PINK1 - Википедия - PINK1

РОЗОВЫЙ1
Идентификаторы
ПсевдонимыРОЗОВЫЙ1, BRPK, PARK6, PTEN-индуцированная предполагаемая киназа 1, PTEN-индуцированная киназа 1
Внешние идентификаторыOMIM: 608309 MGI: 1916193 ГомолоГен: 32672 Генные карты: РОЗОВЫЙ1
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение PINK1
Геномное расположение PINK1
Группа1п36.12Начинать20,633,458 бп[1]
Конец20,651,511 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PINK1 209018 s в формате fs.png

PBB GE PINK1 209019 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_032409

NM_026880

RefSeq (белок)

NP_115785

NP_081156

Расположение (UCSC)Chr 1: 20.63 - 20.65 МбChr 4: 138,31 - 138,33 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

PTEN-индуцированная киназа 1 (РОЗОВЫЙ1) представляет собой митохондриальный серин / треонин-белок киназа закодировано РОЗОВЫЙ1 ген.[5][6]

Считается, что он защищает клетки от стресса. митохондриальный дисфункция. PINK1 активность вызывает Паркин белок связываться с деполяризованными митохондриями, чтобы вызвать аутофагия этих митохондрий.[7][8] PINK1 обрабатывается здоровыми митохондриями и высвобождается для запуска дифференцировки нейронов.[9] Мутации в этом гене вызывают одну форму аутосомно-рецессивного раннего начала. болезнь Паркинсона.[10]

Структура

PINK1 синтезируется как 63000 Да белок, который часто расщепляется PARL между остатками 103-аланина и 104-фенилаланина во фрагмент размером 53000 Да.[11] PINK1 содержит N-концевую последовательность митохондриальной локализации, предполагаемую трансмембранную последовательность, киназный домен Ser / Thr и С-концевую регуляторную последовательность. Было обнаружено, что белок локализуется на внешней мембране митохондрий, но также может быть обнаружен по всему цитозолю. Эксперименты предполагают, что домен киназы Ser / Thr обращен наружу в сторону цитозоля, указывая на возможную точку взаимодействия с паркином.[12]

Структура PINK1 была решена и показывает, как белок связывает и фосфорилирует свой субстрат убиквитин.[13]

Функция

PINK1 тесно связан с контролем качества митохондрий, выявляя поврежденные митохондрии и воздействуя на конкретные митохондрии для деградации. Здоровые митохондрии поддерживают мембранный потенциал, который можно использовать для импорта PINK1 во внутреннюю мембрану, где он расщепляется PARL и очищается от внешней мембраны. Сильно поврежденные митохондрии не имеют достаточного мембранного потенциала для импорта PINK1, который затем накапливается на внешней мембране. Затем PINK1 задействует паркин, чтобы воздействовать на поврежденные митохондрии для деградации через аутофагия.[14] Из-за присутствия PINK1 в цитоплазме было высказано предположение, что PINK1 функционирует как «разведчик», чтобы исследовать поврежденные митохондрии.[15]

PINK1 распознает поврежденные митохондрии. PINK1 накапливается на внешней мембране митохондрий и рекрутирует паркин. Путь PINK1 / parkin затем определяет митохондрии для деградации лизосомами.
Здоровые митохондрии могут импортировать PINK1, где он впоследствии расщепляется PARL. Это предотвращает любое накопление PINK1 и паркин не рекрутируется в митохондрии.

PINK1 также может контролировать качество митохондрий через деление митохондрий. В результате деления митохондрий образуется ряд дочерних митохондрий, часто с неравномерным распределением мембранного потенциала. Митохондрии с сильным и здоровым мембранным потенциалом с большей вероятностью подверглись слиянию, чем митохондрии с низким мембранным потенциалом. Нарушение пути деления митохондрий приводило к увеличению окисленных белков и снижению дыхания.[16] Без PINK1 паркин не может эффективно локализоваться в поврежденных митохондриях, в то время как чрезмерная экспрессия PINK1 заставляет паркин локализоваться даже в здоровых митохондриях.[17] Кроме того, мутации как в Drp1, факторе деления митохондрий, так и в PINK1 были фатальными для Дрозофила модели. Однако чрезмерная экспрессия Drp1 может спасти субъектов, дефицитных по PINK1 или паркину, предполагая, что деление митохондрий, инициированное Drp1, воссоздает те же эффекты пути PINK1 / паркин.[18]

