SMARCD1 - SMARCD1

SMARCD1
Белок SMARCD1 PDB 1uhr.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSMARCD1, BAF60A, CRACD1, Rsc6p, связанный с SWI / SNF, связанный с матрицей, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство d, член 1, CSS11
Внешние идентификаторыOMIM: 601735 MGI: 1933623 ГомолоГен: 20670 Генные карты: SMARCD1
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение SMARCD1
Геномное расположение SMARCD1
Группа12q13.12Начните50,085,200 бп[1]
Конец50,100,707 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SMARCD1 209518 в формате fs.png

PBB GE SMARCD1 203183 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003076
NM_139071

NM_031842

RefSeq (белок)

NP_003067
NP_620710

NP_114030

Расположение (UCSC)Chr 12: 50.09 - 50,1 МбChr 15: 99,7 - 99,71 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Связанный с SWI / SNF матрикс-зависимый актин-зависимый регулятор хроматина подсемейства D член 1 это белок что у людей кодируется SMARCD1 ген.[5][6][7][8]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков SWI / SNF, члены которого проявляют активность геликазы и АТФазы и которые, как полагают, регулируют транскрипцию определенных генов, изменяя структуру хроматина вокруг этих генов. Кодируемый белок является частью большого АТФ-зависимого комплекса ремоделирования хроматина SNF / SWI и имеет сходство последовательностей с дрожжевым белком Swp73. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.[8]

Взаимодействия

SMARCD1 был показан взаимодействовать с участием Рецептор глюкокортикоидов.[7]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000066117 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023018 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ван В., Сюэ Ю., Чжоу С., Го А., Кэрнс Б. Р., Крэбтри Г. Р. (ноябрь 1996 г.). «Разнообразие и специализация комплексов SWI / SNF млекопитающих». Genes Dev. 10 (17): 2117–30. Дои:10.1101 / gad.10.17.2117. PMID  8804307.
  6. ^ Ring HZ, Vameghi-Meyers V, Wang W, Crabtree GR, Francke U (сентябрь 1998 г.). «Пять генов SWI / SNF-связанных, связанных с матрицей, актин-зависимых регуляторов хроматина (SMARC) рассредоточены в геноме человека». Геномика. 51 (1): 140–3. Дои:10.1006 / geno.1998.5343. PMID  9693044.
  7. ^ а б Сяо П.В., Фрайер СиДжей, Троттер К.В., Ван В., Арчер Т.К. (август 2003 г.). «BAF60a опосредует критические взаимодействия между ядерными рецепторами и комплексом ремоделирования хроматина BRG1 для трансактивации». Mol Cell Biol. 23 (17): 6210–20. Дои:10.1128 / MCB.23.17.6210-6220.2003. ЧВК  180928. PMID  12917342.
  8. ^ а б «Ген Entrez: SMARCD1, связанный с SWI / SNF, связанный с матрицей, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство d, член 1».

дальнейшее чтение