Salmonella enterica subsp. Enterica - Salmonella enterica subsp. enterica

Salmonella enterica subsp. Enterica
Salmonella enterica serovar typhimurium 01.jpg
Сальмонелла Колонии тифимуриума на Пластина с энтеросолюбильным агаром Hektoen
Научная классификация редактировать
Домен:Бактерии
Тип:Протеобактерии
Учебный класс:Гаммапротеобактерии
Заказ:Enterobacterales
Семья:Энтеробактерии
Род:Сальмонелла
Разновидность:
S. enterica
Подвиды:
S. e. subsp. Enterica
Трехчленное имя
Salmonella enterica subsp. Enterica

Salmonella enterica subsp. Enterica это подвид Salmonella enterica, стержневидный, бичеванный, аэробный, Грамотрицательный бактерия. Многие патогенные серовары из S. enterica виды находятся в этом подвид, в том числе ответственный за брюшной тиф.[1]

Серовары

S. enterica subsp. enterica содержит большое количество сероваров, которые могут инфицировать широкий спектр позвоночное животное хосты. Индивидуальные члены варьируются от хорошо адаптированных к хозяину (способных инфицировать лишь узкий круг видов) до отображения широкого круга хозяев. В настоящее время используется ряд методов, чтобы различать серотипы. К ним относятся поиски наличия или отсутствия антигены, фаговое типирование молекулярный фингерпринт и биотипирование, при котором серовары различаются по питательным веществам, которые они способны ферментировать. Возможным фактором в определении диапазона конкретных сероваров-хозяев является опосредованное фагом приобретение небольшого количества генетических элементов, которые делают возможной инфекцию конкретного хозяина.[2] Далее предполагается, что серовары, которые инфицируют узкий круг видов, отошли от предков с широким кругом хозяев и с тех пор специализировались и утратили способность инфицировать некоторых хозяев.[3]

Подборка сероваров с перечислением известных хозяев. Поскольку существует более 2500 сероваров Salmonella enterica subsp. enterica, этот список неполный.

СероварВиды-хозяева
Сальмонелла ХолерныйСвинья
Сальмонелла ДублинКрупный рогатый скот
Сальмонелла EnteritidisЛюди, грызуны, галлообразные
Сальмонелла ГаллинарумGalliformes
Сальмонелла АдарЧеловек, галлиобразные, кролики
Сальмонелла ГейдельбергЧеловек, галлиобразные, свиньи[4]
Сальмонелла InfantisЧеловек, птица
Сальмонелла ПаратифыЛюди
Сальмонелла ТифЛюди
Сальмонелла ТифимуриумЛюди, крупный рогатый скот, свиньи, овцы, лошади, грызуны, галлообразные

Исследование данных из 37 стран, собранных в период с 2001 по 2007 год, показало, что наиболее распространенный серовар Сальмонелла изолированным от людей был Enteritidis, обнаруженный в среднем в 43,5% случаев, за ним следуют Typhimurium (17,1% случаев), Newport (3,5%), Infantis (1,8%), Virchow (1,5%), Hadar (1,5%). , и Агона (0,8%).[5]

Один штамм Сальмонелла недавно появившаяся в Соединенных Штатах Сальмонелла явиана. «Вспышка произошла в 2002 году, среди участников Игр по трансплантации в США был 141 случай. Из 141 случая большинство случаев были либо реципиентами трансплантата (34%), либо людьми, получавшими иммуносупрессивную терапию (32%)» . Растет число Сальмонелла серотипы с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ), которые были идентифицированы Национальной системой мониторинга устойчивости к противомикробным препаратам CDC.[6] "Сальмонелла явиана вызывает 4% нетифодных Сальмонелла инфекций в Соединенных Штатах каждый год ".[7]

В ноябре 2016 г. появился новый штамм с широкой лекарственной устойчивостью (ШЛУ). Salmonella enterica серовар Typhi возник в Пакистане, в основном из городов Хайдарабад и Карачи.[8] Множественная лекарственная устойчивость штаммы присутствуют с конца 1970-х годов в Африке и Азии.[9] Эти штаммы ШЛУ устойчивы ко всем вариантам лечения антибиотиками: хлорамфениколу, ампициллину, триметоприм-сульфаметоксазолу, фторхинолонам и цефалоспоринам третьего поколения. Вспышка продолжается с 2016 года.[10]

Метаболизм

Генетические данные показывают, что серовары можно разделить на две группы: одна вызывает кишечную инфекцию и имеет широкий набор метаболических возможностей, а вторая обычно вызывает инвазивную инфекцию, часто в узком круге хозяев, и демонстрирует деградацию анаэробных метаболических путей. . Считается, что эти метаболические способности важны для получения питательных веществ в сложной и ограниченной по питательным веществам среде воспаленного кишечника.[11]

Номенклатура

Серовары можно обозначать полностью или в сокращенном виде.[12] В краткой форме указан род, Сальмонелла, за которым следует серовар с заглавной буквы и без курсива. Полное обозначение Сальмонелла Typhi - это Salmonella enterica subsp. enterica, серовар Typhi.[13] У каждого серовара также может быть много штаммов, что позволяет быстро увеличивать общее количество антигенно изменчивый бактерии.[14]

Эпидемиология

Основная статья: Сальмонеллез

Инвазивные штаммы нетифоидной сальмонеллы, такие как Сальмонелла Typhimurium ST313 недавно был признан вызывающим новые болезни в Африке. Недостаток иммунитета у основных хозяев, связанный с ВИЧ, малярией и недоеданием, способствовал широкому распространению этого заболевания и необходимости использовать дорогие противомикробные препараты в самых бедных службах здравоохранения в мире.[15] Но также и бактериальные факторы, такие как повышенная активность гена вирулентности. pgtE, из-за однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в его промоторной области, как было показано, оказывают большое влияние на патогенез этого конкретного Сальмонелла тип последовательности.[16]

