Ruegeria - Ruegeria

Ruegeria
Научная классификация
Домен:
Тип:
Учебный класс:
Заказ:
Семья:
Род:
Ruegeria

Учино и другие. 1999
Типовой вид
Ruegeria atlantica (Рюгер и Хёфле, 1992) Учино и другие. 1999
Разновидность[1]
  • Ruegeria arenilitoris Пак и Юн 2013
  • Ruegeria atlantica (Рюгер и Хёфле, 1992) Учино и другие. 1999
  • Ruegeria conchae Ли и другие. 2012
  • Ruegeria faecimaris ой и другие. 2011
  • Ruegeria halocynthiae Ким и другие. 2012
  • Ruegeria intermedia Kämpfer и другие. 2013
  • Ruegeria lacuscaerulensis (Петурсдоттир и Кристьянссон, 1999) Йи и другие. 2007
  • Ruegeria Marina Хо и другие. 2011
  • Ruegeria mobilis Мурамацу и другие. 2007
  • Ruegeria pomeroyi (Гонсалес и другие. 2003) Йи и другие. 2007
  • Ruegeria scottomollicae Vandecandelaere и другие. 2008
Синонимы
  • Ruegeria Учино и другие. 1999 исправление. Мартенс и другие. 2006
  • Ruegeria Учино и другие. 1999 исправление. Йи и другие. 2007
  • Силицибактер Петурсдоттир и Кристьянссон, 1999 г.

В таксономия, Ruegeria это род из Rhodobacteraceae.[1] Этот род ранее был известен как морской Агробактерии прежде, чем они были реклассифицированы в 1998 году. Фактически он носит имя Ханса-Юргена Рюгера, немецкого микробиолога, за его вклад в таксономию морских видов Агробактерии.[2]

Характеристики

Род характеризуется членами, которые:[3]

  • Грамотрицательный (как и все протеобактерии)
  • яйцевидные до палочковидных клеток 0,6–1,6 × 1,0–4,0 мкм
  • подвижен полярными жгутиками или неподвижен
  • неспороверы
  • аэробный
  • оксидаза и каталаза положительные
  • неспособны к фотосинтетическому росту
  • бактериохлорофилл а отсутствует
  • основной хинон убихинон 10
  • моль% G + C ДНК составляет 55–59
  • член семьи Rhodobacteraceae, который фенотипически, метаболически, экологически разнообразен и определен на основе данных последовательностей 16S

Филогенетически очень близок к роду Силицибактер, но эти два вида остаются отдельными видами из-за фенотипических различий - два вида, для которых это проблематично, являются Ruegeria lacuscaerulensis и Ruegeria pomeroyi.[4][5]

Два вида, исключенных из этого рода, - это Marinovum algicola (Ruegeria algicola) и Thalassobius gelatinovorus (Ruegeria gelatinovora).[6][и ссылки в нем]

Малые некодирующие РНК

Очень много бактериальные малые РНК было показано, что они присутствуют в бактериях, подверженных хроническому ограничению питательных веществ. В Ruegeria pomeroyi Анализ RNAseq выявил 99 предполагаемых мРНК.[7] Механизмы регуляции бактериальных мРНК обычно основаны на прямом взаимодействии РНК-РНК с мРНК-мишенью.[8] Целевые группы генов, идентифицированные Rivers et al. были гены, участвующие в транспорте, гены, опосредующие межклеточные взаимодействия, передачу сигналов и регуляцию транскрипции.

Рекомендации

  1. ^ а б "Запись LPSN для Ruegeria". Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре. Получено 24 апреля 2014.
  2. ^ Утино Ю., Хирата А., Йокота А., Сугияма Дж. (1998). «Реклассификация морского Агробактерии виды: предложения Stappia stellulata ген. ноя, гребешок. ноя., Stappia aggregata sp. ноя, ном. изм., Ruegeria atlantica ген. нов., греб. ноя., Рюгерия желатиновора гребень. ноя., Ruegeria algicola гребень. ноя., и Аренсия Келиенсе ген. nov., sp. ноя, ном. rev ". J Gen Appl Microbiol. 44 (3): 201–210. Дои:10.2323 / jgam.44.201. PMID  12501429.
  3. ^ Дон Дж. Бреннер; Ноэль Р. Криг; Джеймс Т. Стейли (26 июля 2005 г.) [1984 (Уильямс и Уилкинс)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Протеобактерии. Руководство Берджи по систематической бактериологии. 2C (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. стр.1388. ISBN  978-0-387-24145-6. Британская библиотека № GBA561951.
  4. ^ YI (H.), LIM (Y.W.) и CHUN (J.): Таксономическая оценка родов Ruegeria и Silicibacter: предложение о переносе рода Silicibacter Petursdottir and Kristjansson 1999 в род Ruegeria Uchino et al. 1999. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2007, 57, 815-819.
  5. ^ МУРАМАЦУ (Ю.), УЧИНО (Ю.), КАСАЙ (Г.), СУЗУКИ (К.) и НАКАГАВА (Ю.): Ruegeria mobilis sp. nov., член группы Alphaproteobacteria, выделенной в Японии и Палау. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2007, 57, 1304-1309.
  6. ^ Въезд в Ruegeria в LPSN; Euzéby, J.P. (1997). «Список названий бактерий с позиции в номенклатуре: папка, доступная в Интернете». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 47 (2): 590–2. Дои:10.1099/00207713-47-2-590. PMID  9103655.
  7. ^ Риверс, Адам Р .; Бернс, Эндрю С .; Чан, Леонг-Кит; Моран, Мэри Энн (2016-01-01). «Экспериментальная идентификация малых некодирующих РНК в модельной морской бактерии Ruegeria pomeroyi DSS-3». Границы микробиологии. 7: 380. Дои:10.3389 / fmicb.2016.00380. ISSN  1664-302X. ЧВК  4809877. PMID  27065955.
  8. ^ Готтесман, Сьюзен; Сторц, Гизела (01.12.2011). «Бактериальные регуляторы малых РНК: универсальные роли и быстро меняющиеся вариации». Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии. 3 (12): a003798. Дои:10.1101 / cshperspect.a003798. ISSN  1943-0264. ЧВК  3225950. PMID  20980440.

дальнейшее чтение

Научные журналы

Научные книги

Научные базы данных

внешняя ссылка