Парабурхольдерия - Paraburkholderia

Парабурхольдерия
Научная классификация
Королевство:
Бактерии
Тип:
Протеобактерии
Учебный класс:
Бетапротеобактерии
Заказ:
Burkholderiales
Семья:
Burkholderiaceae
Род:
Парабурхольдерия

Савана и другие. 2014[1]

Парабурхольдерия это род Протеобактерии которые грамм отрицательный, слегка изогнутый стержни которые подвижны посредством жгутики. Сообщается, что они колонизируют эндофитный ткани ели гибридной (Picea glauca Икс Engelmannii ) и Ложная сосна с сильным потенциалом для выполнения биологическая азотфиксация и стимулирование роста растений.[2][3][4] В отличие от Burkholderia разновидность, Парабурхольдерия члены обычно не связаны с инфекцией человека. Парабурхольдерия члены образуют монофилетический клады в пределах Burkholderiaceae семья, что побудило их выделить как род, независимый от Burkholderia видов, в сочетании с обнаружением надежных сохраненные индели подписи которые уникальны для Парабурхольдерия видов и отсутствуют у представителей рода Burkholderia.[1] Эти CSI отличают этот род от всех других бактерий. Кроме того, CSI, которые были обнаружены Burkholderia виды отсутствуют в Парабурхольдерия, что свидетельствует об отдельных родословных.[5]

Сохранившиеся индели подписи также были обнаружены в пределах рода Парабурхольдерия.[1] Эти CSI работают параллельно с филогеномный анализы, указывающие на два монофилетический клады внутри рода; одна клада скрывает безымянный и Candidatus Paraburkholderia, в то время как другая клада включает экологические Парабурхольдерия, обычно используется в сельскохозяйственных целях.[6] CSI были обнаружены эксклюзивно для каждой из этих клад и не были обнаружены специфичными для какой-либо другой комбинации Парабурхольдерия видов, обеспечивающих дополнительный уровень филогенетический разрешение на уровне рода.[1][5]

Разновидность

Парабурхольдерия включает следующие виды:[1][7]

