S100B - S100B

S100B
Белок S100B PDB 1b4c.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыS100B, NEF, S100, S100-B, S100beta, S100 кальций-связывающий белок B
Внешние идентификаторыOMIM: 176990 MGI: 98217 ГомолоГен: 4567 Генные карты: S100B
Расположение гена (человек)
Хромосома 21 (человека)
Chr.Хромосома 21 (человека)[1]
Хромосома 21 (человека)
Геномное расположение S100B
Геномное расположение S100B
Группа21q22.3Начинать46,598,604 бп[1]
Конец46,605,208 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE S100B 209686 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

6285

20203

Ансамбль

ENSG00000160307

ENSMUSG00000033208

UniProt

P04271

P50114

RefSeq (мРНК)

NM_006272

NM_009115

RefSeq (белок)

NP_006263

NP_033141

Расположение (UCSC)Chr 21: 46.6 - 46.61 МбChr 10: 76,25 - 76,26 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

S100 кальций-связывающий белок B (S100B) является белком Белок S-100 семья.

Белки S100 локализованы в цитоплазме и ядре широкого круга клеток и участвуют в регуляции ряда клеточных процессов, таких как клеточный цикл прогрессия и дифференциация. Гены S100 включают по крайней мере 13 членов, которые расположены в виде кластера на хромосоме 1q21; однако этот ген расположен в 21q22.3.

Функция

S100B - это глиальный -специфичен и выражается в первую очередь астроциты, но не все астроциты экспрессируют S100B. Было показано, что S100B экспрессируется только подтипом зрелых астроцитов, которые покрывают кровеносные сосуды, и клетками, экспрессирующими NG2.[5]

Этот белок может функционировать в нейрит расширение, пролиферация клеток меланомы, стимуляция Са2+ потоки, ингибирование PKC -опосредованный фосфорилирование, астроцитоз и пролиферация аксонов и ингибирование сборки микротрубочек. В развивающихся ЦНС он действует как нейротрофический фактор и белок выживания нейронов. Во взрослом организме он обычно повышен из-за повреждения нервной системы, что делает его потенциальным клиническим маркером.

Клиническое значение

Хромосомные перестройки и измененная экспрессия этого гена была причастна к нескольким неврологическим, опухолевым и другим типам заболеваний, включая болезнь Альцгеймера, Синдром Дауна, эпилепсия, боковой амиотрофический склероз, шваннома, меланома, и сахарный диабет I типа.[6]

Было высказано предположение, что регулирование S100B мелиттин имеет потенциал для лечения эпилепсия.[7]

Диагностическое использование

S100B секретируется астроцитами или может выливаться из поврежденных клеток и попадать во внеклеточное пространство или кровоток. Уровни S100B в сыворотке крови повышаются у пациентов в острой фазе повреждения головного мозга. За последнее десятилетие S100B стал кандидатом на роль периферического биомаркера проницаемости гематоэнцефалического барьера (ГЭБ) и повреждения ЦНС. Повышенные уровни S100B точно отражают наличие невропатологических состояний, включая черепно-мозговая травма или нейродегенеративные заболевания. Нормальный уровень S100B надежно исключает серьезную патологию ЦНС. Его потенциальное клиническое использование в процессе принятия терапевтических решений подтверждается обширным объемом литературы, подтверждающей вариации уровней 100B в сыворотке со стандартными методами прогнозирования степени повреждения ЦНС: изменениями нейровизуализации, цереброспинального давления и других молекулярных маркеров мозга (нейрон-специфичных энолаза и глиальный фибриллярный кислый белок). Однако, что более важно, уровни S100B, как сообщается, повышаются до каких-либо обнаруживаемых изменений внутримозгового давления, результатов нейровизуализации и неврологического обследования. Таким образом, основным преимуществом использования S100B является то, что повышение уровня в сыворотке или спинномозговой жидкости обеспечивает чувствительную меру для определения повреждения ЦНС на молекулярном уровне до того, как разовьются серьезные изменения, что позволяет своевременно проводить решающее медицинское вмешательство до того, как произойдет необратимое повреждение. Уровни S100B в сыворотке крови повышаются перед приступами, что позволяет предположить, что утечка ГЭБ может быть ранним событием в развитии судорог.[8]Чрезвычайно важное применение теста S100B в сыворотке крови заключается в отборе пациентов с незначительной травмой головы, которые не нуждаются в дальнейшей нейрорадиологической оценке, поскольку исследования, сравнивающие компьютерную томографию и уровни S100B, показали, что значения S100B ниже 0,12 нг / мл связаны с низким риском очевидного нейрорадиологические изменения (такие как внутричерепное кровоизлияние или отек мозга) или значительные клинические последствия.[9] Превосходная отрицательная прогностическая ценность S100B при некоторых неврологических состояниях обусловлена ​​тем фактом, что уровни S100B в сыворотке отражают изменения проницаемости гематоэнцефалического барьера даже при отсутствии повреждения нейронов.[10][11]Кроме того, S100B, который также присутствует в меланоцитах человека, является надежным маркером злокачественной опухоли меланомы как в биоптической ткани, так и в сыворотке крови.[12][13]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при исследовании функции S100B. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая S100btm1a (EUCOMM) Wtsi[18][19] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект мутагенеза с высокой пропускной способностью для создания и распространения животных моделей болезней среди заинтересованных ученых - в Wellcome Trust Sanger Institute.[20][21][22]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[16][23] Было проведено 23 испытания на мутант мышей, но никаких существенных отклонений пока не наблюдалось.[16]

