RNF144A - RNF144A

RNF144A
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыRNF144A, RNF144, UBCE7IP4, белок 144A безымянного пальца, hUIP4
Внешние идентификаторыMGI: 1344401 ГомолоГен: 40982 Генные карты: RNF144A
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение RNF144A
Геномное расположение RNF144A
Группа2п25.1Начните6,917,412 бп[1]
Конец7,068,286 бп[1]
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

9781

108089

Ансамбль

ENSG00000151692

ENSMUSG00000020642

UniProt

P50876

Q925F3

RefSeq (мРНК)

NM_001081977
NM_080563

RefSeq (белок)

NP_001075446
NP_542130

Расположение (UCSC)Chr 2: 6.92 - 7.07 МбChr 12: 26,3 - 26,42 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

RNF144A является Убиквитинлигаза E3 принадлежащих к семейству RING-between RING (RBR) убиквитин лигазы, специфические члены которого, как было показано, действуют как гибридные лигазы E3 RING-HECT.[5][6][7] RNF144A наиболее тесно связан с RNF144B на уровне белка, и оба белка вместе составляют субдомен в пределах семейства белков RBR.[8][9][10] Убиквитинлигазная активность RNF144A катализирует связи убиквитина в положениях K6, K11 и K48 убиквитина in vitro и регулируется путем самоассоциации через его трансмембранный домен.[11][12]

Биологические функции RNF144A относительно неизвестны, за исключением его внутренних ферментативная активность. Соматические мутации RNF144A внесены в каталог рак генетический базы данных в нескольких основных человеческих опухоли, в том числе грудь, желудок, лимфома, глиобластома, матка и рак легких. Другие члены семьи RBR были связаны с неврологический и иммунологический болезни, в первую очередь Паркин, HOIL-1L и HOIP (RNF31).[13][14][15][16]