Рекомендации

  1. ^ а б c d е Савана А, Адеолу М, Гупта Р.С. (2014). «Молекулярные сигнатуры и филогеномный анализ рода Burkholderia: предложение о разделении этого рода на измененный род Burkholderia, содержащий патогенные организмы, и новый род Paraburkholderia gen. Nov., Укрывающий экологические виды».. Границы генетики. 5: 429. Дои:10.3389 / fgene.2014.00429. ЧВК  4271702. PMID  25566316.
  2. ^ Пури А., Падда КП, Чануэй КП (01.01.2020). «Могут ли естественные эндофитные азотфиксирующие бактерии гибридной белой ели поддерживать рост бореальных лесных деревьев на почвах с чрезвычайно низким содержанием питательных веществ?». Биология и биохимия почвы. 140: 107642. Дои:10.1016 / j.soilbio.2019.107642. ISSN  0038-0717.
  3. ^ Пури А., Падда КП, Чануэй КП (2018-12-15). «Доказательства наличия эндофитных диазотрофных бактерий в лесной сосне и гибридных деревьях белой ели, произрастающих на почвах с различным питательным статусом в регионе Западный Чилкотин в Британской Колумбии, Канада». Экология и управление лесами. 430: 558–565. Дои:10.1016 / j.foreco.2018.08.049. ISSN  0378-1127.
  4. ^ Пури А., Падда КП, Чануэй КП (2020-08-26). «Поддержание роста деревьев сосны в почвенных условиях с ограниченными питательными веществами с помощью полезных для растений бактерий». PLOS ONE. 15 (8): e0238055. Дои:10.1371 / journal.pone.0238055. ЧВК  7449467. PMID  32845898.
  5. ^ а б Гупта Р.С. (июль 2016 г.). «Влияние геномики на понимание эволюции и классификации микробов: важность взглядов Дарвина на классификацию». Обзор микробиологии FEMS. 40 (4): 520–53. Дои:10.1093 / femsre / fuw011. PMID  27279642.
  6. ^ Эстрада-де-лос-Сантос П., Винуеса П., Мартинес-Агилар Л., Хирш А. М., Кабальеро-Мелладо Дж. (Июль 2013 г.). «Филогенетический анализ видов буркхолдерий методом анализа мультилокусных последовательностей». Современная микробиология. 67 (1): 51–60. Дои:10.1007 / s00284-013-0330-9. PMID  23404651. S2CID  14190412.
  7. ^ Орен А., генеральный директор Гаррити (сентябрь 2017 г.). «Список новых имен и новых комбинаций, ранее эффективно, но недействительно опубликованных». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 67 (9): 3140–3143. Дои:10.1099 / ijs.0.000317. ЧВК  5817221. PMID  28891789.
  8. ^ а б Paulitsch F, Dall'Agnol RF, Delamuta JR, Ribeiro RA, da Silva Batista JS, Hungria M (2020). "Paraburkholderia atlantica sp. ноя и Paraburkholderia franconis sp. nov., два новых азотфиксирующих клубеньковых вида, выделенные из лесных почв Атлантического океана в Бразилии ". Arch Microbiol. 202 (6): 1369–1380. Дои:10.1007 / s00203-020-01843-w. PMID  32166359.
  9. ^ Вильгельм Р.К., Сайл К.Т., Мартинес К.Э., Карас, округ Колумбия, Ньюман Д.Д., Бакли Д.Х. (август 2020 г.). «Paraburkholderia solitsugae sp. Nov. И Paraburkholderia elongata sp. Nov., Бактерии, разлагающие фенольную кислоту, выделенные из лесной почвы и исправленное описание Paraburkholderia madseniana». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 70 (9): 5093–5105. Дои:10.1099 / ijsem.0.004387. PMID  32809929.
  10. ^ Паулич Ф., Фузинатто Далл'Аньол Р., Марсон Деламута-младший, Аугусто Рибейру Р., да Силва Батиста Дж. С., Хунгрия М. (2019). "Paraburkholderia guartelaensis sp. nov., азотфиксирующий вид, выделенный из клубеньков Мимоза гимнастическая в экотоне, считающемся горячей точкой биоразнообразия в Бразилии ". Arch Microbiol. 201: 1435–1446. Дои:10.1007 / s00203-019-01714-z.CS1 maint: использует параметр авторов (связь)
  11. ^ Вильгельм Р.К., Мерфи С.Дж., Ферианцек Н.М., Карас Д.К., Дерито С.М., Ньюман Д.Д., Бакли Д.Х. (март 2020 г.). «Paraburkholderia madseniana sp. Nov., Бактерия, разлагающая фенольную кислоту, выделенная из кислой лесной почвы». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 70 (3): 2137–2146. Дои:10.1099 / ijsem.0.004029. PMID  32027304.
  12. ^ Вильгельм Р.К., Сайл К.Т., Мартинес К.Э., Карас, округ Колумбия, Ньюман Д.Д., Бакли Д.Х. (август 2020 г.). «Paraburkholderia solitsugae sp. Nov. И Paraburkholderia elongata sp. Nov., Бактерии, разлагающие фенольную кислоту, выделенные из лесной почвы и исправленное описание Paraburkholderia madseniana». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 70 (9): 5093–5105. Дои:10.1099 / ijsem.0.004387. PMID  32809929.
  13. ^ а б Beukes CW, Steenkamp ET, van Zyl E, Avontuur J, Chan WY, Hassen AI и др. (Сентябрь 2019 г.). "Paraburkholderia strydomiana sp. ноя и Paraburkholderia steynii sp. ноя: Ризобиальные симбионты семейства бобовых. Гипокалипт софориный". Антони ван Левенгук. 112 (9): 1369–1385. Дои:10.1007 / s10482-019-01269-5. PMID  31053961. S2CID  143432118.
  14. ^ Мавима Л., Беукес К.В., Палмер М., Де Мейер С.Е., Джеймс Е.К., Малук М., Гросс Е., Буэно-дос-Рейс Ф., Авонтуур-младший, Чан В.Й., Вентер С.Н., Стинкамп И. "Paraburkholderia youngii sp. ноя и 'Paraburkholderia atlantica'- бразильские и мексиканские ризобии, ассоциированные с мимозой, которые ранее были известны как Paraburkholderia tuberum св. мимозы". Syst Appl Microbiol. Дои:10.1016 / j.syapm.2020.126152.