосома 15 (человек)
Геномное расположение PAK6
Геномное расположение PAK6
Группа15q15.1Начинать40,217,428 бп[1]
Конец40,277,487 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PAK6 219461 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

56924

214230

Ансамбль

ENSG00000137843

ENSMUSG00000074923

UniProt

Q9NQU5

Q3ULB5

RefSeq (мРНК)

NM_020168
NM_001276717
NM_001276718

NM_001033254
NM_001145854

RefSeq (белок)

NP_001122100
NP_001122101

NP_001028426
NP_001139326

Расположение (UCSC)Chr 15: 40.22 - 40.28 МбChr 2: 118.66 - 118.7 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Серин / треонин-протеинкиназа PAK 6 является фермент что у людей кодируется PAK6 ген.[5][6]

PAK6 относится к членам семейства PAK II группы.[7] Как и другие члены семейства, PAK6 также эволюционно консервативен у разных видов.[8]

Открытие

PAK6 был первоначально клонирован как киназа, взаимодействующая с рецептором андрогена, которая может стимулироваться рецептором андрогена, но не Rac или Cdc42, как другие члены семейства.[7]

Генные и сплайсированные варианты

Ген PAK6 человека состоит из 16 экзонов, из которых 8 экзонов используются для сплайсинга 5’-UTR с целью генерации 17 транскриптов путем альтернативного сплайсинга, длина гена составляет около 38 т.п.н. Среди транскриптов PAK6 14 представляют собой РНК, кодирующие белок, которые кодируют четыре белка из 681 и 636 аминокислот, в то время как остальные транскрипты PAK6 не являются кодирующими РНК. В мышином гене PAK6 имеется пять транскриптов, из которых два транскрипта кодируют белок, а две другие - некодирующие РНК (ген из обзора).

Белковые домены

Следуя общей структурной организации PAK группы II, PAK6 также содержит киназу и домен, взаимодействующий с GTPase.[9][10]

Функция

Этот ген кодирует белок, который имеет высокую степень сходства последовательностей с членами семейства p21-активированной киназы (PAK). Белки этого семейства представляют собой связанные с Rac / Cdc42 Ste20-подобные Ser / Thr протеинкиназы, характеризующиеся высококонсервативным амино-концевым доменом интерактивного связывания (CRIB) Cdc42 / Rac и карбоксиконцевым доменом киназы. Киназы PAK участвуют в регуляции ряда клеточных процессов, включая перестройку цитоскелета, апоптоз и сигнальный путь киназы MAP. Было обнаружено, что белок, кодируемый этим геном, взаимодействует с рецептором андрогена (AR), который является зависимым от стероидных гормонов фактором транскрипции, который важен для половой дифференциации и развития мужчин. Было обнаружено, что ген протеинкиназы 6, активированной p21, высоко экспрессируется в тканях семенников и предстательной железы, и было показано, что кодируемый белок котранслируется в ядро ​​с AR в ответ на андроген.[6]

Генетическая делеция только PAK6 у мышей приводит к увеличению массы тела.[11] Однако делеция PAK6 вместе с PAK5 ухудшает способность животных учиться и двигаться.[11][12] Экспрессия PAK6 повышена в модели повреждения спинного мозга у крыс.[13] PAK6 также считается геном-кандидатом эпилептической энцефалопатии,[14] и взаимодействует с ассоциированным с Паркинсоном продуктом гена, богатым лейцином, повторяющейся киназой 2.[15] Было обнаружено, что экспрессия PAK6 сверхэкспрессируется при раке простаты,[16][17] гепатоцеллюлярная карцинома,[18] и рак толстой кишки.[19] Уровни PAK6 хорошо коррелируют с терапевтической устойчивостью к 5-флуроурацилу,[19] доцетаксел,[17] и радиация.[20]

Регуляторы и взаимодействующие

Активность киназы PAK6 положительно регулируется рецептором андрогенов,[7][21] p38MAPK,[22] 5-фторурацил[19] и атипичная ГТФаза Chp / RhoV семейства Rho.[23] Экспрессия PAK6 негативно регулируется miR-328, miR-429 и miR-23a.[24][25][26] PAK6 взаимодействует с соединительным белком IQGAP1,[27][28] E3 лигаза Mdm2,[29] и киназа 2 с высоким содержанием лейцина (LRRK2).[15]

Взаимодействия

PAK6 был показан взаимодействовать с Рецептор андрогенов.[5][7]

Примечания

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000137843 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000074923 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Ян Ф, Ли Х, Шарма М, Зарнегар М, Лим Б., Сан Зи (май 2001 г.). «Рецептор андрогенов специфически взаимодействует с новой активированной p21 киназой, PAK6». Журнал биологической химии. 276 (18): 15345–53. Дои:10.1074 / jbc.M010311200. PMID  11278661.
  6. ^ а б "Ген Entrez: киназа 6, активированная PAK6 p21 (CDKN1A)".
  7. ^ а б c d Ли С.Р., Рамос С.М., Ко А., Масиелло Д., Суонсон К.Д., Лу М.Л., Балк С.П. (январь 2002 г.). «Взаимодействие AR и ER с p21-активируемой киназой (PAK6)». Молекулярная эндокринология. 16 (1): 85–99. Дои:10.1210 / исправление.16.1.0753. PMID  11773441.
  8. ^ Кумар А., Молли П.Р., Пакала С.Б., Буй Нгуен TM, Раяла С.К., Кумар Р. (июль 2009 г.). «Нить ПАК от амебы к млекопитающим». Журнал клеточной биохимии. 107 (4): 579–85. Дои:10.1002 / jcb.22159. ЧВК  2718766. PMID  19350548.
  9. ^ Кумар Р., Ли Д.К. (2016). PAKs в прогрессировании рака человека: от начала до терапии рака к будущей онкобиологии. Достижения в исследованиях рака. 130. С. 137–209. Дои:10.1016 / bs.acr.2016.01.002. ISBN  9780128047897. PMID  27037753.
  10. ^ Шао Ю.Г., Нин К., Ли Ф. (январь 2016 г.). «P21-активированные киназы группы II как терапевтические мишени при раке желудочно-кишечного тракта». Всемирный журнал гастроэнтерологии. 22 (3): 1224–35. Дои:10.3748 / wjg.v22.i3.1224. ЧВК  4716033. PMID  26811660.
  11. ^ а б Фурнари М.А., Джобс М.Л., Некрасова Т., Минден А., Вагнер Г.К. (2013). «Функциональный дефицит у мышей с нокаутом PAK5, PAK6 и PAK5 / PAK6». PLOS ONE. 8 (4): e61321. Дои:10.1371 / journal.pone.0061321. ЧВК  3620390. PMID  23593460.
  12. ^ Некрасова Т., Джобс М.Л., Тинг Дж.Х., Вагнер Г.К., Минден А. (октябрь 2008 г.). «Целенаправленное нарушение генов Pak5 и Pak6 у мышей приводит к дефициту обучения и передвижения». Биология развития. 322 (1): 95–108. Дои:10.1016 / j.ydbio.2008.07.006. PMID  18675265.
  13. ^ Чжао В., Ян Дж., Ши В., Ву Х, Шао Б., Ву К., Чен Дж., Ни Л. (июнь 2011 г.). «Повышение уровня p21-активированной киназы 6 в коре головного мозга крыс после черепно-мозговой травмы». Журнал молекулярной гистологии. 42 (3): 195–203. Дои:10.1007 / s10735-011-9324-8. PMID  21541790.
  14. ^ Оливер К.Л., Лукич В., Фрейтаг С., Шеффер И.Е., Беркович С.Ф., Бахло М. (февраль 2016 г.). «Приоритизация in silico на основе коэкспрессии может помочь в открытии гена эпилептической энцефалопатии». Неврология. Генетика. 2 (1): e51. Дои:10.1212 / NXG.0000000000000051. ЧВК  4817907. PMID  27066588.
  15. ^ а б Civiero L, Cirnaru MD, Beilina A, Rodella U, Russo I, Belluzzi E, Lobbestael E, Reyniers L, Hondhamuni G, Lewis PA, Van den Haute C, Baekelandt V, Bandopadhyay R, Bubacco L, Piccoli G, Cookson MR, Тайманс Дж. М., Греджио Э. (декабрь 2015 г.). «Богатая лейцином повторная киназа 2 взаимодействует с p21-активированной киназой 6, чтобы контролировать сложность нейритов в головном мозге млекопитающих». Журнал нейрохимии. 135 (6): 1242–56. Дои:10.1111 / jnc.13369. ЧВК  4715492. PMID  26375402.
  16. ^ Каур Р., Юань Х, Лу М.Л., Балк С.П. (октябрь 2008 г.). «Повышенная экспрессия PAK6 при раке простаты и идентификация белков, связанных с PAK6». Простаты. 68 (14): 1510–6. Дои:10.1002 / pros.20787. PMID  18642328.
  17. ^ а б Вэнь Х, Ли Х, Ляо Б., Лю И, Ву Дж, Юань Х, Оуян Б., Сунь Ц., Гао Х (июнь 2009 г.). «Нокдаун p21-активированной киназы 6 подавляет рост рака простаты и повышает химиочувствительность к доцетакселу». Урология. 73 (6): 1407–11. Дои:10.1016 / j.urology.2008.09.041. PMID  19362342.
