PCSK6 - PCSK6

PCSK6
Идентификаторы
ПсевдонимыPCSK6, PACE4, SPC4, пропротеинконвертаза субтилизин / кексин типа 6
Внешние идентификаторыOMIM: 167405 MGI: 102897 ГомолоГен: 20569 Генные карты: PCSK6
Расположение гена (человек)
Хромосома 15 (человек)
Chr.Хромосома 15 (человек)[1]
Хромосома 15 (человек)
Геномное расположение PCSK6
Геномное расположение PCSK6
Группа15q26.3Начните101,297,142 бп[1]
Конец101,525,202 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PCSK6 211263 s в формате fs.png

PBB GE PCSK6 207414 s на fs.png

PBB GE PCSK6 211262 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001291184
NM_011048

RefSeq (белок)

н / д

Расположение (UCSC)Chr 15: 101,3 - 101,53 МбChr 7: 65.86 - 66.05 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Пропротеин конвертаза субтилизин / кексин типа 6 является протеаза что у людей кодируется PCSK6 ген который расположен в хромосоме 15.[5][6] Pcsk6 представляет собой кальций-зависимую сериновую эндопротеазу, которая катализирует посттрансляционную модификацию белков-предшественников из его «латентной» формы в расщепленную «активную» форму.[5] Сообщалось, что активный Pcsk6 обрабатывает субстраты, такие как трансформирующий фактор роста β,[7] проальбумин,[8] фактор фон Виллебранда,[9] и корин.[10] Клинически предполагается, что Pcsk6 играет роль в асимметрии слева / справа,[11] структурная асимметрия головного мозга,[12] ручность[13][14][15] прогрессирование опухоли,[16] гемостаз,[9][8][7] и сердечно-сосудистые заболевания.[10][17]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к субтилизин -любить пропротеин конвертаза семья. Члены этого семейства представляют собой пропротеин-конвертазы, которые превращают латентные белки-предшественники в их биологически активные продукты. Этот кодируемый белок представляет собой кальций -зависимый серин эндопротеаза которые могут расщеплять белок-предшественник на своих парных сайтах процессинга основных аминокислот. Некоторые из его субстратов - трансформирующий фактор роста бета родственные белки,[7] проальбумин,[8] фактор фон Виллебранда,[9] и корин.[10] Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы.[6]

Клиническое значение

Во время разработки: На протяжении всего развития пространственная и временная экспрессия pcsk6 регулирует эмбриогенез путем активации факторов дифференцировки, связанных с TGFβ, которые включают BMP и Nodal.[7][18] Повышенные уровни Pcsk6 были обнаружены в материнских децидуальных клетках в месте имплантации и внеэмбриональных клетках. эктодерма.[19] Регулирование правильного градиента Nodal и BMP имеет решающее значение для гаструляции,[20] проксимально-дистальная ось,[21] и установление паттерна левой-правой оси.[22]

Исследования с нокаутом Pcsk6 показали, что у эмбрионов мышей, лишенных Pcsk6, развиваются гетеротаксия, изомерия левого легкого и / или краниофациальные мальформации из-за нарушения спецификации передне-задней и левой-правой оси, что является результатом дисрегуляции передачи сигналов Nodal и BMP.[11]

У человека полиморфизм VNTR Pcsk6 связан со структурной асимметрией лобной и височной доли,[12] и степень руки.[13][14]

Сердечно-сосудистые заболевания: Pcsk6 вызывает все больший интерес как индикатор и фактор сердечно-сосудистых заболеваний. Было показано, что у мышей Pcsk6 KO развивается чувствительная к соли гипертензия из-за неспособности активации прокорина, критически важной для регуляции артериального давления предсердным натрийуретическим пептидом.[10] У пациента с артериальной гипертензией была обнаружена мутация G / A в гене PCSK6, которая привела к замене Asp282Asn (D282N) в каталитическом домене Pcsk6, что, в свою очередь, препятствует процессингу корина.[10] При ремоделировании сосудов было обнаружено, что Pcsk6 индуцирует миграцию гладкомышечных клеток в ответ на PDGFB путем активации MMP14.[17] Когда Pcsk6 был нокаутирован, реакция гиперплазии интимы на in vivo Перевязка сонной артерии была снижена.[17]

