SSR4 - SSR4

SSR4
Идентификаторы
ПсевдонимыSSR4, TRAPD, CDG1Y, субъединица рецептора сигнальной последовательности 4
Внешние идентификаторыOMIM: 300090 MGI: 1099464 ГомолоГен: 4573 Генные карты: SSR4
Расположение гена (человек)
Х-хромосома (человек)
Chr.Х-хромосома (человек)[1]
Х-хромосома (человек)
Геномное расположение SSR4
Геномное расположение SSR4
ГруппаXq28Начинать153,793,516 бп[1]
Конец153,798,499 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SSR4 201004 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001204526
NM_001204527
NM_006280

NM_001166480
NM_009279
NM_001358212
NM_001358213

RefSeq (белок)

NP_001191455
NP_001191456
NP_006271

NP_001159952
NP_033305
NP_001345141
NP_001345142

Расположение (UCSC)Chr X: 153,79 - 153,8 МбChr X: 73,79 - 73,79 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Транслокон-ассоциированная белковая субъединица дельта это белок что у людей кодируется SSR4 ген.[5][6]

Предполагается, что SSR4, также называемый TRAPD, участвует в секреция белка. Он расположен в Xq28 области, расположенные компактно лицом к лицу с IDH3G ген. Эти два гена управляются двунаправленным промоутер расположены между ними, и кодируют белки, участвующие в неродственных биохимические пути расположены в разных отсеках клетки. Нетранскрибируемая межгенная область представляет собой всего 133 п.н. и встроена в Остров CpG. Островок CpG действует как двунаправленный промотор, инициирующий транскрипция обоих функционально неродственных генов с разными выражение узоры. SSR4 состоит из шести экзоны и является теломерным по отношению к гену ALD примерно в 70 т.п.н. Несмотря на то что альтернативное сращивание экзона 5 не обнаружен в человеческом SSR4, варианты транскрипта, в которых отсутствует область, гомологичная экзону 5 человека, были обнаружены в обоих Xenopus laevis и Mus musculus.[6]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000180879 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000002014 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Бреннер В., Ньякатура Г., Розенталь А., Платцер М. (ноябрь 1997 г.). «Геномная организация двух новых генов на человеческом Xq28: компактное расположение IDH гамма и TRAP дельта голова к голове сохраняется у крысы и мыши». Геномика. 44 (1): 8–14. Дои:10.1006 / geno.1997.4822. PMID  9286695.
  6. ^ а б «Ген Entrez: рецептор сигнальной последовательности SSR4, дельта (дельта-белок, связанный с транслоконом)».

дальнейшее чтение