Обогащенная пролином спиральная катушка 1 - Proline-Rich Coiled Coil 1

Катушка Proline Rich Coiled-1 (PRCC1) - это обычно идентифицируемое название белка CAD38605. Ген PRCC1 находится на длинной руке Хромосома 5. Он кодирует для 445 аминокислоты всего прогнозируется 6 экзоны. Предсказанный молекулярный вес составляет 46,7 кДа, а изоэлектрическая точка составляет 5,46.[1] Ортологи были определены в большинстве эукариоты, наиболее консервативный, обнаруженный у большинства видов млекопитающих. Среди других удаленных видов поддерживается умеренная охрана, например: Gallus gallus, Xenopus, Стронгилоцентротус пурпуратус, Тетраодон, так далее.

Ген PRCC1 имеет две отдельные области: пролин -богатый регион на N-конец, а область DUF84 на C-конец.

Область DUF84 находится в геноме бактерии, называемой Холерный вибрион.[2] Область состоит примерно из 183 аминокислотных остатков. V. cholorae причины холера и желудочный грипп в людях. Одна только область DUF84 состоит примерно из 160 аминокислотных остатков. Это единственный другой белок, который состоит из DUF84, кроме PRCC1.

Программа предсказания субклеточной локализации pTarget предсказала, что PRCC1 будет локализоваться в ядро с уверенностью 95%.[3] Однако в исследовательской статье Kamakari et al. определили локализацию белка в аппарате Гольджи.[4] PRCC1 экспрессируется повсеместно с высокой плотностью экспрессии в мозг, гипоталамус и гиппокамп особенно. Никаких доказательств белок-белкового взаимодействия обнаружено не было. Нет доказательств наличия РНК альтернативное сращивание был определен.

Рекомендации

  1. ^ Кагачи, Тихиро (2007). «Сравнение бактериальных геномов». Сэйкагаку - Журнал Японского Биохимического Общества.
  2. ^ «NTPase [Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961]». Национальный центр биотехнологической информации.
  3. ^ pTarget В архиве 2009-06-27 на Wayback Machine.
  4. ^ Камакари С., Руссу А., Джефферсон А., Рагусси I, Ананьу Н.П. (январь 2005 г.). «Структурный анализ и профиль экспрессии нового гена на хромосоме 5q23, кодирующего ассоциированный с Гольджи белок с шестью вариантами сплайсинга, и вовлеченный в делецию 5q пациента Ph (-) CML». Исследование лейкемии. 29 (1): 17–31. Дои:10.1016 / j.leukres.2004.04.019. PMID  15541471.

внешняя ссылка