S100A6 - S100A6

S100A6
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1К8У, 1К96, 1K9K, 1К9П, 2М1К, 4ГБ
Идентификаторы
Псевдонимы	S100A6, 2A9, 5B10, CABP, CACY, PRA, S100 кальций-связывающий белок A6, S10A6
Внешние идентификаторы	OMIM: 114110 MGI: 1339467 ГомолоГен: 7925 Генные карты: S100A6
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 1 (человек)
Конец	153,536,244 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 3 (мышь)
Конец	90,624,181 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание ионов кальция; • Связывание с белком S100; • активность гомодимеризации белков; • активность трансмембранного переносчика ионов; • связывание ионов цинка; • связывание ионов металлов; • кальций-зависимое связывание с белками; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание тропомиозина;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • цитозоль; • ядерная оболочка; • мембрана; • взъерошить; • внешний компонент цитоплазматической стороны плазматической мембраны; • клеточная мембрана; • перинуклеарная область цитоплазмы; • внеклеточная экзосома; • ядро клетки; • внеклеточная область; • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс;
Биологический процесс	• аксоногенез; • положительное регулирование пролиферации фибробластов; • трансмембранный перенос ионов; • преобразование сигнала;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6277
	20200
	ENSG00000197956
	ENSMUSG00000001025
	P06703
	P14069
	NM_014624
	NM_011313
	NP_055439
	NP_035443
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

S100 кальций-связывающий белок А6 (S100A6) это белок что у людей кодируется S100A6 ген.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков S100, содержащего 2 кальций-связывающих мотива EF-hand. Белки S100 локализованы в цитоплазме и / или ядре широкого круга клеток и участвуют в регуляции ряда клеточных процессов, таких как прогрессия и дифференцировка клеточного цикла. Гены S100 включают по крайней мере 13 членов, которые расположены в виде кластера на хромосоме 1q21. Этот белок может действовать при стимуляции Са2 + -зависимого высвобождения инсулина, стимуляции секреции пролактина и экзоцитоза. Хромосомные перестройки и измененная экспрессия этого гена связаны с меланомой.^[5]

Взаимодействия

S100A6 был показан взаимодействовать с участием S100B^[6]^[7] и SUGT1.^[8]

Патология

S100A6 следует указывать как возможный диагностический маркер папиллярная карцинома щитовидной железы.^[9]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000197956 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001025 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ^а ^б «Ген Entrez: S100A6 S100 кальций-связывающий белок A6».
^ Делульм Дж. К., Ассар Н., Мбеле Г. О., Мангин С., Кувано Р., Бодье Дж. (Ноябрь 2000 г.). «S100A6 и S100A11 являются специфическими мишенями для кальций- и цинк-связывающего белка S100B in vivo». J. Biol. Chem. 275 (45): 35302–10. Дои:10.1074 / jbc.M003943200. PMID 10913138.
^ Ян Кью, О'Ханлон Д., Хейцманн CW, Маркс А. (февраль 1999 г.). «Демонстрация образования гетеродимера между S100B и S100A6 в дрожжевой двугибридной системе и меланоме человека». Exp. Cell Res. 246 (2): 501–9. Дои:10.1006 / excr.1998.4314. PMID 9925766.
^ Новотны М., Шпехович М., Ястшебска Б., Филипек А., Китагава К., Кузницки Дж. (Июль 2003 г.). «Регулируемое кальцием взаимодействие Sgt1 с S100A6 (кальциклин) и другими белками S100». J. Biol. Chem. 278 (29): 26923–8. Дои:10.1074 / jbc.M211518200. PMID 12746458.
^ Софиадис А., Динец А., Орре Л. М., Бранка Р. М., Юлин С. К., Фукакис Т., Валлин Г., Хёг А., Хульчи М., Зедениус Дж., Ларссон С., Лехтиё Дж. (Октябрь 2010 г.). «Протеомное исследование опухолей щитовидной железы обнаруживает частую активацию Са2 + -связывающего белка S100A6 при папиллярной карциноме щитовидной железы». Щитовидная железа. 20 (10): 1067–76. Дои:10.1089 / ты.2009.0400. PMID 20629554.