Другой: Считается, что этот ген играет роль в прогрессировании опухоли.[6][16]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000140479 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030513 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б КИФЕР, МАЙКЛ С .; ТАКЕР, ДЖЕФФРИ Э .; ЙОХ, РИЧАРД; LANDSBERG, KATHERINE E .; САЛТМАН, ДЭВИД; БАРР, ФИЛИП Дж. (Декабрь 1991 г.). «Идентификация второго гена субтилизин-подобной протеазы человека в области fes / fps хромосомы 15». ДНК и клеточная биология. 10 (10): 757–769. Дои:10.1089 / dna.1991.10.757. ISSN  1044-5498. PMID  1741956.
  6. ^ а б c "Ген Entrez: пропротеин конвертаза PCSK6 субтилизин / кексин типа 6".
  7. ^ а б c d Констам, Дэниел Б. (август 2014 г.). «Регулирование TGFβ и связанных сигналов посредством обработки предшественников». Семинары по клеточной биологии и биологии развития. 32: 85–97. Дои:10.1016 / j.semcdb.2014.01.008. ISSN  1084-9521. PMID  24508081.
  8. ^ а б c Мори, К .; Имамаки, А .; Nagata, K .; Yonetomi, Y .; Kiyokage-Yoshimoto, R .; Мартин, Т. Дж .; Gillespie, M.T .; Nagahama, M .; Tsuji, A .; Мацуда, Ю. (1999-03-01). «Субтилизинподобные пропротеинконвертазы, PACE4 и PC8, а также фурин являются эндогенными проальбуминконвертазами в клетках HepG2». Журнал биохимии. 125 (3): 627–633. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022329. ISSN  0021-924X. PMID  10050053.
  9. ^ а б c Рехемтулла, Альнаваз; Барр, Филип Дж .; Родс, Кристофер Дж .; Кауфман, Рэндал Дж. (26 января 1993 г.). «PACE4 является членом семейства пропептидаз млекопитающих, которое имеет перекрывающуюся, но не идентичную субстратной специфичности с PACE». Биохимия. 32 (43): 11586–11590. Дои:10.1021 / bi00094a015. ISSN  0006-2960. PMID  8218226.
  10. ^ а б c d е Чен, Шэнхань; Цао, Пэнсю; Дун, Нинчжэн; Пэн, Цзяньхао; Чжан, Чуньи; Ван, Хао; Чжоу, Тяньтянь; Ян, Цзюньхуа; Чжан, Юэ; Мартелли, Элизабет Э; Нага Прасад, Сатьямангла V (10 августа 2015 г.). «Активация корина, опосредованная PCSK6, необходима для нормального кровяного давления». Природа Медицина. 21 (9): 1048–1053. Дои:10,1038 / нм. 3920. ISSN  1078-8956. ЧВК  4710517. PMID  26259032.
  11. ^ а б Constam, D. B .; Робертсон, Э. Дж. (1 мая 2000 г.). «SPC4 / PACE4 регулирует сигнальную сеть TGFbeta во время формирования оси». Гены и развитие. 14 (9): 1146–1155. ISSN  0890-9369. ЧВК  316583. PMID  10809672.
  12. ^ а б Беррец, Геса; Арнинг, Лариса; Гердинг, Ванда М .; Фридрих, Патрик; Франц, Кристоф; Шлютер, Кэролайн; Epplen, Jörg T .; Гюнтюркюн, Онур; Бесте, Кристиан; Генч, Эрхан; Окленбург, Себастьян (21.05.2019). «Структурная асимметрия во фронтальной и височной долях связана с полиморфизмом PCSK6 VNTR». Молекулярная нейробиология. 56 (11): 7765–7773. Дои:10.1007 / s12035-019-01646-1. ISSN  0893-7648. PMID  31115778. S2CID  160009569.
  13. ^ а б Робинсон, Келси Дж .; Херд, Питер Л .; Читай, Сильвен; Креспи, Бернард Дж. (Апрель 2016 г.). «Ген PCSK6 связан с маневренностью, спектром аутизма и магическими идеями в неклинической популяции». Нейропсихология. 84: 205–212. Дои:10.1016 / j.neuropsychologia.2016.02.020. ISSN  0028-3932. PMID  26921480. S2CID  6142024.
