Потексвирус - Potexvirus

Потексвирус
	Симптомы разрыва цвета, вызванные вирус мозаики нарцисса (НМВ) в нарциссы (A, B) и нормальный цветок (C)
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область:	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Kitrinoviricota
Класс:	Alsuviricetes
Заказ:	Tymovirales
Семья:	Alphaflexiviridae
Род:	Потексвирус
Типовой вид
	Картофельный вирус X;
Разновидность
	Вирус актинидии X видеть Вирус подорожника X; Allium вирус X; Вирус альстромерии X; Вирус мозаики альтернативантеры; Вирус спаржи 3; Вирус бамбуковой мозаики; Кактус вирус X; Вирус мозаики обыкновенной маниоки; Вирус маниоки X; Вирус желтой мозаики клевера; Вирус мозаики цимбидиума; Вирус мозаики лисохвоста; Хоста Вирус X; Вирус кольцевой пятнистости гортензии; Вирус легкой мозаики Lagenaria; Вирус салата X; Лили вирус X; Вирус мозаики мальвы; Мятный вирус X; Вирус мозаики нарциссов; Нерин вирус X; Вирус опунции X; Вирус мозаики папайи; Вирус мозаики пепино; Вирус Phaius X; Вирус Питайи X; Вирус мозаики Plantago asiatica; Вирус подорожника X; Вирус мозаики аукуба картофеля; Картофельный вирус X; Вирус Шлюмбергера X; Клубника мягкий вирус желтого края; Вирус красной мозаики тамуса; Вирус тюльпана X; Ванильный вирус X; Вирус мозаики белого клевера; Ям вирус X; Зигокактус вирус X;

Потексвирус это род патогенные вирусы в порядке Tymovirales, в семье Alphaflexiviridae. Растения служат естественными хозяевами. В настоящее время в этом роду насчитывается 38 видов, включая типовые виды. Картофельный вирус X. Заболевания, связанные с этим видом, включают симптомы мозаики и кольцевой пятнистости.^[3]^[4] Название рода происходит от типового вида ГОРШОКато вирус Икс ).

Вирусология

В вирион длина может значительно варьироваться (от 470 до 1000 нанометров и более) и составляет 12-13 нм в диаметре. Шаг спирали основной спирали 3,3–3,7 нм (8–9 копий белка оболочки на оборот). Он не обволакиваемый, изгибающийся и нитевидный. Сама шерсть состоит из 1000-1500 копий белка оболочки.^[3]

Геном является линейным, длиной 5,9-7 тыс. Пар оснований с заглушенным 5 'концом и полиаденилированным 3' концом. Геном кодирует 5 белков. Слева направо эти белки: вирус репликации вируса, который состоит из домена кэпирующего фермента, домена, подобного геликазе, РНК-зависимая РНК-полимераза, три белка - тройной блок генов (TGB) 1, 2 и 3 - и белок оболочки.^[3]

Род	Структура	Симметрия	Капсид	Геномное расположение	Геномная сегментация
Потексвирус	Нитчатый		Без оболочки	Линейный	Одночастный

РНК транслируется, давая начало вирусной РНК-полимеразе. Это, в свою очередь, дает матрицу с отрицательной цепью, из которой генерируется серия субгеномных РНК. Эти субгеномные РНК затем транслируются в вирусные белки.

5'-конец имеет длину около 80 нуклеотидов и обычно начинается с последовательности GAAAA.^[5]

Помимо активности РНК-полимеразы, вирусная РНК-полимераза (молекулярная масса ~ 150 кгДальтон ) также имеет метилтрансфераза и РНК-геликаза виды деятельности.

Белки TGB консервативны среди Аллексивирус, Карлавирус, Фовеавирус, Фуровирус, Хордейвирус, Пекловирус, Помовирус и роды Potexvirus. Их функции являются предметом активных исследований.

TGB 1 (молекулярная масса 23 кДа) - многофункциональный белок. Он обладает активностью РНК-геликазы и, по-видимому, участвует в перемещении от клетки к клетке.

Белки TGB 2 (молекулярная масса 11 кДа) и TGB 3 (молекулярная масса 10 кДа) связываются с эндоплазматический ретикулум.

Белок оболочки имеет молекулярную массу ~ 25 кДа.

Длина нетранслируемой 3'-области составляет ~ 100 нуклеотидов.

Жизненный цикл

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Попадание в хозяйскую клетку достигается за счет проникновения в хозяйскую клетку. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Перевод происходит методом дырявого сканирования. Вирус покидает клетку-хозяина посредством трехстороннего движения вируса, не управляемого канальцами. Вирус передается через переносчика (насекомых). Пути передачи бывают векторные и механические.^[3]

Род	Детали хоста	Тканевый тропизм	Детали входа	Детали выпуска	Сайт репликации	Сайт сборки	Передача инфекции
Потексвирус	Растения	Никто	Вирусное движение; механическая инокуляция	Вирусное движение	Цитоплазма	Цитоплазма	Насекомые

Хосты

Известные хосты из Лилиопсида или же Магнолиопсида.

Распределение

Эти вирусы, по-видимому, распространены по всему миру.

внешняя ссылка

«Род: Potexvirus - Alphaflexiviridae - РНК-вирусы с положительным смыслом». Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Получено 13 ноября 2020.
Viralzone: Потексвирус

[Hammond-et-al-2020-1] Хаммонд, Джон; Адамс, Ян; Fowkes, Aimee R .; МакГрейг, Сэм; Ботерманс, Марлен; van Oorspronk, Joanieke J.A .; Вестенберг, Марсель; Вербеек, Мартин; Dullemans, Annette M .; Stijger, Christina C.M.M .; Blouin, Arnaud G .; Массарт, Себастьян; Де Йонге, Крис; Хейнеман, Маайке; Уолш, Джон А .; Фокс, Адриан (7 ноября 2020 г.). «Анализ последовательности 43-летних образцов Plantago lanceolata показывает, что вирус X подорожника является синонимом вируса актинидии X и широко распространен». Патология растений. Wiley-Blackwell. Дои:10.1111 / ppa.13310. ISSN 0032-0862.

[2] «Таксономия вирусов: выпуск 2018b» (HTML). Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2019 г.. Получено 20 марта 2019.

[ViralZone-3] а ^б ^c ^d «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.

[ICTV-4] ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.». Получено 15 июн 2015.

[5] Côté, F .; Paré, C .; Majeau, N .; Bolduc, M. N .; Leblanc, É .; Bergeron, M. G .; Бернарди, М. Г .; Леклерк, Д. (2008). «Нуклеотидная последовательность и филогенетический анализ нового потексвируса: Malva Mosaic Virus». Инфекция, генетика и эволюция. 8 (1): 83–93. Дои:10.1016 / j.meegid.2007.10.006. PMID 18054524.

[2]

[1]

[3]

[4]

[5]