SMARCD1 - SMARCD1
Связанный с SWI / SNF матрикс-зависимый актин-зависимый регулятор хроматина подсемейства D член 1 это белок что у людей кодируется SMARCD1 ген.[5][6][7][8]
Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков SWI / SNF, члены которого проявляют активность геликазы и АТФазы и которые, как полагают, регулируют транскрипцию определенных генов, изменяя структуру хроматина вокруг этих генов. Кодируемый белок является частью большого АТФ-зависимого комплекса ремоделирования хроматина SNF / SWI и имеет сходство последовательностей с дрожжевым белком Swp73. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.[8]
Взаимодействия
SMARCD1 был показан взаимодействовать с участием Рецептор глюкокортикоидов.[7]
использованная литература
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000066117 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023018 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Ван В., Сюэ Ю., Чжоу С., Го А., Кэрнс Б. Р., Крэбтри Г. Р. (ноябрь 1996 г.). «Разнообразие и специализация комплексов SWI / SNF млекопитающих». Genes Dev. 10 (17): 2117–30. Дои:10.1101 / gad.10.17.2117. PMID 8804307.
- ^ Ring HZ, Vameghi-Meyers V, Wang W, Crabtree GR, Francke U (сентябрь 1998 г.). «Пять генов SWI / SNF-связанных, связанных с матрицей, актин-зависимых регуляторов хроматина (SMARC) рассредоточены в геноме человека». Геномика. 51 (1): 140–3. Дои:10.1006 / geno.1998.5343. PMID 9693044.
- ^ а б Сяо П.В., Фрайер СиДжей, Троттер К.В., Ван В., Арчер Т.К. (август 2003 г.). «BAF60a опосредует критические взаимодействия между ядерными рецепторами и комплексом ремоделирования хроматина BRG1 для трансактивации». Mol Cell Biol. 23 (17): 6210–20. Дои:10.1128 / MCB.23.17.6210-6220.2003. ЧВК 180928. PMID 12917342.
- ^ а б «Ген Entrez: SMARCD1, связанный с SWI / SNF, связанный с матрицей, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство d, член 1».
дальнейшее чтение
- Хиллер Л.Д., Леннон Г., Беккер М. и др. (1997). «Создание и анализ 280 000 тегов последовательности, экспрессируемых человеком». Genome Res. 6 (9): 807–28. Дои:10.1101 / гр.6.9.807. PMID 8889549.
- Ван В., Коте Дж., Сюэ И и др. (1996). «Очистка и биохимическая гетерогенность комплекса SWI-SNF млекопитающих». EMBO J. 15 (19): 5370–82. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00921.x. ЧВК 452280. PMID 8895581.
- Cho H, Orphanides G, Sun X и др. (1998). «Комплекс человеческой РНК-полимеразы II, содержащий факторы, изменяющие структуру хроматина». Мол. Cell. Биол. 18 (9): 5355–63. Дои:10.1128 / MCB.18.9.5355. ЧВК 109120. PMID 9710619.
- O'Neill D, Yang J, Erdjument-Bromage H, et al. (1999). «Тканеспецифическое связывание ДНК, специфичное для стадии развития, комплексом SWI / SNF млекопитающих, связанное с переключением генов глобина человека от плода к взрослому человеку». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (2): 349–54. Дои:10.1073 / пнас.96.2.349. ЧВК 15139. PMID 9892636.
- Фелан ML, Sif S, Narlikar GJ, Kingston RE (1999). «Реконструкция основного комплекса ремоделирования хроматина из субъединиц SWI / SNF». Мол. Ячейка. 3 (2): 247–53. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80315-9. PMID 10078207.
- Ито Т., Ямаути М., Нишина М. и др. (2001). «Идентификация субъединицы BAF60a комплекса SWI.SNF как детерминанта трансактивационного потенциала димеров Fos / Jun». J. Biol. Chem. 276 (4): 2852–7. Дои:10.1074 / jbc.M009633200. PMID 11053448.
- Xue Y, Canman JC, Lee CS и др. (2001). «Ремоделирующий хроматин SWI / SNF-B комплекс человека связан с дрожжевым rsc и локализуется на кинетохорах митотических хромосом». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (24): 13015–20. Дои:10.1073 / pnas.240208597. ЧВК 27170. PMID 11078522.
- Като Х., Тьернберг А., Чжан В. и др. (2002). «SYT связывается с человеческими комплексами SNF / SWI, а С-концевой регион его партнера по слиянию SSX1 нацелен на гистоны». J. Biol. Chem. 277 (7): 5498–505. Дои:10.1074 / jbc.M108702200. PMID 11734557.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Nie Z, Yan Z, Chen EH и др. (2003). «Новые комплексы ремоделирования хроматина SWI / SNF содержат партнера по хромосомной транслокации при лейкемии смешанного происхождения». Мол. Cell. Биол. 23 (8): 2942–52. Дои:10.1128 / MCB.23.8.2942-2952.2003. ЧВК 152562. PMID 12665591.
- Чиен С.Ю., Лю В.К., Чжоу С.К., Су Дж.Й. (2003). «A20-связывающий белок ABIN-2 выполняет неожиданную функцию, опосредуя коактивацию транскрипции». FEBS Lett. 543 (1–3): 55–60. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00401-0. PMID 12753905. S2CID 31400521.
- Китагава Х., Фуджики Р., Йошимура К. и др. (2003). «Комплекс WINAC, ремоделирующий хроматин, нацеливается на ядерный рецептор на промоторы и нарушается при синдроме Вильямса». Ячейка. 113 (7): 905–17. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00436-7. PMID 12837248.
- Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С. и др. (2005). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Nat. Биотехнология. 22 (6): 707–16. Дои:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК 1356129. PMID 16344560.
- Ассманн Э.М., Альборгетти М.Р., Камарго М.Э., Кобарг Дж. (2006). «Димеризация FEZ1 и взаимодействие с белками, регулирующими транскрипцию, включает его область спиральной спирали». J. Biol. Chem. 281 (15): 9869–81. Дои:10.1074 / jbc.M513280200. PMID 16484223.
Эта статья о ген на хромосома человека 12 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |