PDE4D - PDE4D

PDE4D
Белок PDE4D PDB 1mkd.png
Доступные конструкции
PDBHuman UniProt search: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPDE4D, ACRDYS2, DPDE3, HSPDE43, PDE4DN2, STRK1, фосфодиэстераза 4D
Внешние идентификаторыOMIM: 600129 ГомолоГен: 129755 Генные карты: PDE4D
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение PDE4D
Геномное расположение PDE4D
Группа5q11.2-q12.1Начинать58,969,038 бп[1]
Конец60,522,120 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PDE4D 210836 x at fs.png

PBB GE PDE4D 211840 s в формате fs.png

PBB GE PDE4D 210837 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

н / д

RefSeq (белок)

н / д

Расположение (UCSC)Chr 5: 58.97 - 60.52 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

цАМФ-специфическая 3 ', 5'-циклическая фосфодиэстераза 4D является фермент что у людей кодируется PDE4D ген.

Функция

Ген PDE4D сложен и имеет по крайней мере 9 различных изоформ, кодирующих функциональные белки. Эти белки расщепляют второй мессенджер цАМФ, который является ключевой молекулой передачи сигнала во многих типах клеток, включая клетки сосудов (Dominiczak and McBride, 2003). [Предоставлено OMIM][3]

Взаимодействия

PDE4D показал себя взаимодействовать с миомегалин[4] и GNB2L1.[5][6]

Клиническая значимость

Мутации в этом гене были связаны со случаями акродизостоз.[7]

Это подтип PDE4, который, по-видимому, участвует в рвотный и антидепрессант эффекты Ингибиторы ФДЭ4.[8]

Кроме того, изменения в экспрессии изоформы PDE4D7 были предложены в качестве биомаркера рака простаты. [9][10][11]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113448 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ «Ген Entrez: PDE4D фосфодиэстераза 4D, цАМФ-специфическая (гомолог фосфодиэстеразы E3 dunce, Drosophila)».
  4. ^ Verde I, Pahlke G, Salanova M, Zhang G, Wang S, Coletti D, Onuffer J, Jin SL, Conti M (апрель 2001 г.). «Миомегалин представляет собой новый белок гольджи / центросомы, который взаимодействует с циклической нуклеотидной фосфодиэстеразой». Журнал биологической химии. 276 (14): 11189–98. Дои:10.1074 / jbc.M006546200. PMID  11134006.
  5. ^ Ярвуд SJ, Стил MR, Шотландия G, Houslay MD, Bolger GB (май 1999). «Белок сигнального каркаса RACK1 избирательно взаимодействует с цАМФ-специфической изоформой фосфодиэстеразы PDE4D5». Журнал биологической химии. 274 (21): 14909–17. Дои:10.1074 / jbc.274.21.14909. PMID  10329691.
  6. ^ Стил М.Р., МакКахилл А., Томпсон Д.С., Маккензи К., Айзекс Н.В., Хауслей М.Д., Болджер, Великобритания (июль 2001 г.). «Идентификация поверхности бета-пропеллерного белка RACK1, которая взаимодействует с цАМФ-специфической фосфодиэстеразой PDE4D5». Сотовая связь. 13 (7): 507–13. Дои:10.1016 / S0898-6568 (01) 00167-X. PMID  11516626.
  7. ^ Мишо С., Ле Гофф С., Гольденберг А., Абхьянкар А., Кляйн С., Киннинг Е., Герро А. М., Флао П., Данкомб А., Баужат Г., Лионне С., Талассинос С., Ничке П., Казанова Д. Л., Ле Меррер М., Мюнних А., Кормье-Дэр V (апрель 2012 г.). «Секвенирование экзома определяет мутации PDE4D как еще одну причину акродизостоза». Американский журнал генетики человека. 90 (4): 740–5. Дои:10.1016 / j.ajhg.2012.03.003. ЧВК  3322219. PMID  22464250.
  8. ^ Чжан ХТ (2009). «Циклическая AMP-специфическая фосфодиэстераза-4 как мишень для разработки антидепрессантов». Текущий фармацевтический дизайн. 15 (14): 1688–98. Дои:10.2174/138161209788168092. PMID  19442182.
  9. ^ Böttcher R, Henderson DJ, Dulla K, van Strijp D, Waanders LF, Tevz G, Lehman ML, Merkle D, van Leenders GJ, Baillie GS, Jenster G, Houslay MD, Hoffmann R (ноябрь 2015 г.). «Экспрессия человеческой фосфодиэстеразы 4D7 (PDE4D7) повышается при TMPRSS2-ERG-положительном первичном раке простаты и независимо увеличивает риск послеоперационного прогрессирования заболевания». Британский журнал рака. 113 (10): 1502–11. Дои:10.1038 / bjc.2015.335. ЧВК  4815894. PMID  26575822.
  10. ^ Бёттчер Р., Дулла К., ван Страйп Д., Дитс Н., Верхоф Э. И., Бейли Г. С., ван Лендерс Г. Дж., Хауслей М. Д., Йенстер Г., Хоффманн Р. (октябрь 2016 г.). «Композиция изоформы PDE4D человека не регулируется при первичном раке простаты и свидетельствует о прогрессировании заболевания и развитии отдаленных метастазов». Oncotarget. 7 (43): 70669–70684. Дои:10.18632 / oncotarget.12204. ЧВК  5342582. PMID  27683107.
  11. ^ Хендерсон Д. Д., Бирн А., Дулла К., Дженстер Дж., Хоффманн Р., Бейли Г. С., Хуслей М. Д. (март 2014 г.). «Фосфодиэстераза-4D7 (PDE4D7) цАМФ подавляется в андроген-независимых клетках рака простаты и опосредует пролиферацию путем компартментализации цАМФ на плазматической мембране клеток рака простаты VCaP». Британский журнал рака. 110 (5): 1278–87. Дои:10.1038 / bjc.2014.22. ЧВК  3950871. PMID  24518597.

дальнейшее чтение