  14. ^ а б Арнинг, Лариса; Окленбург, Себастьян; Шульц, Стефани; Несс, Ванесса; Гердинг, Ванда М .; Hengstler, Jan G .; Фалькенштейн, Майкл; Epplen, Jörg T .; Гюнтюркюн, Онур; Бесте, Кристиан (27.06.2013). «Полиморфизм PCSK6 VNTR связан со степенью руки, но не с направлением руки». PLOS ONE. 8 (6): e67251. Bibcode:2013PLoSO ... 867251A. Дои:10.1371 / journal.pone.0067251. ISSN  1932-6203. ЧВК  3695088. PMID  23826248.
  15. ^ Scerri, Thomas S .; Брандлер, Уильям М .; Параккини, Сильвия; Моррис, Эндрю П .; Кольцо, Сьюзен М .; Ричардсон, Алекс Дж .; Талкотт, Джоэл Б.; Штейн, Джон; Монако, Энтони П. (04.11.2010). «PCSK6 связан с рукопожатием у людей с дислексией». Молекулярная генетика человека. 20 (3): 608–614. Дои:10,1093 / hmg / ddq475. ISSN  1460-2083. ЧВК  3016905. PMID  21051773.
  16. ^ а б Bassi, Daniel E .; Махлооги, Хале; Кляйн-Сзанто, Андрес Дж. П. (2000). «Proprotein Convertases Furin и PACE4 играют значительную роль в прогрессировании опухолей». Молекулярный канцерогенез. 28 (2): 63–69. Дои:10.1002 / 1098-2744 (200006) 28: 2 <63 :: aid-mc1> 3.0.co; 2-с. ISSN  0899-1987. PMID  10900462.
  17. ^ а б c Рыкачевска, Уршула; Suur, Bianca E .; Рель, Самуэль; Разуваев, Антон; Ленгквист, Мариетта; Сабатер-Ллеаль, Мария; van der Laan, Sander W .; Миллер, Клинт Л .; Wirka, Роберт C .; Кронквист, Малин; Гонсалес Диез, Мария (28 февраля 2020 г.). «PCSK6 - ключевая протеаза в контроле функции гладкомышечных клеток при ремоделировании сосудов». Циркуляционные исследования. 126 (5): 571–585. Дои:10.1161 / circresaha.119.316063. ISSN  0009-7330. PMID  31893970. S2CID  209539709.
  18. ^ Constam, Daniel B .; Робертсон, Элизабет Дж. (1999-01-11). «Регуляция костной морфогенетической белковой активности с помощью про-доменов и пропротеинконвертаз». Журнал клеточной биологии. 144 (1): 139–149. Дои:10.1083 / jcb.144.1.139. ISSN  0021-9525. ЧВК  2148113. PMID  9885250.
  19. ^ Констам, Д. Б.; Калфон, М; Робертсон, EJ (1996-07-01). «SPC4, SPC6 и новая протеаза SPC7 коэкспрессируются с костными морфогенетическими белками в разных местах во время эмбриогенеза». Журнал клеточной биологии. 134 (1): 181–191. Дои:10.1083 / jcb.134.1.181. ISSN  0021-9525. ЧВК  2120924. PMID  8698813.
  20. ^ Меснард, Д. (25 мая 2006 г.). «Nodal определяет эмбриональную висцеральную энтодерму и поддерживает плюрипотентные клетки в эпибласте до явного формирования осевого паттерна». Развитие. 133 (13): 2497–505. Дои:10.1242 / dev.02413. ISSN  0950-1991. PMID  16728477.
  21. ^ Арнольд, Себастьян Дж .; Робертсон, Элизабет Дж. (2008-01-08). «Взяв на себя обязательство: распределение клеточных клонов и формирование осевого паттерна в раннем эмбрионе мыши». Обзоры природы Молекулярная клеточная биология. 10 (2): 91–103. Дои:10.1038 / nrm2618. ISSN  1471-0072. PMID  19129791. S2CID  94174.
  22. ^ Бреннан, Дж. (15 сентября 2002 г.). «Узловая активность в узле регулирует лево-правую асимметрию». Гены и развитие. 16 (18): 2339–2344. Дои:10.1101 / gad.1016202. ISSN  0890-9369. ЧВК  187443. PMID  12231623.

дальнейшее чтение