RMDN3 - Википедия - RMDN3

RMDN3
Идентификаторы
ПсевдонимыRMDN3, FAM82A2, FAM82C, RMD-3, RMD3, ptpip51, регулятор динамики микротрубочек 3
Внешние идентификаторыOMIM: 611873 MGI: 1915059 ГомолоГен: 34926 Генные карты: RMDN3
Расположение гена (человек)
Хромосома 15 (человек)
Chr.Хромосома 15 (человек)[1]
Хромосома 15 (человек)
Геномное расположение RMDN3
Геномное расположение RMDN3
Группа15q15.1Начинать40,735,884 бп[1]
Конец40,755,851 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001033136

RefSeq (белок)

NP_001028308

Расположение (UCSC)Chr 15: 40.74 - 40.76 МбChr 2: 119.14 - 119.16 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Регулятор динамики микротрубочек белок 3 (RMDN3), более известный как белок 51, взаимодействующий с тирозинфосфатазой (PTPIP51), представляет собой белок что у людей кодируется RMDN3 ген на хромосоме 15.[5][6] Этот белок участвует во многих биологических функциях, включая клеточную дифференцировку, пролиферацию, подвижность, формирование цитоскелета и апоптоз, и был связан с многочисленными видами рака.[7][8][9]

Структура

PTPIP51 содержит два консервативных домена, называемых консервативной областью 1 (CR1) и консервативной областью 2 (CR2), которые служат сайтами связывания для белков 14-3-3. Близко к этим консервативным доменам находятся два тирозиновых остатки, тирозин 53 и 158, которые служат сайтами фосфорилирования для различных киназ.[8] Кроме того, PTPIP51 имеет митохондриальную нацеленную последовательность на своем N-конце, которая отвечает за индукцию апоптоза, хотя в некоторых вариантах сплайсинга эта последовательность отсутствует.[5][10] Он также содержит 33-остаток спиральная катушка домен на позициях 92 - 124.[5]

Функция

PTPIP51 является членом семейства белков RMDN и локализуется в внешняя митохондриальная мембрана, цитоплазма, и ядро.[5] Этот белок участвует в клеточной дифференцировке, пролиферации, подвижности, формировании цитоскелета и апоптозе.[7][8] Эти биологические функции, таким образом, служат для облегчения развития млекопитающих посредством таких процессов, как образование ворсинок плаценты и ангиогенез.[7][10] В частности, он экспрессируется в дифференцированных клетках и тканях, таких как фолликулярный и межфолликулярный эпидермис, эпителий, скелетные мышцы, яички и нервная ткань.[7][10] PTPIP51 также дифференциально экспрессируется в нейтрофилах, но не в других иммунных клетках, и, таким образом, может участвовать в передаче сигналов иммунных клеток и развитии миелоида, взаимодействуя с TCPTP и PTP1B.[10] Его взаимодействия с PTP1B, наряду с белками 14-3-3β, Raf-1, c-Src, PKA и DAGKα, определяют механизмы, с помощью которых он влияет на путь митоген-активируемой протеинкиназы (MAPK).[8] Было обнаружено, что PTPIP51 вызывает апоптоз, нарушая митохондриальную мембранный потенциал, в результате чего был выпущен цитохром с.[11]

Клиническое значение

В настоящее время мало что известно о белке RMDN3 в отношении его клинического значения, кроме очевидной роли в онкология. Основным механизмом действия белка RMDN3 является его роль в качестве апоптотический составляющая. Во время нормального эмбриологический процессов или во время повреждения клеток (например, ишемия-реперфузия во время сердечные приступы и удары ) или во время разработки и процессов в рак, апоптотическая клетка претерпевает структурные изменения, включая сжатие клеток, образование пузырей плазматической мембраны, ядерную конденсацию и фрагментацию ДНК и ядро. Далее следует фрагментация на апоптотические тельца, которые быстро удаляются фагоциты, тем самым предотвращая воспалительный отклик.[12] Это способ гибели клеток, определяемый характерными морфологическими, биохимическими и молекулярными изменениями. Сначала он был описан как «усадочный некроз», а затем этот термин был заменен на апоптоз, чтобы подчеркнуть его противоположную роль. митоз в кинетике тканей. На более поздних стадиях апоптоза вся клетка становится фрагментированной, образуя ряд апоптотических тел, связанных с плазматической мембраной, которые содержат ядерные и / или цитоплазматические элементы. Ультраструктурный вид некроз Совершенно иначе, основными признаками которого являются набухание митохондрий, разрушение плазматической мембраны и распад клеток. Апоптоз встречается во многих физиологический и патологический процессы. Он играет важную роль во время эмбриональный развитие как запрограммированная гибель клеток и сопровождает множество нормальных инволюционных процессов, в которых оно служит механизмом для удаления «нежелательных» клеток.

