SNW1 - SNW1

SNW1
Идентификаторы
Псевдонимы	SNW1, Bx42, NCOA-62, PRPF45, Prp45, SKIIP, SKIP, домен SNW, содержащий 1, SKIP1, FUN20
Внешние идентификаторы	OMIM: 603055 MGI: 1913604 ГомолоГен: 56557 Генные карты: SNW1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 14 (человек)
Конец	77,761,207 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 12 (мышь)
Конец	87,472,274 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность; • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции; • связывание рецептора ядерного гормона; • Крепление с выемкой; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание рецептора ретиноевой кислоты; • Привязка SMAD; • связывание рецептора витамина D; • Связывание РНК; • связывание ферментов; • связывание рецепторов андрогенов;
Сотовый компонент	• каталитическая стадия 2 сплайсосомы; • ядерная матрица; • нуклеоплазма; • циклин / CDK положительный комплекс фактора элонгации транскрипции; • сплайсосомальный комплекс; • ядро клетки; • ядерное тело; • сплайсосомный комплекс после высвобождения мРНК; • ядерное пятнышко; • Каталитическая сплайсосома 2-го типа U2;
Биологический процесс	• Notch сигнальный путь; • клеточный ответ на ретиноевую кислоту; • положительная регуляция сигнального пути бета-рецептора трансформирующего фактора роста; • внутренний апоптотический сигнальный путь в ответ на повреждение ДНК медиатором класса p53; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • положительная регуляция сплайсинга мРНК через сплайсосомы; • регуляция сигнального пути рецептора ретиноевой кислоты; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • обработка мРНК; • регуляция сигнального пути рецептора витамина D; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • положительная регуляция нейрогенеза; • сигнальный путь рецептора ретиноевой кислоты; • положительная регуляция метилирования гистона H3-K4; • Сплайсинг РНК; • положительная регуляция сигнального пути рецептора витамина D; • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • GO: 0022415 вирусный процесс; • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • положительная регуляция вирусной транскрипции хозяином; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция, ДНК-шаблон; • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы; • создание каталитических сплайсосом для второй стадии переэтерификации; • позитивная регуляция транскрипции мишени рецептора Notch; • положительная регуляция сигнального пути Notch;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	22938
	66354
	ENSG00000100603
	ENSMUSG00000021039
	Q13573
	Q9CSN1
	NM_012245; NM_001318844
	NM_025507
	NP_001305773; NP_036377
	NP_079783
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Белок, содержащий домен SNW 1 это белок что у людей кодируется SNW1 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген, член семейства генов SNW, кодирует коактиватор, усиливающий транскрипцию с некоторых промоторов Pol II. Этот коактиватор может связываться с лиганд-связывающим доменом рецептора витамина D и с ретиноидными рецепторами для усиления экспрессии генов, опосредованных витамином D, ретиноевой кислотой, эстрогеном и глюкокортикоидами. Он также может функционировать как фактор сплайсинга, взаимодействуя с поли (A) -связывающим белком 2, чтобы напрямую контролировать экспрессию специфичных для мышц генов на уровне транскрипции. Наконец, белок может участвовать в онкогенезе, поскольку он взаимодействует с областью онкопротеинов SKI, которая необходима для трансформирующей активности.^[7]