дальнейшее чтение

Шефер Б.В., Хейцманн С.В. (1996). «Семейство S100 кальций-связывающих белков руки EF: функции и патология». Trends Biochem. Наука. 21 (4): 134–40. Дои:10.1016 / S0968-0004 (96) 80167-8. PMID 8701470.
Минами Х., Токумицу Х., Мизутани А., Ватанабэ Й., Ватанабэ М., Хидака Х. (1992). «Специфическое связывание CAP-50 с кальциклином». FEBS Lett. 305 (3): 217–9. Дои:10.1016/0014-5793(92)80671-3. PMID 1299619.
Энгелькамп Д., Шефер Б.В., Эрне П., Хейцманн К.В. (1992). «S100 альфа, CAPL и CACY: молекулярное клонирование и анализ экспрессии трех кальций-связывающих белков из сердца человека». Биохимия. 31 (42): 10258–64. Дои:10.1021 / bi00157a012. PMID 1384693.
Томида Ю., Терасава М., Кобаяси Р., Хидака Х. (1992). «Кальциклин и кальваскулин существуют в тромбоцитах человека». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 189 (3): 1310–6. Дои:10.1016 / 0006-291X (92) 90216-8. PMID 1482346.
Филипек А., Герке В., Вебер К., Кузницкий Дж. (1991). «Характеристика регулируемого клеточного цикла белка кальциклина из асцитных опухолевых клеток Эрлиха. Идентификация двух связывающих белков, полученных с помощью Ca2 (+) - зависимой аффинной хроматографии». Евро. J. Biochem. 195 (3): 795–800. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1991.tb15768.x. PMID 1999197.
Мерфи Л.С., Мерфи Л.Дж., Цуюки Д., Дакворт М.Л., Шиу Р.П. (1988). «Клонирование и характеристика кДНК, кодирующей высококонсервативный предполагаемый кальций-связывающий белок, идентифицированный антисывороткой против рецептора пролактина». J. Biol. Chem. 263 (5): 2397–401. PMID 2448309.
Габиус Х.Дж., Бардоси А., Габиус С., Хеллманн К.П., Карас М., Крацин Х. (1989). «Идентификация продукта гена, зависимого от клеточного цикла, как белка, связывающего сиаловую кислоту». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 163 (1): 506–12. Дои:10.1016 / 0006-291X (89) 92166-9. PMID 2775283.
Феррари С., Калабретта Б., Дериэль Дж. К., Баттини Р., Геццо Ф, Лаурет Э, Гриффин С., Эмануэль Б. С., Гурриери Ф., Базерга Р. (1987). «Структурный и функциональный анализ гена регулируемого роста человеческого кальциклина». J. Biol. Chem. 262 (17): 8325–32. PMID 3036810.
Калабретта Б., Баттини Р., Качмарек Л., де Риель Дж. К., Базерга Р. (1986). «Молекулярное клонирование кДНК для гена, индуцируемого фактором роста, с сильной гомологией с S-100, кальций-связывающим белком». J. Biol. Chem. 261 (27): 12628–32. PMID 3755724.
Шефер Б.В., Вики Р., Энгелькамп Д., Маттей М.Г., Хейцманн К.В. (1995). «Выделение клона YAC, покрывающего кластер из девяти генов S100 на хромосоме 1q21 человека: обоснование новой номенклатуры семейства кальций-связывающих белков S100». Геномика. 25 (3): 638–43. Дои:10.1016/0888-7543(95)80005-7. PMID 7759097.
Энгелькамп Д., Шефер Б.В., Маттей М.Г., Эрне П., Хейцманн К.В. (1993). «Шесть генов S100 сгруппированы на хромосоме 1q21 человека: идентификация двух генов, кодирующих два ранее неизвестных кальций-связывающих белка S100D и S100E». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 90 (14): 6547–51. Дои:10.1073 / пнас.90.14.6547. ЧВК 46969. PMID 8341667.
Филипек А, Войда У (1996). «p30, новый белок-мишень кальциклина мыши (S100A6)». Biochem. J. 320 (Pt 2) (Pt 2): 585–7. ЧВК 1217969. PMID 8973570.
Кордовска Дж, Стаффорд У.Ф., Ван Х.Л. (1998). «Ca2 + и Zn2 + связываются с разными сайтами и вызывают различные конформационные изменения в кальциклине человека». Евро. J. Biochem. 253 (1): 57–66. Дои:10.1046 / j.1432-1327.1998.2530057.x. PMID 9578461.
Ян Кью, О'Ханлон Д., Хейцманн К.В., Маркс А. (1999). «Демонстрация образования гетеродимера между S100B и S100A6 в дрожжевой двугибридной системе и меланоме человека». Exp. Cell Res. 246 (2): 501–9. Дои:10.1006 / excr.1998.4314. PMID 9925766.
Судо Т., Хидака Х (1999). «Характеристика сайта связывания кальциклина (S100A6) аннексина XI-A с помощью сайт-направленного мутагенеза». FEBS Lett. 444 (1): 11–4. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00014-9. PMID 10037139.
Делульм Дж. К., Ассар Н., Мбеле Г. О., Мангин С., Кувано Р., Бодье Дж. (2000). «S100A6 и S100A11 являются специфическими мишенями для кальций- и цинк-связывающего белка S100B in vivo». J. Biol. Chem. 275 (45): 35302–10. Дои:10.1074 / jbc.M003943200. PMID 10913138.
Ли Й, Ян Л., Цуй Дж. Т., Ли В. М., Го РФ, Лу Й.Й (2002). «Построение анализа репрезентативных различий кДНК на основе двух библиотек кДНК и идентификации генов экспрессии, индуцируемой чесноком, в клетках рака желудка человека». Мир J. Гастроэнтерол. 8 (2): 208–12. PMID 11925593.
Otterbein LR, Kordowska J, Witte-Hoffmann C, Wang CL, Dominguez R (2002). «Кристаллические структуры S100A6 в Ca (2 +) - свободном и Ca (2 +) - связанном состояниях: кальциевый сенсорный механизм белков S100 выявлен при атомном разрешении». Структура. 10 (4): 557–67. Дои:10.1016 / S0969-2126 (02) 00740-2. PMID 11937060.
Filipek A, Jastrzebska B, Nowotny M, Kuznicki J (2002). «CacyBP / SIP, кальциклин и белок, взаимодействующий с Siah-1, связывает белки EF-hand семейства S100». J. Biol. Chem. 277 (32): 28848–52. Дои:10.1074 / jbc.M203602200. PMID 12042313.