Текущий известный субстраты RNF144A, нацеленных на деградацию, являются белками, участвующими в Ремонт ДНК, функция теплового шока / шаперона и передача сигналов, согласующиеся с преобладающей ассоциацией этого белка с раком, и включают (ДНК-PKcs ), PARP1, HSPA2, ИМТ1, и RAF1.[17][18][19][20][21]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000151692 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020642 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Венцель Д.М., Лиссунов А., Бржович П.С., Клевит Р.Э. (июнь 2011 г.). «Профиль реактивности UBCH7 показывает, что паркин и HHARI являются гибридами RING / HECT». Природа. 474 (7349): 105–8. Дои:10.1038 / природа09966. ЧВК  3444301. PMID  21532592.
  6. ^ "Белок 144A безымянного пальца RNF144A [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США. Получено 2019-10-27.
  7. ^ «RNF144A - убиквитин-протеинлигаза E3 RNF144A - Homo sapiens (человек) - ген и белок RNF144A». www.uniprot.org. UniProt. Получено 2019-10-27.
  8. ^ Голубь К.К., Клевит РЭ (ноябрь 2017 г.). «Лигазы E3 RING-Between-RING: новые темы среди вариаций». Журнал молекулярной биологии. 429 (22): 3363–3375. Дои:10.1016 / j.jmb.2017.08.008. ЧВК  5675740. PMID  28827147.
  9. ^ Spratt DE, Walden H, Shaw GS (март 2014 г.). «Убиквитин-лигазы RBR E3: новые структуры, новые идеи, новые вопросы». Биохимический журнал. 458 (3): 421–37. Дои:10.1042 / BJ20140006. ЧВК  3940038. PMID  24576094.
  10. ^ Eisenhaber B, Chumak N, Eisenhaber F, Hauser MT (2007). «Кольцо между безымянными пальцами (RBR) семейства белков». Геномная биология. 8 (3): 209. Дои:10.1186 / gb-2007-8-3-209. ЧВК  1868946. PMID  17367545.
  11. ^ Мишель М.А., Сватек К.Н., Хоспенталь М.К., Командер Д. (октябрь 2017 г.). «Аффимеры, специфичные для связывания убиквитина, раскрывают понимание передачи сигналов убиквитина, связанного с K6». Молекулярная клетка. 68 (1): 233–246.e5. Дои:10.1016 / j.molcel.2017.08.020. ЧВК  5640506. PMID  28943312.
  12. ^ Хо С.Р., Ли Ю.Дж., Лин В.К. (сентябрь 2015 г.). «Регулирование активности убиквитинлигазы RNF144A E3 путем самоассоциации через его трансмембранный домен». Журнал биологической химии. 290 (38): 23026–38. Дои:10.1074 / jbc.M115.645499. ЧВК  4645615. PMID  26216882.
  13. ^ Пикрелл А.М., Юл Р.Дж. (январь 2015 г.). «Роль PINK1, паркина и митохондриальной верности при болезни Паркинсона». Нейрон. 85 (2): 257–73. Дои:10.1016 / j.neuron.2014.12.007. ЧВК  4764997. PMID  25611507.
  14. ^ Ода Х., Бек Д. Б., Куэн Х. С., Сампайо Моура Н., Хоффманн П., Ибарра М. и др. (2019-03-18). «Второй случай дефицита HOIP расширяет клинические характеристики и определяет воспалительный транскриптом, регулируемый LUBAC». Границы иммунологии. 10: 479. Дои:10.3389 / fimmu.2019.00479. ЧВК  6431612. PMID  30936877.
  15. ^ Буассон Б., Лаплантин Э, Доббс К., Кобат А., Тарантино Н., Хазен М. и др. (Июнь 2015 г.). «Дефицит HOIP и LUBAC человека лежит в основе ауто-воспаления, иммунодефицита, амилопектиноза и лимфангиэктазии». Журнал экспериментальной медицины. 212 (6): 939–51. Дои:10.1084 / jem.20141130. ЧВК  4451137. PMID  26008899.
  16. ^ Буассон Б., Лаплантин Е., Прандо С., Джилиани С., Исраэльссон Е., Сюй З. и др. (Декабрь 2012 г.). «Иммунодефицит, аутовоспаление и амилопектиноз у людей с наследственной недостаточностью HOIL-1 и LUBAC». Иммунология природы. 13 (12): 1178–86. Дои:10.1038 / ni.2457. ЧВК  3514453. PMID  23104095.
  17. ^ Хо С.Р., Маханик С.С., Ли Ю.Дж., Лин В.К. (июль 2014 г.). «RNF144A, убиквитинлигаза E3 для ДНК-PKcs, способствует апоптозу при повреждении ДНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 111 (26): E2646-55. Bibcode:2014PNAS..111E2646H. Дои:10.1073 / pnas.1323107111. ЧВК  4084471. PMID  24979766.
  18. ^ Чжан Y, Ляо XH, Xie HY, Shao ZM, Li DQ (ноябрь 2017 г.). «RBR-тип E3 убиквитинлигаза RNF144A нацелена на PARP1 для убиквитин-зависимой деградации и регулирует чувствительность к ингибитору PARP в клетках рака молочной железы». Oncotarget. 8 (55): 94505–94518. Дои:10.18632 / oncotarget.21784. ЧВК  5706891. PMID  29212245.
  19. ^ Ян ИЛ, Чжан И, Ли Д.Д., Чжан Флорида, Лю Х.Й., Ляо XH и др. (Август 2019 г.). «RNF144A действует как опухолевый супрессор при раке молочной железы посредством зависимой от активности убиквитинлигазы регуляции стабильности и онкогенных функций HSPA2». Гибель клеток и дифференциация. 27 (3): 1105–1118. Дои:10.1038 / s41418-019-0400-z. ЧВК  7205990. PMID  31406303.
  20. ^ Джин X, Ким LJ, Wu Q, Уоллес LC, Prager BC, Sanvoranart T и др. (Ноябрь 2017 г.). «Нацеливание на стволовые клетки глиомы посредством комбинированного ингибирования BMI1 и EZH2». Природа Медицина. 23 (11): 1352–1361. Дои:10,1038 / нм.4415. ЧВК  5679732. PMID  29035367.
  21. ^ Афзали Б., Ким С., Вест Е., Нова-Ламперти Е., Черу Н., Нагашима Н. и др. (2019-09-26). «RNF144A формирует иерархию передачи сигналов цитокинов для обеспечения защитного иммунитета против гриппа». Дои:10.1101/782680. Цитировать журнал требует | журнал = (Помогите)