Помимо деления митохондрий, PINK1 участвует в подвижности митохондрий. Накопление PINK1 и рекрутирование паркина нацелены на митохондрии для деградации, а PINK1 может служить для увеличения скорости деградации за счет остановки подвижности митохондрий. Сверхэкспрессия PINK1 вызывает эффекты, аналогичные подавлению Миро, белок, тесно связанный с миграцией митохондрий.[19]

Другой механизм контроля качества митохондрий может возникнуть через везикулы, происходящие из митохондрий. Окислительный стресс в митохондриях может производить потенциально вредные соединения, включая неправильно свернутые белки или активные формы кислорода. Было показано, что PINK1 способствует созданию везикул, происходящих из митохондрий, которые могут разделять активные формы кислорода и перемещать их к лизосомы на деградацию.[20]

Актуальность болезни

Болезнь Паркинсона часто характеризуется дегенерацией дофаминергических нейронов и связана с накоплением неправильно свернутых белков и Тела Леви. Было показано, что мутации в белке PINK1 приводят к накоплению таких неправильно свернутых белков в митохондриях как клеток мух, так и человека.[21] В частности, мутации в домене серин / треонинкиназы были обнаружены у ряда пациентов с болезнью Паркинсона, когда PINK1 не может защитить от вызванной стрессом митохондриальной дисфункции и апоптоза.[22]

