PIN-домен - Википедия - PIN domain
| PIN-домен | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура домена PIN (PilT N-конец) (AF0591) из Archaeoglobus fulgidus с разрешением 1,90 Ангстрема. 1o4w | |||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||
| Символ | ШТЫРЬ | ||||||||||
| Pfam | PF01850 | ||||||||||
| ИнтерПро | IPR002716 | ||||||||||
| УМНАЯ | CBS | ||||||||||
| SCOP2 | 3dbo / Объем / СУПФАМ | ||||||||||
| CDD | cd09852 | ||||||||||
| |||||||||||
В молекулярной биологии PIN-домен это белковый домен это около 130 аминокислот в длину. PIN-домены функционируют как нуклеаза ферменты, которые расщепляют одноцепочечная РНК в зависимости от последовательности или структуры.[1][2]
PIN-домены содержат четыре почти инвариантных кислотных остатка.[2] Кристаллические структуры показывают, что эти остатки сгруппированы вместе в предполагаемых активный сайт. У эукариот PIN-домены обнаружены в белках, участвующих в бессмысленный распад мРНК, в белках, таких как SMG5 и SMG6, а при обработке 18S рибосомная РНК. Большинство белков PIN-домена, обнаруженных у прокариот, являются токсичными компонентами токсин-антитоксиновые опероны.[2] Эти локусы обеспечивают механизм контроля, который помогает свободноживущим прокариотам справляться со стрессом, связанным с питанием.[3]
Рекомендации
- ^ Аркус В.Л., Маккензи Дж.Л., Робсон Дж., Кук Г.М. (январь 2011 г.). «Рибонуклеазы PIN-домена и прокариотическая матрица токсин-антитоксин VapBC». Белковая инженерия, дизайн и выбор. 24 (1–2): 33–40. Дои:10.1093 / белок / gzq081. PMID 21036780.
- ^ а б c Matelska D, Steczkiewicz K, Ginalski K (июль 2017 г.). «Комплексная классификация суперсемейства ПИН-домена». Исследования нуклеиновых кислот. 45 (12): 6995–7020. Дои:10.1093 / нар / gkx494. ЧВК 5499597. PMID 28575517.
- ^ Гердес К., Кристенсен С.К., Лёбнер-Олесен А. (май 2005 г.). «Прокариотические токсин-антитоксиновые стрессовые реакции». Обзоры природы. Микробиология. 3 (5): 371–82. Дои:10.1038 / nrmicro1147. PMID 15864262. S2CID 13417307.