Взаимодействия

SNW1 был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100603 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021039 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Folk P, Půta F, Krpejsová L, Blahůsková A, Markos A, Rabino M, Dottin RP (ноябрь 1996 г.). «Гомолог хроматин-связывающего белка Bx42, идентифицированный в Dictyostelium». Ген. 181 (1–2): 229–31. Дои:10.1016 / S0378-1119 (96) 00483-0. PMID 8973337.
^ ^а ^б Баудино Т.А., Крайчели Д.М., Джефкоат СК, Винчестер СК, Партридж Северная Каролина, Макдональд П.Н. (июнь 1998 г.). «Выделение и характеристика нового белка-коактиватора NCoA-62, участвующего в опосредованной витамином D транскрипции». Журнал биологической химии. 273 (26): 16434–41. Дои:10.1074 / jbc.273.26.16434. PMID 9632709.
^ ^а ^б "Entrez Gene: SNW1 домен SNW, содержащий 1".
^ ^а ^б ^c ^d Чжоу С., Фуджимуро М., Се Дж.Дж., Чен Л., Хейворд С.Д. (февраль 2000 г.). «Роль SKIP в активации EBNA2 промоторов, репрессированных CBF1». Журнал вирусологии. 74 (4): 1939–47. Дои:10.1128 / jvi.74.4.1939-1947.2000. ЧВК 111672. PMID 10644367.
^ ^а ^б Чжан С., Баудино Т.А., Дауд Д.Р., Токумару Х., Ван В., Макдональд П.Н. (ноябрь 2001 г.). «Тернарные комплексы и совместное взаимодействие между NCoA-62 / Ski-взаимодействующим белком и коактиваторами стероидных рецепторов в транскрипции, опосредованной рецептором витамина D». Журнал биологической химии. 276 (44): 40614–20. Дои:10.1074 / jbc.M106263200. PMID 11514567.
^ ^а ^б ^c Леонг Г. М., Субраманиам Н., Фигероа Дж., Фланаган Дж. Л., Хейман М. Дж., Эйсман Дж. А., Кузьменко А. П. (май 2001 г.). «Белок, взаимодействующий с лыжами, взаимодействует с белками Smad, усиливая трансформирующую бета-зависимую транскрипцию фактора роста». Журнал биологической химии. 276 (21): 18243–8. Дои:10.1074 / jbc.M010815200. PMID 11278756.
^ ^а ^б ^c Чжоу С., Фуджимуро М., Се Дж.Дж., Чен Л., Миямото А., Вайнмастер Г., Хейворд С.Д. (апрель 2000 г.). «SKIP, CBF1-ассоциированный белок, взаимодействует с доменом анкиринового повтора NotchIC, чтобы облегчить функцию NotchIC». Молекулярная и клеточная биология. 20 (7): 2400–10. Дои:10.1128 / mcb.20.7.2400-2410.2000. ЧВК 85419. PMID 10713164.
^ Беатус П., Лундквист Дж., Оберг С., Педерсен К., Лендаль Ю. (июнь 2001 г.). «Происхождение области анкиринового повтора во внутриклеточных доменах Notch имеет решающее значение для регуляции активности промотора HES». Механизмы развития. 104 (1–2): 3–20. Дои:10.1016 / s0925-4773 (01) 00373-2. PMID 11404076.
^ Ким Й.Дж., Ногучи С., Хаяси Ю.К., Цукахара Т., Симидзу Т., Арахата К. (май 2001 г.). «Продукт гена окулофарингеальной мышечной дистрофии, поли (A) -связывающий белок 2, взаимодействует с SKIP и стимулирует экспрессию гена, специфичного для мышц». Молекулярная генетика человека. 10 (11): 1129–39. Дои:10.1093 / hmg / 10.11.1129. PMID 11371506.
^ Пратапам Т., Кюне С., Бэнкс Л. (декабрь 2002 г.). «Skip взаимодействует с супрессором опухоли ретинобластомы и ингибирует его активность репрессии транскрипции». Исследования нуклеиновых кислот. 30 (23): 5261–8. Дои:10.1093 / nar / gkf658. ЧВК 137971. PMID 12466551.
^ Пратапам Т., Кюне С., Хейман М., Бэнкс Л. (сентябрь 2001 г.). «Ski взаимодействует с эволюционно консервативным доменом SNW Skip». Исследования нуклеиновых кислот. 29 (17): 3469–76. Дои:10.1093 / nar / 29.17.3469. ЧВК 55893. PMID 11522815.
^ Даль Р., Вани Б., Хейман М.Дж. (март 1998 г.). «Онкопротеин Ski взаимодействует с Skip, человеческим гомологом Drosophila Bx42». Онкоген. 16 (12): 1579–86. Дои:10.1038 / sj.onc.1201687. PMID 9569025.

