Липрин-альфа-1 - Liprin-alpha-1

PPFIA1
Доступные конструкции
PDBHuman UniProt search: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPPFIA1, LIP.1, LIP1, LIPRIN, PTPRF взаимодействующий белок альфа 1
Внешние идентификаторыOMIM: 611054 MGI: 1924750 ГомолоГен: 20802 Генные карты: PPFIA1
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение PPFIA1
Геномное расположение PPFIA1
Группа11q13.3Начните70,270,700 бп[1]
Конец70,385,312 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PPFIA1 202066 в формате fs.png

PBB GE PPFIA1 210235 s в формате fs.png

PBB GE PPFIA1 202065 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003626
NM_177423
NM_001378006

NM_001033319
NM_001195086

RefSeq (белок)

NP_003617
NP_803172
NP_001364935

н / д

Расположение (UCSC)Chr 11: 70.27 - 70.39 МбChr 7: 144,48 - 144,55 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Липрин-альфа-1 это белок что у людей кодируется PPFIA1 ген.[5][6][7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом LAR протеинтирозинфосфатаза -взаимодействующих белков (липринов) семейства. Липрины взаимодействуют с членами семейства LAR трансмембранных протеинтирозинфосфатаз, которые, как известно, важны для управления аксонами и развития молочных желез. Этот белок связывается с внутриклеточным мембранно-дистальным доменом фосфатазы тирозинфосфатазы LAR и, по-видимому, локализует LAR в очаговых адгезиях клеток. Это взаимодействие может регулировать разборку фокальной адгезии и, таким образом, помогать организовывать взаимодействия клетка-матрица. Описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы.[7]

Взаимодействия

Белковая тирозинфосфатаза, тип рецептора, полипептид f (PTPRF), взаимодействующий белок (липрин), альфа-1 взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000131626 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037519 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Серра-Пажес С., Кедерша Н.Л., Фазикас Л., Медли К., Дебант А., Штреули М. (август 1995 г.). «Трансмембранная протеинтирозинфосфатаза LAR и LAR-взаимодействующий белок со спиральной спиралью локализуются в очаговых адгезиях». EMBO J. 14 (12): 2827–2838. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07282.x. ЧВК  398401. PMID  7796809.
  6. ^ а б c d Серра-Пажес С., Медли QG, Тан М., Харт А., Штреули М. (июль 1998 г.). «Липрины, семейство белков, взаимодействующих с трансмембранной протеин-тирозинфосфатазой LAR». J Biol Chem. 273 (25): 15611–15620. Дои:10.1074 / jbc.273.25.15611. PMID  9624153.
  7. ^ а б «Ген Entrez: протеинтирозинфосфатаза PPFIA1, тип рецептора, f-полипептид (PTPRF), взаимодействующий белок (липрин), альфа-1»).
  8. ^ а б c Ко Дж, На М, Ким С., Ли Дж. Р., Ким Э (октябрь 2003 г.). «Взаимодействие семейства ERC RIM-связывающих белков с семейством липрин-альфа мультидоменных белков». J. Biol. Chem. 278 (43): 42377–85. Дои:10.1074 / jbc.M307561200. PMID  12923177.
  9. ^ а б Ко Дж, Ким С., Вальчанофф Дж. Г., Шин Х, Ли Дж. Р., Шэн М., Премонт РТ, Вайнберг Р. Дж., Ким Э (март 2003 г.). «Взаимодействие между липрином-альфа и GIT1 необходимо для нацеливания на рецептор AMPA». J. Neurosci. 23 (5): 1667–77. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.23-05-01667.2003. ЧВК  6741975. PMID  12629171.
  10. ^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  11. ^ а б c Пулидо Р., Серра-Пажес С., Тан М., Штреули М. (декабрь 1995 г.). «Подсемейство LAR / PTP-дельта / PTP-сигма трансмембранных протеин-тирозин-фосфатаз: множественные изоформы LAR, PTP-дельта и PTP-сигма человека экспрессируются тканеспецифическим образом и связываются с LAR-взаимодействующим белком LIP.1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (25): 11686–90. Дои:10.1073 / pnas.92.25.11686. ЧВК  40467. PMID  8524829.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q13136 (Липрин-альфа-1) в PDBe-KB.