Фармакологическая манипуляция

На сегодняшний день было немного сообщений о малых молекулах, активирующих PINK1, и об их перспективах в качестве потенциальных средств лечения болезни Паркинсона. Первый отчет появился в 2013 году, когда Кеван Шокат и его команда из UCSF идентифицировали азотистое основание, называемое кинетином, в качестве активатора PINK1.[23] Впоследствии другими было показано, что нуклеозидное производное кинетина, то есть кинетин рибозид, проявляет значительную активацию PINK1 в клетках.[24] Кроме того, монофосфатные пролекарства рибозида кинетина, ProTides, также показали активацию PINK1.[25] В декабре 2017 года никлозамид, антигельминтный препарат, был идентифицирован как мощный активатор PINK1 в клетках и нейронах.[26]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158828 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028756 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Unoki M, Nakamura Y (август 2001 г.). «Подавляющие рост эффекты BPOZ и EGR2, двух генов, участвующих в пути передачи сигналов PTEN». Онкоген. 20 (33): 4457–65. Дои:10.1038 / sj.onc.1204608. PMID  11494141.
  6. ^ Валенте Е.М., Салви С., Ялонго Т., Маронджиу Р., Элия А.Е., Капуто В., Ромито Л., Альбанезе А., Даллапиккола Б., Бентивольо АР (сентябрь 2004 г.). «Мутации PINK1 связаны со спорадическим ранним началом паркинсонизма». Энн Нейрол. 56 (3): 336–41. Дои:10.1002 / ana.20256. PMID  15349860.
  7. ^ Нарендра Д.П., Джин С.М., Танака А., Суен Д.Ф., Готье, Калифорния, Шен Дж., Куксон М.Р., Юле Р.Дж. (2010). «PINK1 избирательно стабилизируется на поврежденных митохондриях для активации паркина». PLOS Биология. 8 (1): e1000298. Дои:10.1371 / journal.pbio.1000298. ЧВК  2811155. PMID  20126261.
  8. ^ Лазару М., Нарендра Д.П., Джин С.М., Текле Э, Банерджи С., Юле Р.Дж. (2013). «PINK1 управляет самоассоциацией паркина и HECT-подобной активностью E3 перед связыванием митохондрий». Журнал клеточной биологии. 200 (2): 163–172. Дои:10.1083 / jcb.201210111. ЧВК  3549971. PMID  23319602.
  9. ^ Дагда Р.К., Пьен И., Ван Р., Чжу Дж., Ван КЗ, Каллио Дж., Банерджи Т.Д., Дагда Р.Й., Чу Коннектикут (2013). «За пределами митохондрии: цитозольный PINK1 ремоделирует дендриты с помощью протеинкиназы A». J Neurochem. 128 (6): 864–877. Дои:10.1111 / jnc.12494. ЧВК  3951661. PMID  24151868.
  10. ^ "Ген Entrez: PINK1 PTEN индуцированная предполагаемая киназа 1".
  11. ^ Деас Э., Плун-Фавро Х., Ганди С., Десмонд Х., Кьяр С., Ло С.Х., Рентон А.Э., Харви Р.Дж., Уитворт А.Дж., Мартинс Л.М., Абрамов А.Ю., Вуд Н.В. (2011). «Расщепление PINK1 в положении A103 митохондриальной протеазой PARL». Гм. Мол. Genet. 20 (5): 867–869. Дои:10,1093 / hmg / ddq526. ЧВК  3033179. PMID  21138942.
  12. ^ Спрингер В., Кале П. Дж. (Март 2011 г.). "Регуляция митофагии, опосредованной PINK1-паркин". Аутофагия. 7 (3): 266–78. Дои:10.4161 / авто.7.3.14348. PMID  21187721.
  13. ^ Шуберт, Александр Ф .; Гладкова, Кристина; Простите, Элс; Wagstaff, Jane L .; Freund, Stefan M. V .; Steyaert, Ян; Маслен, Сара Л .; Командер, Дэвид (30.10.2017). «Структура PINK1 в комплексе с его субстратом убиквитином». Природа. 552 (7683): 51–56. Bibcode:2017Натура.552 ... 51S. Дои:10.1038 / природа24645. ISSN  1476-4687. ЧВК  6020998. PMID  29160309.
  14. ^ Юле Р.Дж., ван дер Блик AM (2012). «Митохондриальное деление, слияние и стресс». Наука. 337 (6098): 1062–1065. Bibcode:2012Научный ... 337.1062Y. Дои:10.1126 / наука.1219855. ЧВК  4762028. PMID  22936770.
  15. ^ Нарендра Д., Уокер Дж. Э., Юл Р. (2012). «Контроль качества митохондрий, опосредованный PINK1 и Паркин: ссылки на паркинсонизм». Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии. 4 (11): a011338. Дои:10.1101 / cshperspect.a011338. ЧВК  3536340. PMID  23125018.