дальнейшее чтение

Даль Р., Вани Б., Хейман М.Дж. (март 1998 г.). «Онкопротеин Ski взаимодействует с Skip, человеческим гомологом Drosophila Bx42». Онкоген. 16 (12): 1579–86. Дои:10.1038 / sj.onc.1201687. PMID 9569025.
Чжоу С., Фуджимуро М., Се Дж.Дж., Чен Л., Хейворд С.Д. (февраль 2000 г.). «Роль SKIP в активации EBNA2 промоторов, репрессированных CBF1». Журнал вирусологии. 74 (4): 1939–47. Дои:10.1128 / JVI.74.4.1939-1947.2000. ЧВК 111672. PMID 10644367.
Чжоу С., Фуджимуро М., Се Дж.Дж., Чен Л., Миямото А., Вайнмастер Г., Хейворд С.Д. (апрель 2000 г.). «SKIP, CBF1-ассоциированный белок, взаимодействует с доменом анкиринового повтора NotchIC, чтобы облегчить функцию NotchIC». Молекулярная и клеточная биология. 20 (7): 2400–10. Дои:10.1128 / MCB.20.7.2400-2410.2000. ЧВК 85419. PMID 10713164.
Леонг Г.М., Субраманиам Н., Фигероа Дж., Фланаган Дж. Л., Хейман М.Дж., Эйсман Дж. А., Кузьменко А.П. (май 2001 г.). «Белок, взаимодействующий с лыжами, взаимодействует с белками Smad, усиливая трансформирующую бета-зависимую транскрипцию фактора роста». Журнал биологической химии. 276 (21): 18243–8. Дои:10.1074 / jbc.M010815200. PMID 11278756.
Ким Й.Дж., Ногучи С., Хаяси Ю.К., Цукахара Т., Симидзу Т., Арахата К. (май 2001 г.). «Продукт гена окулофарингеальной мышечной дистрофии, поли (A) -связывающий белок 2, взаимодействует с SKIP и стимулирует экспрессию гена, специфичного для мышц». Молекулярная генетика человека. 10 (11): 1129–39. Дои:10.1093 / hmg / 10.11.1129. PMID 11371506.
Беатус П., Лундквист Дж., Оберг С., Педерсен К., Лендаль Ю. (июнь 2001 г.). «Происхождение области анкиринового повтора во внутриклеточных доменах Notch имеет решающее значение для регуляции активности промотора HES». Механизмы развития. 104 (1–2): 3–20. Дои:10.1016 / S0925-4773 (01) 00373-2. PMID 11404076.
Чжоу С., Хейворд С.Д. (сентябрь 2001 г.). «Ядерная локализация CBF1 регулируется взаимодействием с корепрессорным комплексом SMRT». Молекулярная и клеточная биология. 21 (18): 6222–32. Дои:10.1128 / MCB.21.18.6222-6232.2001. ЧВК 87339. PMID 11509665.
Чжан С., Баудино Т.А., Дауд Д.Р., Токумару Х., Ван В., Макдональд П.Н. (ноябрь 2001 г.). «Тернарные комплексы и совместное взаимодействие между NCoA-62 / Ski-взаимодействующим белком и коактиваторами стероидных рецепторов в транскрипции, опосредованной рецептором витамина D». Журнал биологической химии. 276 (44): 40614–20. Дои:10.1074 / jbc.M106263200. PMID 11514567.
Пратапам Т., Кюне С., Хейман М., Бэнкс Л. (сентябрь 2001 г.). «Ski взаимодействует с эволюционно консервативным доменом SNW Skip». Исследования нуклеиновых кислот. 29 (17): 3469–76. Дои:10.1093 / nar / 29.17.3469. ЧВК 55893. PMID 11522815.
Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р., Григорьев Н., Мур М.Дж. (апрель 2002 г.). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, пригодных для трехмерного структурного анализа». РНК. 8 (4): 426–39. Дои:10.1017 / S1355838202021088. ЧВК 1370266. PMID 11991638.
Wardell SE, Boonyaratanakornkit V, Adelman JS, Aronheim A, Edwards DP (август 2002 г.). «Белок димеризации Jun 2 действует как коактиватор N-концевого домена рецептора прогестерона». Молекулярная и клеточная биология. 22 (15): 5451–66. Дои:10.1128 / MCB.22.15.5451-5466.2002. ЧВК 133955. PMID 12101239.
Пратапам Т., Кюне С., Бэнкс Л. (декабрь 2002 г.). «Skip взаимодействует с супрессором опухоли ретинобластомы и ингибирует его активность репрессии транскрипции». Исследования нуклеиновых кислот. 30 (23): 5261–8. Дои:10.1093 / nar / gkf658. ЧВК 137971. PMID 12466551.
Петерсен Х. Х., Хильперт Дж., Милитц Д., Зандлер В., Якобсен К., Роебрук А. Дж., Виллнов Т. Е. (февраль 2003 г.). «Функциональное взаимодействие мегалина с мегалинсвязывающим белком (MegBP), новой адаптерной молекулой, содержащей тетратрико-пептидный повтор». Журнал клеточной науки. 116 (Pt 3): 453–61. Дои:10.1242 / jcs.00243. PMID 12508107.
Барри Дж. Б., Леонг Г. М., Черч В. Б., Исса Л. Л., Эйсман Дж. А., Гардинер Е. М. (март 2003 г.). «Взаимодействие SKIP / NCoA-62, TFIIB и рецептора ретиноида X с остатками спирали H10 рецептора витамина D». Журнал биологической химии. 278 (10): 8224–8. Дои:10.1074 / jbc.C200712200. PMID 12529369.
Чжан К., Дауд Д.Р., Стаал А., Гу С., Лиан Дж. Б., ван Вейнен А.Дж., Штейн Г.С., Макдональд П.Н. (сентябрь 2003 г.). «Ядерный коактиватор-62 кДа / Ski-взаимодействующий белок представляет собой коактиватор, связанный с ядерным матриксом, который может связывать опосредованную рецептором витамина D транскрипцию и сплайсинг РНК». Журнал биологической химии. 278 (37): 35325–36. Дои:10.1074 / jbc.M305191200. PMID 12840015.
Леонг Г.М., Субраманиам Н., Исса Л.Л., Барри Дж. Б., Кино Т., Дриггерс П. Х., Хейман М. Дж., Эйсман Дж. А., Гардинер Е. М. (март 2004 г.). «Ski-взаимодействующий белок, бифункциональный корегулятор ядерного рецептора, который взаимодействует с N-CoR / SMRT и p300». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 315 (4): 1070–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.02.004. PMID 14985122.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100603 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021039 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8973337-5] Folk P, Půta F, Krpejsová L, Blahůsková A, Markos A, Rabino M, Dottin RP (ноябрь 1996 г.). «Гомолог хроматин-связывающего белка Bx42, идентифицированный в Dictyostelium». Ген. 181 (1–2): 229–31. Дои:10.1016 / S0378-1119 (96) 00483-0. PMID 8973337.

