Белок аргининметилтрансфераза 5 - Protein arginine methyltransferase 5

PRMT5
6ckc2.jpg
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPRMT5, HRMT1L5, IBP72, JBP1, SKB1, SKB1Hs, протеин аргининметилтрансфераза 5, HSL7
Внешние идентификаторыOMIM: 604045 MGI: 1351645 ГомолоГен: 4454 Генные карты: PRMT5
Номер ЕС2.1.1.321
Расположение гена (человек)
Хромосома 14 (человек)
Chr.Хромосома 14 (человек)[1]
Хромосома 14 (человек)
Геномное расположение PRMT5
Геномное расположение PRMT5
Группа14q11.2Начните22,920,525 бп[1]
Конец22,929,408 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PRMT5 217786 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_013768
NM_001313906
NM_001313907

RefSeq (белок)

NP_001300835
NP_001300836
NP_038796

Расположение (UCSC)Chr 14: 22.92 - 22.93 МбChr 14: 54,51 - 54,52 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок аргинин-N-метилтрансфераза 5 является фермент что у людей кодируется PRMT5 ген.[5][6] PRMT5 симметрично диметилирует H2AR3, H4R3, H3R2 и H3R8 in vivo, все из которых связаны с рядом событий регуляции транскрипции.[7]

PRMT5 представляет собой высококонсервативную аргининметилтрансферазу, которая перемещается из цитоплазмы в ядро ​​в эмбриональный день ~ E8.5 и во время предимплантационного развития на ~ 4-клеточной стадии.[8]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции PRMT5. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Prmt5tm2a (EUCOMM) Wtsi[14][15] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[16][17][18]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[12][19] Было проведено двадцать пять испытаний мутант мышей и двух значительных отклонений не наблюдалось.[12] Нет гомозиготный мутантные эмбрионы были идентифицированы во время беременности, и поэтому ни один из них не выжил до отлучение от груди. Остальные испытания проводились на гетерозиготный мутантных взрослых мышей, но никаких дальнейших отклонений не наблюдалось.[12]

Условный аллель Prmt5 в конечности мыши показывает, что он необходим для поддержания популяции предшественников, поскольку условные мутанты имеют дефекты конечностей. [20]

Взаимодействия

Было показано, что протеин аргининметилтрансфераза 5 взаимодействовать с участием:

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100462 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023110 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Gilbreth M, Yang P, Bartholomeusz G, Pimental RA, Kansra S, Gadiraju R, Marcus S (январь 1999 г.). «Отрицательная регуляция митоза у делящихся дрожжей с помощью shk1 взаимодействующего белка skb1 и его человеческого гомолога Skb1Hs». Proc Natl Acad Sci U S A. 95 (25): 14781–6. Дои:10.1073 / пнас.95.25.14781. ЧВК  24526. PMID  9843966.
  6. ^ «Ген Entrez: протеин аргининметилтрансфераза 5 PRMT5».
  7. ^ Стопа Н., Кребс Дж. Э., Шехтер Д. (июнь 2015 г.). «Аргининметилтрансфераза PRMT5: многие роли в развитии, раке и не только». Клеточные и молекулярные науки о жизни. 72 (11): 2041–59. Дои:10.1007 / s00018-015-1847-9. ЧВК  4430368. PMID  25662273.
  8. ^ Kim S, Gunesdogan, U, Zylicz JJ, Hackett, JA, Cougot, D, Bao, S, Lee, C, Dietmann, S, Allen, GE, Sngupta, R, Surani MA (ноябрь 2014 г.). «PRMT5 защищает целостность генома во время глобального деметилирования ДНК в первичных зародышевых клетках и преимплантационных эмбрионах». Молекулярная клетка. 56 (4): 564–579. Дои:10.1016 / j.molcel.2014.10.003. ЧВК  4250265. PMID  25457166.
  9. ^ «Гематологические данные для Prmt5». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  10. ^ "Сальмонелла данные о заражении Prmt5 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  11. ^ "Citrobacter данные о заражении Prmt5 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  12. ^ а б c d Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
  13. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  14. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  15. ^ "Информатика генома мыши".
  16. ^ Скарнес В.С., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт АФ, Брэдли А (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  17. ^ Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  18. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь на все случаи жизни». Ячейка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247.
  19. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.
  20. ^ Норри Дж. Л., Ли К., Ко С., Хуанг Б. Л., Дин Д., Ю Дж. К. и др. (Декабрь 2016 г.). «PRMT5 необходим для поддержания хондрогенных клеток-предшественников в зачатке конечности». Развитие. 143 (24): 4608–4619. Дои:10.1242 / dev.140715. ЧВК  5201029. PMID  27827819.
  21. ^ а б Friesen WJ, Wyce A, Paushkin S, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (март 2002 г.). «Новый компонент повторяющегося белка WD метилосомы связывает белки Sm». J. Biol. Chem. 277 (10): 8243–7. Дои:10.1074 / jbc.M109984200. PMID  11756452.
  22. ^ Крапивинский Г., Пу В., Викман К., Крапивинский Л., Клэпхэм Д.Е. (май 1998 г.). «pICln связывается с гомологом дрожжевого белка млекопитающего, участвующим в регуляции морфологии клеток». J. Biol. Chem. 273 (18): 10811–4. Дои:10.1074 / jbc.273.18.10811. PMID  9556550.
  23. ^ а б Friesen WJ, Paushkin S, Wyce A, Massenet S, Pesiridis GS, Van Duyne G, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (декабрь 2001 г.). «Метилосома, комплекс 20S, содержащий JBP1 и pICln, производит диметиларгинин-модифицированные белки Sm». Мол. Cell. Биол. 21 (24): 8289–300. Дои:10.1128 / MCB.21.24.8289-8300.2001. ЧВК  99994. PMID  11713266.
  24. ^ Поллак Б.П., Котенко С.В., Хе В., Изотова Л.С., Барноски Б.Л., Пестка С. (октябрь 1999 г.). «Человеческий гомолог дрожжевых белков Skb1 и Hsl7p взаимодействует с киназами Jak и обладает активностью протеинметилтрансферазы». J. Biol. Chem. 274 (44): 31531–42. Дои:10.1074 / jbc.274.44.31531. PMID  10531356.
  25. ^ Квак Ю.Т., Го Дж., Праджапати С., Парк К.Дж., Сурабхи Р.М., Миллер Б., Гериг П., Гейнор Р.Б. (апрель 2003 г.). «Метилирование SPT5 регулирует его взаимодействие с РНК-полимеразой II и свойства удлинения транскрипции». Мол. Ячейка. 11 (4): 1055–66. Дои:10.1016 / с1097-2765 (03) 00101-1. PMID  12718890.
  26. ^ Guderian G, Peter C, Wiesner J, Sickmann A, Schulze-Osthoff K, Fischer U, Grimmler M (январь 2011 г.). «RioK1, новый интерактор протеин-аргининметилтрансферазы 5 (PRMT5), конкурирует с pICln за связывание и модулирует состав комплекса PRMT5 и субстратную специфичность». J Biol Chem. 286 (3): 1976–86. Дои:10.1074 / jbc.M110.148486. ЧВК  3023494. PMID  21081503.

дальнейшее чтение