  16. ^ Twig G, Elorza A, Molina AJ, Mohamed H, Wikstrom JD, Walzer G, Stiles L, Haigh SE, Katz S, Las G, Alroy J, Wu M, Py BF, Yuan J, Deeney JT, Corkey BE, Shirihai OS (2008). «Деление и селективное слияние регулируют сегрегацию и удаление митохондрий путем аутофагии». Журнал EMBO. 27 (2): 433–446. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601963. ЧВК  2234339. PMID  18200046.
  17. ^ Vives-Bauza C, Zhou C, Huang Y, Cui M, de Vries RL, Kim J, May J, Tocilescu MA, Liu W, Ko HS, Magrané J, Moore DJ, Dawson VL, Grailhe R, Dawson TM, Li C , Тиеу К., Прзедборски С. (2010). «PINK1-зависимое рекрутирование паркина в митохондрии в митофагии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 107 (1): 378–83. Bibcode:2010ПНАС..107..378В. Дои:10.1073 / pnas.0911187107. ЧВК  2806779. PMID  19966284.
  18. ^ Пул А.С., Томас Р.Э., Эндрюс Л.А., МакБрайд Н.М., Уитворт А.Дж., Палланк Л.Дж. (2008). «Путь PINK1 / Parkin регулирует митохондриальную митофагию». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 105 (5): 1638–43. Дои:10.1073 / pnas.0709336105. ЧВК  2234197. PMID  18230723.
  19. ^ Лю С., Савада Т., Ли С., Ю В., Сильверио Дж., Алапатт П., Миллан И., Шен А., Сакстон В., Канао Т., Такахаши Р., Хаттори Н., Имаи Ю., Лу Б. (2012). «Киназа PINK1, связанная с болезнью Паркинсона, регулирует уровень белка Miro и аксональный транспорт митохондрий». PLoS Genetics. 8 (3): e102537. Дои:10.1371 / journal.pgen.1002537. ЧВК  3291531. PMID  22396657.
  20. ^ McLelland GL, Soubannier V, Chen CX, McBride HM, Fon EA (2014). «Паркин и РОЗОВЫЙ 1 функционируют в пути везикулярного переноса, регулируя контроль качества митохондрий». Журнал EMBO. 33 (4): 282–295. Дои:10.1002 / embj.201385902. ЧВК  3989637. PMID  24446486.
  21. ^ Пимента де Кастро I, Коста А.С., Лам Д., Туфи Р., Феделе В., Мойсой Н., Динсдейл Д., Деас Э., Ло С.Х., Мартинс Л.М. (2012). «Генетический анализ неправильного сворачивания митохондриальных белков у Drosophila melanogaster». Гибель клеток и дифференциация. 19 (8): 1308–16. Дои:10.1038 / cdd.2012.5. ЧВК  3392634. PMID  22301916.
  22. ^ Валенте Е.М., Абу-Слейман П.М., Капуто В., Мукит М.М., Харви К., Гисперт С., Али З., Дель Турко Д., Бентивольо А.Р., Хили Д.Г., Альбанезе А., Нуссбаум Р., Гонсалес-Мальдонадо Р., Деллер Т., Сальви С., Кортелли П., Гилкс В.П., Латчман Д.С., Харви Р.Дж., Даллапиккола Б., Обургер Г., Вуд Н.В. (2004). «Наследственная болезнь Паркинсона с ранним началом, вызванная мутациями в PINK1». Наука. 304 (5674): 1158–60. Bibcode:2004Научный ... 304.1158V. Дои:10.1126 / science.1096284. PMID  15087508.
  23. ^ Герц Н.Т., Бертет А., Сос М.Л., Торн К.С., Бурлингейм А.Л., Накамура К., Шокат К.М. (2013). «Нео-субстрат, усиливающий каталитическую активность киназы PINK1, связанной с болезнью паркинсона». Клетка. 154 (4): 737–47. Дои:10.1016 / j.cell.2013.07.030. ЧВК  3950538. PMID  23953109.
  24. ^ Осгерби Л., Лай Ю.С., Торнтон П.Дж., Амальфитано Дж., Ле Дафф С.С., Джабин I, Кадри Х., Микколи А., Такер Дж. Х., Мукит М., Мехеллоу Y (2017). «Кинетин рибозид и его протеины активируют вызванную болезнью Паркинсона предполагаемую киназу 1, индуцированную PTEN (PINK1), независимо от митохондриальной деполяризации». J. Med. Chem. 60 (8): 3518–24. Дои:10.1021 / acs.jmedchem.6b01897. ЧВК  5410652. PMID  28323427.
  25. ^ Осгерби Л., Лай Ю.С., Торнтон П.Дж., Амальфитано Дж., Ле Дафф С.С., Джабин I, Кадри Х., Микколи А., Такер Дж. Х., Мукит М., Мехеллоу Y (2017). «Кинетин рибозид и его протеины активируют индуцированную PTEN предполагаемую киназу 1 (PINK1), вызванную болезнью Паркинсона, независимо от митохондриальной деполяризации». J. Med. Chem. 60 (8): 3518–24. Дои:10.1021 / acs.jmedchem.6b01897. ЧВК  5410652. PMID  28323427.
  26. ^ Барини Э., Микколи А., Тинарелли Ф., Малхоланд К., Кадри Х., Ханим Ф., Стояновски Л., Рид К. Д., Бернесс К., Блоу Дж. Дж., Мехеллоу Ю., Мукит М. (2017). «Антигельминтный препарат никлозамид и его аналоги активируют протеинкиназу PINK1, ассоциированную с болезнью Паркинсона». ChemBioChem. 19 (5): 425–429. Дои:10.1002 / cbic.201700500. ЧВК  5901409. PMID  29226533.

дальнейшее чтение


внешняя ссылка