  18. ^ Чен Х, Мяо Дж, Ли Х, Ван С, Ли Дж, Чжу И, Ван Дж, Ву Х, Цяо Х (июнь 2014 г.). «Экспрессия и прогностическое значение p21-активированной киназы 6 в гепатоцеллюлярной карциноме». Журнал хирургических исследований. 189 (1): 81–8. Дои:10.1016 / j.jss.2014.01.049. PMID  24576777.
  19. ^ а б c Chen J, Lu H, Yan D, Cui F, Wang X, Yu F, Xue Y, Feng X, Wang J, Wang X, Jiang T, Zhang M, Zhao S, Yu Y, Tang H, Peng Z (январь 2015 г.) ). «PAK6 увеличивает химиорезистентность и является прогностическим маркером для пациентов со стадией II и III рака толстой кишки, проходящих химиотерапию на основе 5-FU». Oncotarget. 6 (1): 355–67. Дои:10.18632 / oncotarget.2803. ЧВК  4381600. PMID  25426562.
  20. ^ Чжан М., Седов М., Сайя Г., Чакраварти А. (июнь 2010 г.). «Ингибирование активированной p21 киназы 6 (PAK6) увеличивает радиочувствительность клеток рака простаты». Простаты. 70 (8): 807–16. Дои:10.1002 / pros.21114. ЧВК  2860659. PMID  20054820.
  21. ^ Лю Х, Басби Дж., Джон К., Вэй Дж., Юань Х, Лу М.Л. (10 октября 2013 г.). «Прямое взаимодействие между AR и PAK6 при активации PAK6, стимулированной андрогенами». PLOS ONE. 8 (10): e77367. Дои:10.1371 / journal.pone.0077367. ЧВК  3795072. PMID  24130878.
  22. ^ Каур Р., Лю Х, Джоэруп О, Чжан А., Юань Х, Балк С.П., Шнайдер М.К., Лу М.Л. (февраль 2005 г.). «Активация p21-активированной киназы 6 MAP-киназой 6 и p38 MAP-киназой». Журнал биологической химии. 280 (5): 3323–30. Дои:10.1074 / jbc.M406701200. PMID  15550393.
  23. ^ Шепелев М.В., Коробко И.В. (январь 2012 г.). «Протеинкиназа Pak6 представляет собой новый эффектор атипичной ГТФазы семейства Rho Chp / RhoV». Биохимия. Биохимия. 77 (1): 26–32. Дои:10.1134 / S0006297912010038. PMID  22339630.
  24. ^ Лю Ц., Чжан Л., Хуан И, Лю К., Тао Т., Чен С., Чжан Х, Гуань Х, Чен М., Сюй Б. (ноябрь 2015 г.). «MicroRNA ‑ 328 непосредственно нацелена на активированную p21 протеинкиназу 6, ингибируя пролиферацию рака простаты и повышая чувствительность к доцетакселу». Отчеты по молекулярной медицине. 12 (5): 7389–95. Дои:10.3892 / mmr.2015.4390. ЧВК  4626198. PMID  26459798.
  25. ^ Тянь X, Вэй З, Ван Дж, Лю П, Цинь И, Чжун М. (август 2015 г.). «MicroRNA-429 ингибирует миграцию и инвазию клеток рака толстой кишки, воздействуя на передачу сигналов PAK6 / cofilin». Отчеты онкологии. 34 (2): 707–14. Дои:10.3892 / или 2015.4039. PMID  26058485.
  26. ^ Cai S, Chen R, Li X, Cai Y, Ye Z, Li S, Li J, Huang H, Peng S, Wang J, Tao Y, Huang H, Wen X, Mo J, Deng Z, Wang J, Zhang Y , Гао X, Вэнь Х (февраль 2015 г.). «Подавление микроРНК-23a подавляет метастазирование рака простаты за счет воздействия на сигнальный путь PAK6-LIMK1». Oncotarget. 6 (6): 3904–17. Дои:10.18632 / oncotarget.2880. ЧВК  4414162. PMID  25714010.
  27. ^ Fram S, King H, Sacks DB, Wells CM (июль 2014 г.). «Комплекс PAK6-IQGAP1 способствует разборке межклеточных адгезий». Клеточные и молекулярные науки о жизни. 71 (14): 2759–73. Дои:10.1007 / s00018-013-1528-5. ЧВК  4059965. PMID  24352566.
  28. ^ Морс Э.М., Сан X, Ольбердинг-младший, Ха БХ, Боггон Т.Дж., Колдервуд Д.А. (январь 2016 г.). «PAK6 нацелен на межклеточные адгезии через свой N-конец Cdc42-зависимым образом, чтобы управлять бегством эпителиальных колоний». Журнал клеточной науки. 129 (2): 380–93. Дои:10.1242 / jcs.177493. ЧВК  4732285. PMID  26598554.
  29. ^ Лю Т., Ли И, Гу Х, Чжу Г., Ли Дж, Цао Л., Ли Ф (февраль 2013 г.). «p21-Активированная киназа 6 (PAK6) ингибирует рост рака простаты посредством фосфорилирования рецептора андрогена и канцерогенной E3-лигазы мышиной двойной минуты-2 (Mdm2)». Журнал биологической химии. 288 (5): 3359–69. Дои:10.1074 / jbc.M112.384289. ЧВК  3561555. PMID  23132866.