PLXNB1 - PLXNB1

PLXNB1
Белок PLXNB1 PDB 2JPH.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPLXNB1, ПЛЕКСИН-B1, PLXN5, SEP, плексин B1
Внешние идентификаторыOMIM: 601053 MGI: 2154238 ГомолоГен: 130508 Генные карты: PLXNB1
Расположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек)[1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное расположение PLXNB1
Геномное расположение PLXNB1
Группа3п21.31Начните48,403,854 бп[1]
Конец48,430,086 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PLXNB1 215668 s в формате fs.png

PBB GE PLXNB1 215807 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001130082
NM_002673

NM_172775

RefSeq (белок)

NP_001123554
NP_002664

NP_766363

Расположение (UCSC)Chr 3: 48,4 - 48,43 МбChr 9: 109.1 - 109.12 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Плексин B1 это белок из плексин семья, которая у людей кодируется PLXNB1 ген.[5][6][7]

Функция

В нервных тканях плексин семья служит трансмембранными рецепторами для Семафорины.[8] Вне нервных тканей Plexin B1 участвует в контроле миграции клеток.[9]

Взаимодействия

PLXNB1 был показан взаимодействовать с участием ARHGEF12,[10] Rnd1[11] и ARHGEF11.[10][11][12][13]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164050 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000053646 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Маэстрини Е., Таманьоне Л., Лонгати П., Кремона О., Гулисано М., Бион С., Таманини Ф., Нил Б. Г., Тониоло Д., Комольо П. М. (март 1996 г.). «Семейство трансмембранных белков, гомологичных рецептору фактора роста гепатоцитов МЕТ». Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (2): 674–8. Bibcode:1996ПНАС ... 93..674М. Дои:10.1073 / пнас.93.2.674. ЧВК  40111. PMID  8570614.
  6. ^ Vikis HG, Li W, He Z, Guan KL (ноябрь 2000 г.). «Рецептор семафорина плексин-B1 специфически взаимодействует с активным Rac лиганд-зависимым образом». Proc Natl Acad Sci U S A. 97 (23): 12457–62. Bibcode:2000PNAS ... 9712457V. Дои:10.1073 / pnas.220421797. ЧВК  18785. PMID  11035813.
  7. ^ "Entrez Gene: PLXNB1 плексин B1".
  8. ^ Driessens MH, Olivo C, Nagata K, Inagaki M, Collard JG (9 октября 2002 г.). «B-плексины активируют Rho через PDZ-RhoGEF». Письма FEBS. 529 (2–3): 168–72. Дои:10.1016 / s0014-5793 (02) 03323-9. PMID  12372594. S2CID  26525009.
  9. ^ Базиль Дж. Р., Афхами Т., Гуткинд Дж. С. (август 2005 г.). «Семафорин 4D / плексин-B1 индуцирует миграцию эндотелиальных клеток за счет активации PYK2, Src и пути фосфатидилинозитол-3-киназа-Akt». Молекулярная и клеточная биология. 25 (16): 6889–98. Дои:10.1128 / mcb.25.16.6889-6898.2005. ЧВК  1190270. PMID  16055703.
  10. ^ а б Хиротани М., Охока Ю., Ямамото Т., Нирасава Х., Фуруяма Т., Кого М., Мацуя Т., Инагаки С. (сентябрь 2002 г.). «Взаимодействие плексина-B1 с PDZ-доменом, содержащим факторы обмена генов гуаниновых нуклеотидов». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 297 (1): 32–7. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02122-8. PMID  12220504.
  11. ^ а б Ойнума И., Като Х., Харада А., Негиси М. (июль 2003 г.). «Прямое взаимодействие Rnd1 с Plexin-B1 регулирует PDZ-RhoGEF-опосредованную активацию Rho с помощью Plexin-B1 и индуцирует сокращение клеток в клетках COS-7». J. Biol. Chem. 278 (28): 25671–7. Дои:10.1074 / jbc.M303047200. PMID  12730235.
  12. ^ Перро В., Васкес-Прадо Дж., Гуткинд Дж. С. (ноябрь 2002 г.). «Плексин B регулирует Rho через факторы обмена гуаниновых нуклеотидов, связанные с лейкемией, Rho GEF (LARG) и PDZ-RhoGEF». J. Biol. Chem. 277 (45): 43115–20. Дои:10.1074 / jbc.M206005200. PMID  12183458.
  13. ^ Swiercz JM, Kuner R, Behrens J, Offermanns S (июль 2002 г.). «Plexin-B1 напрямую взаимодействует с PDZ-RhoGEF / LARG, чтобы регулировать RhoA и морфологию конуса роста». Нейрон. 35 (1): 51–63. Дои:10.1016 / S0896-6273 (02) 00750-X. PMID  12123608. S2CID  18981429.
  • Чаповал С.П., Хритцо М., Ци Х, Таманьон Л., Голдинг А. и Киган А.Д. «Семафорин 4А стабилизирует человеческий регуляторный Т-клеточный фенотип через плексин B1». ImmunoHorizons, 1 февраля 2019 г., 3 (2) 71-87; DOI: https://doi.org/10.4049/immunohorizons.1800026}}

дальнейшее чтение

внешние ссылки

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: O43157 (Plexin-B1) в PDBe-KB.