PPFIBP1 - PPFIBP1

PPFIBP1
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPPFIBP1, L2, SGT2, hSGT2, hSgt2p, PPFIA-связывающий белок 1
Внешние идентификаторыOMIM: 603141 MGI: 1914783 ГомолоГен: 2685 Генные карты: PPFIBP1
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение PPFIBP1
Геномное расположение PPFIBP1
Группа12п11.23-п11.22Начинать27,523,431 бп[1]
Конец27,695,564 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PPFIBP1 203735 x at fs.png

PBB GE PPFIBP1 214374 s при fs.png

PBB GE PPFIBP1 203736 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001198915
NM_001198916
NM_003622
NM_177444

NM_001170433
NM_026221
NM_001355728
NM_001355729

RefSeq (белок)

NP_001185844
NP_001185845
NP_003613
NP_803193

NP_001163904
NP_080497
NP_001342657
NP_001342658

Расположение (UCSC)Chr 12: 27,52 - 27,7 МбChr 6: 146,89 - 147,03 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Липрин-бета-1 это белок что у людей кодируется PPFIBP1 ген.[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков (липрин), взаимодействующих с тирозинфосфатазой LAR. Липрины взаимодействуют с членами семейства LAR трансмембранных протеинтирозинфосфатаз, которые, как известно, важны для управления аксонами и развития молочных желез. Было высказано предположение, что липрины представляют собой поливалентные белки, которые образуют сложные структуры и действуют как каркасы для рекрутирования и закрепления семейства LAR тирозинфосфатаз. Было обнаружено, что этот белок взаимодействует с S100A4, кальций-связывающим белком, связанным с инвазивностью опухоли и метастазированием. Эксперимент in vitro продемонстрировал, что взаимодействие ингибирует фосфорилирование этого белка протеинкиназой C и протеинкиназой CK2. Сообщалось об альтернативно сплайсированных вариантах транскриптов, кодирующих разные изоформы.[7]

Взаимодействия

PPFIBP1 показал себя взаимодействовать с липрин-альфа-1.[5]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000110841 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000016487 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Serra-Pages C, Medley QG, ​​Tang M, Hart A, Streuli M (июль 1998 г.). «Липрины, семейство белков, взаимодействующих с трансмембранной протеин-тирозинфосфатазой LAR». J Biol Chem. 273 (25): 15611–20. Дои:10.1074 / jbc.273.25.15611. PMID  9624153.
  6. ^ Кряевская М., Фишер-Ларсен М., Мёрц Э., Ворм О., Тульчинский Э., Григорян М., Амбарцумян Н., Луканидин Э. (февраль 2002 г.). «Липрин бета 1, член семейства LAR-трансмембранных белков, взаимодействующих с тирозинфосфатазой, является новой мишенью для белка S100A4, связанного с метастазами (Mts1)». J Biol Chem. 277 (7): 5229–35. Дои:10.1074 / jbc.M110976200. PMID  11836260.
  7. ^ а б «Ген Entrez: белок PPFIBP1, взаимодействующий с PTPRF, связывающий белок 1 (липрин бета 1)».

дальнейшее чтение