[pmid9632709-6] а ^б Баудино Т.А., Крайчели Д.М., Джефкоат СК, Винчестер СК, Партридж Северная Каролина, Макдональд П.Н. (июнь 1998 г.). «Выделение и характеристика нового белка-коактиватора NCoA-62, участвующего в опосредованной витамином D транскрипции». Журнал биологической химии. 273 (26): 16434–41. Дои:10.1074 / jbc.273.26.16434. PMID 9632709.

[entrez-7] а ^б "Entrez Gene: SNW1 домен SNW, содержащий 1".

[pmid10644367-8] а ^б ^c ^d Чжоу С., Фуджимуро М., Се Дж.Дж., Чен Л., Хейворд С.Д. (февраль 2000 г.). «Роль SKIP в активации EBNA2 промоторов, репрессированных CBF1». Журнал вирусологии. 74 (4): 1939–47. Дои:10.1128 / jvi.74.4.1939-1947.2000. ЧВК 111672. PMID 10644367.

[pmid11514567-9] а ^б Чжан С., Баудино Т.А., Дауд Д.Р., Токумару Х., Ван В., Макдональд П.Н. (ноябрь 2001 г.). «Тернарные комплексы и совместное взаимодействие между NCoA-62 / Ski-взаимодействующим белком и коактиваторами стероидных рецепторов в транскрипции, опосредованной рецептором витамина D». Журнал биологической химии. 276 (44): 40614–20. Дои:10.1074 / jbc.M106263200. PMID 11514567.

[pmid11278756-10] а ^б ^c Леонг Г. М., Субраманиам Н., Фигероа Дж., Фланаган Дж. Л., Хейман М. Дж., Эйсман Дж. А., Кузьменко А. П. (май 2001 г.). «Белок, взаимодействующий с лыжами, взаимодействует с белками Smad, усиливая трансформирующую бета-зависимую транскрипцию фактора роста». Журнал биологической химии. 276 (21): 18243–8. Дои:10.1074 / jbc.M010815200. PMID 11278756.

[pmid10713164-11] а ^б ^c Чжоу С., Фуджимуро М., Се Дж.Дж., Чен Л., Миямото А., Вайнмастер Г., Хейворд С.Д. (апрель 2000 г.). «SKIP, CBF1-ассоциированный белок, взаимодействует с доменом анкиринового повтора NotchIC, чтобы облегчить функцию NotchIC». Молекулярная и клеточная биология. 20 (7): 2400–10. Дои:10.1128 / mcb.20.7.2400-2410.2000. ЧВК 85419. PMID 10713164.

[pmid11404076-12] Беатус П., Лундквист Дж., Оберг С., Педерсен К., Лендаль Ю. (июнь 2001 г.). «Происхождение области анкиринового повтора во внутриклеточных доменах Notch имеет решающее значение для регуляции активности промотора HES». Механизмы развития. 104 (1–2): 3–20. Дои:10.1016 / s0925-4773 (01) 00373-2. PMID 11404076.

[pmid11371506-13] Ким Й.Дж., Ногучи С., Хаяси Ю.К., Цукахара Т., Симидзу Т., Арахата К. (май 2001 г.). «Продукт гена окулофарингеальной мышечной дистрофии, поли (A) -связывающий белок 2, взаимодействует с SKIP и стимулирует экспрессию гена, специфичного для мышц». Молекулярная генетика человека. 10 (11): 1129–39. Дои:10.1093 / hmg / 10.11.1129. PMID 11371506.

[pmid12466551-14] Пратапам Т., Кюне С., Бэнкс Л. (декабрь 2002 г.). «Skip взаимодействует с супрессором опухоли ретинобластомы и ингибирует его активность репрессии транскрипции». Исследования нуклеиновых кислот. 30 (23): 5261–8. Дои:10.1093 / nar / gkf658. ЧВК 137971. PMID 12466551.

[pmid11522815-15] Пратапам Т., Кюне С., Хейман М., Бэнкс Л. (сентябрь 2001 г.). «Ski взаимодействует с эволюционно консервативным доменом SNW Skip». Исследования нуклеиновых кислот. 29 (17): 3469–76. Дои:10.1093 / nar / 29.17.3469. ЧВК 55893. PMID 11522815.

[pmid9569025-16] Даль Р., Вани Б., Хейман М.Дж. (март 1998 г.). «Онкопротеин Ski взаимодействует с Skip, человеческим гомологом Drosophila Bx42». Онкоген. 16 (12): 1579–86. Дои:10.1038 / sj.onc.1201687. PMID 9569025.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]