Эта статья о ген на хромосома человека 1 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000197956 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001025 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] а ^б «Ген Entrez: S100A6 S100 кальций-связывающий белок A6».

[pmid10913138-6] Делульм Дж. К., Ассар Н., Мбеле Г. О., Мангин С., Кувано Р., Бодье Дж. (Ноябрь 2000 г.). «S100A6 и S100A11 являются специфическими мишенями для кальций- и цинк-связывающего белка S100B in vivo». J. Biol. Chem. 275 (45): 35302–10. Дои:10.1074 / jbc.M003943200. PMID 10913138.

[pmid9925766-7] Ян Кью, О'Ханлон Д., Хейцманн CW, Маркс А. (февраль 1999 г.). «Демонстрация образования гетеродимера между S100B и S100A6 в дрожжевой двугибридной системе и меланоме человека». Exp. Cell Res. 246 (2): 501–9. Дои:10.1006 / excr.1998.4314. PMID 9925766.

[pmid12746458-8] Новотны М., Шпехович М., Ястшебска Б., Филипек А., Китагава К., Кузницки Дж. (Июль 2003 г.). «Регулируемое кальцием взаимодействие Sgt1 с S100A6 (кальциклин) и другими белками S100». J. Biol. Chem. 278 (29): 26923–8. Дои:10.1074 / jbc.M211518200. PMID 12746458.

[9] Софиадис А., Динец А., Орре Л. М., Бранка Р. М., Юлин С. К., Фукакис Т., Валлин Г., Хёг А., Хульчи М., Зедениус Дж., Ларссон С., Лехтиё Дж. (Октябрь 2010 г.). «Протеомное исследование опухолей щитовидной железы обнаруживает частую активацию Са2 + -связывающего белка S100A6 при папиллярной карциноме щитовидной железы». Щитовидная железа. 20 (10): 1067–76. Дои:10.1089 / ты.2009.0400. PMID 20629554.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]