ARHGEF11 - ARHGEF11

ARHGEF11
Белок ARHGEF11 PDB 1htj.png
Доступные конструкции
PDBПоиск Human UniProt: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыARHGEF11, GTRAP48, PDZ-RHOGEF, Фактор обмена нуклеотидов гуанина 11
Внешние идентификаторыOMIM: 605708 MGI: 2441869 ГомолоГен: 11409 Генные карты: ARHGEF11
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение ARHGEF11
Геномное расположение ARHGEF11
Группа1q23.1Начните156,934,840 бп[1]
Конец157,045,370 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ARHGEF11 202913 в fs.png

PBB GE ARHGEF11 202914 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_014784
NM_198236
NM_001377418
NM_001377419

NM_001003912
NM_001360195
NM_001360197

RefSeq (белок)

NP_055599
NP_937879
NP_001364347
NP_001364348

н / д

Расположение (UCSC)Chr 1: 156.93 - 157.05 МбChr 3: 87,62 - 87,74 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор обмена нуклеотидов гуанина 11 это белок что у людей кодируется ARHGEF11 ген.[5][6][7] Этот белок также называют RhoGEF11 или PDZ-RhoGEF.

Функция

Фактор обмена нуклеотидов гуанина 11 равен фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (ГЭФ) для RhoA малая ГТФаза белок.[8] Ро - это малая ГТФаза белок, который неактивен при связывании с гуанин нуклеотид ВВП. Но при воздействии на него белков Rho GEF, таких как RhoGEF1, этот GDP высвобождается и заменяется GTP, что приводит к активному состоянию Rho. В этой активной, GTP-связанной конформации Rho может связываться и активировать специфические эффектор белки и ферменты регулировать клеточные функции.[9] В частности, активный Rho является основным регулятором клетки. актин цитоскелет.[9]

RhoGEF11 является членом группы из четырех белков RhoGEF, которые, как известно, активируются G-белковые рецепторы в сочетании с г12 и G13 гетеротримерные G-белки.[8] Остальные ARHGEF1 (также известный как p115-RhoGEF), ARHGEF12 (также известный как LARG) и AKAP13 (также известный как ARHGEF13 и Lbc). [10][11] Регулируемый GPCR RhoGEF11 (и эти родственные GEF белки) действует как эффектор для G12 и G13 G белки. Помимо активации G12 или G13 G, три из этих четырех белков RhoGEF (ARHGEF1 / 11/12) также функционируют как Семья РГО Белки, активирующие ГТФазу (GAP) для увеличения скорости гидролиза GTP G1213 альфа-белки (которые сами являются белками GTPase). Это действие увеличивает скорость дезактивации G-белка, ограничивая время, в течение которого эти RhoGEF активируют Rho.[12]

Были описаны два альтернативных транскрипта, кодирующие разные изоформы.[7]

Взаимодействия

ARHGEF11 было показано взаимодействовать с участием:

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000132694 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041977 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Рюменапп Ю., Бломквист А., Шверер Г., Шабловски Н., Псома А., Якобс К. Х. (октябрь 1999 г.). «Rho-специфическое связывание и катализ обмена гуаниновых нуклеотидов с помощью KIAA0380, члена семейства dbl». Письма FEBS. 459 (3): 313–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01270-3. PMID  10526156.
  6. ^ Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д., Охира М., Секи Н., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (апрель 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК исследования. 4 (2): 141–50. Дои:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID  9205841.
  7. ^ а б "Ген Entrez: ARHGEF11 Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) 11".
  8. ^ а б Фукухара С., Мурга С., Зохар М., Игиши Т., Гуткинд Дж. С. (февраль 1999 г.). «Новый PDZ-домен, содержащий фактор обмена гуаниновых нуклеотидов, связывает гетеротримерные G-белки с Rho». Журнал биологической химии. 274 (9): 5868–79. Дои:10.1074 / jbc.274.9.5868. PMID  10026210.
  9. ^ а б Thumkeo, D; Ватанабэ, S; Нарумия, С (октябрь – ноябрь 2013 г.). «Физиологические роли эффекторов Rho и Rho у млекопитающих». Европейский журнал клеточной биологии. 92 (10–11): 303–315. Дои:10.1016 / j.ejcb.2013.09.002. PMID  24183240.
  10. ^ Фукухара С., Чикуми Х., Гуткинд Дж. С. (2001). «RGS-содержащие RhoGEF: недостающее звено между трансформирующими G-белками и Rho?». Онкоген. 20 (13): 1661–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1204182. PMID  11313914.
  11. ^ Дивиани, Д; Содерлинг, Дж; Скотт, JD (ноябрь 2001 г.). «AKAP-Lbc закрепляет протеинкиназу А и зародыширует Galpha 12-селективное Rho-опосредованное образование стрессовых волокон». Журнал биологической химии. 276 (47): 44247–44257. Дои:10.1074 / jbc.M106629200. PMID  11546812.
  12. ^ Козаса Т. (2001). «Регулирование опосредованной G-белком передачи сигнала белками RGS». Life Sci. 68 (19–20): 2309–17. Дои:10.1016 / S0024-3205 (01) 01020-7. PMID  11358341.
  13. ^ а б Чен, Z; Певица, WD; Данеш С.М.; Стернвайс, ПК; Спранг, SR (октябрь 2008 г.). «Распознавание активированных состояний Galpha13 доменом rgRGS PDZRhoGEF». Структура. 16 (10): 1532–1543. Дои:10.1016 / j.str.2008.07.009. ЧВК  2586972. PMID  18940608.
  14. ^ а б c Перро В., Васкес-Прадо Дж., Гуткинд Дж. С. (ноябрь 2002 г.). «Плексин B регулирует Rho через факторы обмена гуаниновых нуклеотидов, связанные с лейкемией, Rho GEF (LARG) и PDZ-RhoGEF». Журнал биологической химии. 277 (45): 43115–20. Дои:10.1074 / jbc.M206005200. PMID  12183458.
  15. ^ а б Swiercz JM, Kuner R, Behrens J, Offermanns S (июль 2002 г.). «Plexin-B1 напрямую взаимодействует с PDZ-RhoGEF / LARG, чтобы регулировать RhoA и морфологию конуса роста». Нейрон. 35 (1): 51–63. Дои:10.1016 / S0896-6273 (02) 00750-X. PMID  12123608.
  16. ^ Ойнума И., Като Х., Харада А., Негиси М. (июль 2003 г.). «Прямое взаимодействие Rnd1 с Plexin-B1 регулирует PDZ-RhoGEF-опосредованную активацию Rho с помощью Plexin-B1 и индуцирует сокращение клеток в клетках COS-7». Журнал биологической химии. 278 (28): 25671–7. Дои:10.1074 / jbc.M303047200. PMID  12730235.
  17. ^ Хиротани М., Охока Ю., Ямамото Т., Нирасава Х., Фуруяма Т., Кого М., Мацуя Т., Инагаки С. (сентябрь 2002 г.). «Взаимодействие плексина-B1 с PDZ-доменом, содержащим факторы обмена генов гуаниновых нуклеотидов». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 297 (1): 32–7. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02122-8. PMID  12220504.

дальнейшее чтение

внешние ссылки