Взаимодействия

S100B был показан взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000160307 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000033208 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ван Д.Д., Бордей А. (декабрь 2008 г.). "Одиссея астроцитов". Прог. Нейробиол. 86 (4): 342–67. Дои:10.1016 / j.pneurobio.2008.09.015. ЧВК  2613184. PMID  18948166.
  6. ^ «Ген Entrez: кальций-связывающий белок B S100B S100».
  7. ^ Верма Н., Кармакар М., Сингх К. П., Смита С. (февраль 2013 г.). «Структурные и динамические исследования ингибирования активности белка S100B с помощью мелиттина для лечения эпилепсии». Международный журнал компьютерных приложений. NSAAILS (975–8887): 55–60.
  8. ^ Марчи Н., Ангелов Л., Масарик Т., Фацио В., Граната Т., Эрнандес Н., Халлен К., Диглоу Т., Франич Л., Наджм И., Янигро Д. (апрель 2007 г.). «Судорожный эффект нарушения гематоэнцефалического барьера». Эпилепсия. 48 (4): 732–42. Дои:10.1111 / j.1528-1167.2007.00988.x. ЧВК  4135474. PMID  17319915.
  9. ^ Zongo D, Ribéreau-Gayon R, Masson F, Laborey M, Contrand B, Salmi LR, Montaudon D, Beaudeux JL, Meurin A, Dousset V, Loiseau H, Lagarde E (2012). «Белок S100-B как инструмент скрининга для ранней оценки легкой травмы головы». Анналы неотложной медицины. 59 (1): 209–218. Дои:10.1016 / j.annemergmed.2011.07.027. PMID  21944878.
  10. ^ Чейслер Б.М., Янигро Д. (июнь 2006 г.). «Чтение и запись гематоэнцефалического барьера: актуальность для терапии». Последние патенты на открытие лекарств для ЦНС. 1 (2): 157–73. Дои:10.2174/157488906777452712. PMID  18221201.
  11. ^ Марчи Н., Кавалья М., Фацио В., Бхудиа С., Халлен К., Джанигро Д. (апрель 2004 г.). «Периферические маркеры повреждения гематоэнцефалического барьера». Clinica Chimica Acta. 342 (1–2): 1–12. Дои:10.1016 / j.cccn.2003.12.008. PMID  15026262.
  12. ^ Микетти Ф., Корвино В., Гелосо М.С., Латтанци В., Бернардини С., Серперо Л., Газзоло Д. (март 2012 г.). «Белок S100B в биологических жидкостях: более чем пожизненный биомаркер мозгового расстройства». J. Neurochem. 120 (5): 644–59. Дои:10.1111 / j.1471-4159.2011.07612.x. PMID  22145907. S2CID  205624114.
  13. ^ Кокчиа Д., Мичетти Ф., Донато Р. (ноябрь 1981 г.). «Иммунохимическая и иммуноцитохимическая локализация антигена S-100 в нормальной коже человека». Природа. 294 (5836): 85–7. Bibcode:1981Натура 294 ... 85С. Дои:10.1038 / 294085a0. PMID  7290214. S2CID  4333999.
  14. ^ "Сальмонелла данные о заражении S100b ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  15. ^ "Citrobacter данные о заражении S100b ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  16. ^ а б c Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88 (S248): 0. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  17. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  18. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  19. ^ "Информатика генома мыши".
  20. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  21. ^ Долгин Е. (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  22. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  23. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.
  24. ^ Джентиль Б.Дж., Дельфин С., Мбеле Г.О., Делульм Дж.С., Ферро М., Гарин Дж., Бодье Дж. (Июнь 2001 г.). «Гигантский белок AHNAK является специфической мишенью для кальций- и цинк-связывающего белка S100B: потенциальные последствия для регуляции гомеостаза Ca2 + с помощью S100B». J. Biol. Chem. 276 (26): 23253–61. Дои:10.1074 / jbc.M010655200. PMID  11312263.
  25. ^ Vig PJ, Shao Q, Subramony SH, Lopez ME, Safaya E (сентябрь 2009 г.). «Глиальный S100B Bergmann активирует мио-инозитолмонофосфатазу 1 и локализуется в вакуолях клеток Пуркинье у трансгенных мышей SCA1». Мозжечок. 8 (3): 231–44. Дои:10.1007 / s12311-009-0125-5. ЧВК  3351107. PMID  19593677.
  26. ^ Mbele GO, Deloulme JC, Gentil BJ, Delphin C, Ferro M, Garin J, Takahashi M, Baudier J (декабрь 2002 г.). «Связывающий цинк и кальций S100B взаимодействует и совместно локализуется с IQGAP1 во время динамической перестройки клеточных мембран». J. Biol. Chem. 277 (51): 49998–50007. Дои:10.1074 / jbc.M205363200. PMID  12377780.
  27. ^ Yu WH, Fraser PE (апрель 2001 г.). «Взаимодействие S100beta с тау стимулируется цинком и ингибируется гиперфосфорилированием при болезни Альцгеймера». J. Neurosci. 21 (7): 2240–6. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.21-07-02240.2001. ЧВК  6762409. PMID  11264299.
  28. ^ Бодье Дж., Коул Р. Д. (апрель 1988 г.). «Взаимодействия между тау-белками, ассоциированными с микротрубочками, и S100b регулируют фосфорилирование тау-белка Ca2 + / кальмодулин-зависимой протеинкиназой II». J. Biol. Chem. 263 (12): 5876–83. PMID  2833519.
  29. ^ Лин Дж., Ян Кью, Ян З., Марковиц Дж., Уайлдер П. Т., Кэрриер Ф, Вебер Д. Д. (август 2004 г.). «Ингибирование S100B восстанавливает уровни p53 в клетках первичной злокачественной меланомы». J. Biol. Chem. 279 (32): 34071–7. Дои:10.1074 / jbc.M405419200. PMID  15178678.
  30. ^ Ландар А., Кадделл Дж., Чешер Дж., Циммер Д.Б. (сентябрь 1996 г.). «Идентификация целевого белка S100A1 / S100B: фосфоглюкомутаза». Клеточный кальций. 20 (3): 279–85. Дои:10.1016 / S0143-4160 (96) 90033-0. PMID  8894274.
  31. ^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  32. ^ а б Ян Кью, О'Ханлон Д., Хейцманн CW, Маркс А. (февраль 1999 г.). «Демонстрация образования гетеродимера между S100B и S100A6 в дрожжевой двугибридной системе и меланоме человека». Exp. Cell Res. 246 (2): 501–9. Дои:10.1006 / excr.1998.4314. PMID  9925766.
  33. ^ а б Делульм Дж. К., Ассар Н., Мбеле Г. О., Мангин С., Кувано Р., Бодье Дж. (Ноябрь 2000 г.). «S100A6 и S100A11 являются специфическими мишенями для кальций- и цинк-связывающего белка S100B in vivo». J. Biol. Chem. 275 (45): 35302–10. Дои:10.1074 / jbc.M003943200. PMID  10913138.
  34. ^ Факлер О.Т., Ло В., Гейер М., Альбертс А.С., Петерлин Б.М. (июнь 1999 г.). «Активация Vav с помощью Nef вызывает перестройки цитоскелета и последующие эффекторные функции». Мол. Клетка. 3 (6): 729–39. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 80005-8. PMID  10394361.

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.