И белок, и мРНК PTPIP51 вовлечены в различные карциномы, включая карциному простаты (РПЖ), кератиноцитарную карциному, базально-клеточную карциному и плоскоклеточную карциному.[7][9][10] Предполагается, что сверхэкспрессия PTPIP51 в РПЖ является результатом элементов ретротранспозона, активируемых гипометилированием CpG-островков, которое наблюдается при позднем канцерогенезе простаты.[7] Более того, было обнаружено, что белок взаимодействует с PTP1B влиять на путь MAPK при остром миелоидном лейкозе.[8] Помимо рака, PTPIP51 был связан с доброкачественной гиперплазией простаты (ДГПЖ) и, в более широком смысле, с состояниями, связанными с ДГПЖ, включая старение и дисфункцию нижних мочевых путей.[7]

Взаимодействия

RMDN3 был показан взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000137824 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000070730 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c d "Q96TC7 - RMD3_HUMAN".
  6. ^ "Ген Entrez: регулятор динамики микротрубочек белок 3".
  7. ^ а б c d е ж грамм час я j Кох П., Петри М., Парадовска А., Стензингер А., Штурм К., Стегер К., Виммер М. (декабрь 2009 г.). «Экспрессия мРНК и белка PTPIP51 в тканевых микрочипах и метилирование промотора доброкачественной гиперплазии предстательной железы и карциномы простаты». Простаты. 69 (16): 1751–62. Дои:10.1002 / pros.21025. PMID  19691131.
  8. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м Brobeil A, Bobrich M, Tag C, Wimmer M (июль 2012 г.). «PTPIP51 в белковых взаимодействиях: регуляция и партнеры, взаимодействующие in situ». Биохимия и биофизика клетки. 63 (3): 211–22. Дои:10.1007 / s12013-012-9357-y. PMID  22544307.
  9. ^ а б Бароп Дж., Зауэр Х., Стегер К., Виммер М. (май 2009 г.). «Зависимая от дифференцировки экспрессия PTPIP51 в культуре клеток скелетных мышц человека». Журнал гистохимии и цитохимии. 57 (5): 425–35. Дои:10.1369 / jhc.2008.952846. ЧВК  2675071. PMID  19124842.
  10. ^ а б c d е Кох П., Стензингер А., Виард М., Меркер Д., Майзер П., Ниллес М., Шрайнер Д., Стегер К., Виммер М. (октябрь 2008 г.). «Новый белок PTPIP51 экспрессируется в карциномах кератиноцитов человека и окружающей их строме». Журнал клеточной и молекулярной медицины. 12 (5B): 2083–95. Дои:10.1111 / j.1582-4934.2008.00198.x. ЧВК  4506173. PMID  19012732.
  11. ^ Lv BF, Yu CF, Chen YY, Lu Y, Guo JH, Song QS, Ma DL, Shi TP, Wang L (сентябрь 2006 г.). «Белок, взаимодействующий с тирозинфосфатазой, белок 51 (PTPIP51) представляет собой новый митохондриальный белок с N-концевой митохондриальной нацеленной последовательностью, который вызывает апоптоз». Апоптоз. 11 (9): 1489–501. Дои:10.1007 / s10495-006-8882-9. PMID  16820967.
  12. ^ Керр Дж. Ф., Уилли А. Х., Карри А. Р. (август 1972 г.). «Апоптоз: основной биологический феномен с широким спектром влияния на кинетику тканей». Британский журнал рака. 26 (4): 239–57. Дои:10.1038 / bjc.1972.33. ЧВК  2008650. PMID  4561027.
  13. ^ Де Вос, KJ; Mórotz, GM; Stoica, R; Тюдор, ЭЛ; Lau, KF; Акерли, S; Уорли, А; Шоу, CE; Миллер, CC (15 марта 2012 г.). «VAPB взаимодействует с митохондриальным белком PTPIP51, регулируя гомеостаз кальция». Молекулярная генетика человека. 21 (6): 1299–311. Дои:10.1093 / hmg / ddr559. ЧВК  3284118. PMID  22131369.