Рекомендации

  1. ^ Мюррей П.Р., Розенталь К.С., Пфаллер М.А. (2009). Медицинская микробиология (6-е изд.). Филадельфия, Пенсильвания: Мосби Эльзевьер. п. 307.
  2. ^ Sternlicht M, Staaby J, Sullivan I (декабрь 1975 г.). «Порядок рождения, возраст матери и умственная отсталость». Умственная отсталость. 13 (6): 3–6. Дои:10.1128 / IAI.70.5.2249-2255.2002. ЧВК  127920. PMID  11953356.
  3. ^ Лэнгридж Г.С., Фукс М., Коннор Т.Р., Фелтуэлл Т., Физи Н., Парсонс Б.Н., Сет-Смит Х.М., Барквист Л., Стедман А., Хамфри Т., Вигли П., Питерс С.Е., Маскелл DJ, Корандер Дж., Чабалгоити Дж. А., Барроу П., Паркхилл Дж., Дуган Дж., Томсон Н. Р. (январь 2015 г.). «Паттерны эволюции генома, сопровождавшие адаптацию хозяина у Salmonella». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 112 (3): 863–8. Bibcode:2015ПНАС..112..863Л. Дои:10.1073 / pnas.1416707112. ЧВК  4311825. PMID  25535353.
  4. ^ «Снимки серотипов сальмонелл» (PDF). Центры по контролю и профилактике заболеваний. CDC.
  5. ^ Hendriksen RS, Vieira AR, Karlsmose S, Lo Fo Wong DM, Jensen AB, Wegener HC, Aarestrup FM (август 2011 г.). «Глобальный мониторинг распространения сероваров сальмонеллы из Странового банка данных Глобальной сети по пищевым инфекциям Всемирной организации здравоохранения: результаты лабораторий гарантированного качества с 2001 по 2007 годы». Патогены пищевого происхождения и болезни. 8 (8): 887–900. Дои:10.1089 / fpd.2010.0787. PMID  21492021.
  6. ^ Голдрик, Барбара (март 2003 г.). «Новые инфекции: болезни пищевого происхождения». Американский журнал медсестер. 103 (3): 105–106. Дои:10.1097/00000446-200303000-00043. JSTOR  29745004. PMID  12635640.
  7. ^ Элвард А., Грим А., Шредер П., Киффер П., Селленрик П., Ферретт Р., Адамс ХК, Филлипс В., Бартоу Р., Мэйс Д., Лоуренс С., Сид П., Хольцманн-Пазгал Г., Польский Л., Лит Т., Фрейзер В. ( Июнь 2006 г.). «Вспышка инфекции Salmonella javiana в детской больнице». Инфекционный контроль и больничная эпидемиология. 27 (6): 586–92. Дои:10.1086/506483. JSTOR  10.1086/506483. PMID  16755478.
  8. ^ «Вспышка брюшного тифа в Пакистане связана с бактериями с широкой лекарственной устойчивостью». Журнал Scientist Magazine®. Получено 2018-09-03.
  9. ^ Klemm, Elizabeth J .; Шакур, Садия; Пейдж, Эндрю Дж .; Камар, Фарах Наз; Судья Ким; Саид, Дания К .; Вонг, Ванесса К .; Даллман, Тимоти Дж .; Наир, Сатиш (20 февраля 2018 г.). «Появление клона Salmonella enterica Serovar Typhi с широкой лекарственной устойчивостью, несущего беспорядочную плазмиду, кодирующую устойчивость к фторхинолонам и цефалоспоринам третьего поколения». мБио. 9 (1). Дои:10.1128 / mBio.00105-18. ISSN  2150-7511. ЧВК  5821095. PMID  29463654.
  10. ^ «Брюшной тиф с широкой лекарственной устойчивостью в Пакистане - Предупреждение - Уровень 2, Соблюдайте повышенные меры предосторожности - Уведомления о здоровье путешественников | Здоровье путешественников | CDC». wwwnc.cdc.gov. Получено 2018-09-03.
  11. ^ Nuccio SP, Bäumler AJ (март 2014 г.). «Сравнительный анализ геномов сальмонелл позволяет выявить метаболическую сеть для ускорения роста воспаленного кишечника». мБио. 5 (2): e00929–14. Дои:10,1128 / мBio.00929-14. ЧВК  3967523. PMID  24643865.
  12. ^ «Номенклатура сальмонелл». 19 марта 2005 г. Архивировано с оригинал 15 апреля 2006 г.
  13. ^ «Научная номенклатура». Возникающие инфекционные заболевания. Центры по контролю и профилактике заболеваний. Получено 17 февраля 2020.
  14. ^ «Сравнительное секвенирование Salmonella spp.». Архивировано из оригинал на 2007-11-14.
  15. ^ Физи Н.А., Дуган Г., Кингсли Р.А., Хейдерман Р.С., Гордон М.А. (июнь 2012 г.). «Инвазивная нетифоидная сальмонеллезная болезнь: возникающая тропическая болезнь, которой не уделяется должного внимания». Ланцет. 379 (9835): 2489–99. Дои:10.1016 / с0140-6736 (11) 61752-2. ЧВК  3402672. PMID  22587967.
  16. ^ Hammarlöf DL, Kröger C, Owen SV, Canals R, Lacharme-Lora L, Wenner N, Schager AE, Wells TJ, Henderson IR, Wigley P, Hokamp K, Feasey NA, Gordon MA, Hinton JC (март 2018 г.). «Сальмонелла». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 115 (11): E2614 – E2623. Дои:10.1073 / pnas.1714718115. ЧВК  5856525. PMID  29487214.