Роксан (белок) - Википедия - Roxan (protein)
RoXaN (Неструктурный белок, связанный с ротавирусом 'X'), также известный как ZC3H7B (цинковый палец типа CCCH, содержащий 7B), представляет собой белок что у людей кодируется ZC3H7B ген.[5] RoXaN - это белок, содержащий тетратрикопептидный повтор и лейцин-аспартатный повтор, а также цинковый палец домены. Этот белок также взаимодействует с ротавирус неструктурный белок NSP3.[5]
Функция
Ротавирус мРНК находятся закрытый но нет полиаденилированный, а вирусные белки переведено с помощью машины клеточного перевода. Это достигается за счет действия вирусного Неструктурный белок NSP3 который специфически связывает 3'-консенсусную последовательность вирусных мРНК и взаимодействует с фактором инициации трансляции эукариот eIF4G Я.[6]
RoXaN (белок ротавируса X, связанный с NSP3 ) представляет собой клеточный белок массой 110 кДа, который содержит минимум три области, которые, как предполагается, участвуют во взаимодействиях белок-белок или нуклеиновая кислота-белок. А тетратрикопептид повторяющаяся область, домен межбелкового взаимодействия, наиболее часто встречающийся в мультибелковых комплексах, присутствует в аминоконцевой области. На карбоксильном конце не менее пяти цинковый палец наблюдаются мотивы, что дополнительно указывает на способность RoXaN связывать другие белки или нуклеиновые кислоты. Между этими двумя регионами существует паксиллин мотив лейцин-аспартатных повторов (LD), который участвует в межбелковых взаимодействиях.[6]
Клиническое значение
RoXaN способен взаимодействовать с NSP3 in vivo и при ротавирусной инфекции. Домены взаимодействия соответствуют домену димеризации NSP3 (аминокислоты с 163 по 237) и домену LD RoXaN (аминокислоты с 244 по 341). Взаимодействие между NSP3 и RoXaN не нарушает взаимодействия между NSP3 и eIF4G I, и тройной комплекс, состоящий из NSP3, RoXaN и eIF4G I, может быть обнаружен в клетках, инфицированных ротавирусом, вовлекая RoXaN в перевод регулирование.[6]
Было обнаружено, что экспрессия RoXaN коррелирует с более высокой степенью опухоли в GIST (опухоли стромы желудочно-кишечного тракта ).[7]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100403 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022390 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б «Ген Entrez: ZC3H7B цинковый палец типа CCCH, содержащий 7B».
- ^ а б c Витур Д., Линденбаум П., Ванде П., Беккер М.М., Понсе Д. (апрель 2004 г.). «RoXaN, новый клеточный белок, содержащий мотивы TPR, LD и цинковые пальцы, образует тройной комплекс с эукариотическим фактором инициации 4G и ротавирусом NSP3». Дж. Вирол. 78 (8): 3851–62. Дои:10.1128 / JVI.78.8.3851-3862.2004. ЧВК 374268. PMID 15047801.
- ^ Кан Х. Дж., Кох К. Х., Ян Э, Ю К. Т., Ким Х. Дж., Пайк Ю. К., Ким Х (февраль 2006 г.). «Дифференциально экспрессируемые белки в опухолях стромы желудочно-кишечного тракта с мутациями KIT и PDGFRA». Протеомика. 6 (4): 1151–7. Дои:10.1002 / pmic.200500372. PMID 16402362.
дальнейшее чтение
- Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Кикуно Р., Нагасе Т., Исикава К. и др. (Июнь 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 6 (3): 197–205. Дои:10.1093 / днарес / 6.3.197. PMID 10470851.
- Данэм И., Шимицу Н., Роу Б.А. и др. (Декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID 10591208.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (Март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК 311072. PMID 11230166.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (Декабрь 2002 г.). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (Октябрь 2004 г.). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Геномные исследования. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (Январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природа Биотехнологии. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455.
- Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (Май 2006 г.). «Сеть межбелкового взаимодействия для наследственных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569.
 | Эта статья о ген на хромосома человека 22 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |