Спондин 1 - Википедия - Spondin 1

SPON1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2ZOT, 2ZOU, 3COO, 3К13
Идентификаторы
Псевдонимы	SPON1, VSGP / F-спондин, f-спондин, Спондин 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 604989 MGI: 2385287 ГомолоГен: 4453 Генные карты: SPON1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 11 (человек)
Конец	14,268,133 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 7 (мышь)
Конец	114,043,370 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001948 связывание с белками; • связывание ионов металлов; • структурная составляющая внеклеточного матрикса; • Привязка домена LBD;
Сотовый компонент	• внеклеточный матрикс; • внеклеточная область; • просвет эндоплазматического ретикулума; • внеклеточный; • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс;
Биологический процесс	• клеточная адгезия; • О-связанное фукозилирование белков; • положительное регулирование переработки белка; • положительное регулирование связывания белков; • отрицательная регуляция образования бета-амилоида; • положительное регулирование катаболического процесса белка-предшественника амилоида;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10418
	233744
	ENSG00000262655
	ENSMUSG00000038156
	Q9HCB6
	Q8VCC9
	NM_006108
	NM_145584
	NP_006099
	NP_663559
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Спондин-1 (также известный как F-спондин) является белок что у людей кодируется SPON1 ген.^[5] Вырабатывается клетками плита пола и может быть вовлечен в управление аксоном^[6] Белок содержит 807 аминокислот и структурно состоит из шести тромбоспондин домены, один катушка домен и один домен spondin.

дальнейшее чтение

Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Н. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID 12168954.
Клар А., Бальдассар М, Джессел Т.М. (1992). «F-спондин: ген, экспрессируемый на высоком уровне в пластине дна, кодирует секретируемый белок, который способствует адгезии нервных клеток и расширению нейритов». Клетка. 69 (1): 95–110. Дои:10.1016 / 0092-8674 (92) 90121-П. PMID 1555244. S2CID 14880785.
Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID 8889548.
Миямото К., Моришита Ю., Ямазаки М. (2001). «Выделение и характеристика фактора, способствующего росту гладкомышечных клеток сосудов из фолликулярной жидкости яичников крупного рогатого скота, и клонирование его кДНК из яичников крупного рогатого скота и человека». Arch. Biochem. Биофизы. 390 (1): 93–100. Дои:10.1006 / abbi.2001.2367. PMID 11368520.
Гонсалес де Передо А., Кляйн Д., Мацек Б. (2002). «С-маннозилирование и о-фукозилирование повторов тромбоспондина 1 типа». Мол. Клетка. Протеомика. 1 (1): 11–8. Дои:10.1074 / mcp.M100011-MCP200. PMID 12096136.
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Гроуз Л.Х. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Хо А., Südhof TC (2004). «Связывание F-спондина с белком-предшественником бета-амилоида: кандидатный лиганд белка-предшественника бета-амилоида, который модулирует расщепление белка-предшественника бета-амилоида». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (8): 2548–53. Дои:10.1073 / pnas.0308655100. ЧВК 356987. PMID 14983046.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Пайл-Шено Р.А., Столк Дж. А., Молеш Д. А. (2005). «VSGP / F-spondin: новый маркер рака яичников». Опухоль Биол. 26 (5): 245–57. Дои:10.1159/000087379. PMID 16103746. S2CID 13409234.
Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных кДНК человека, кодирующих секрецию или мембранные белки, из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.
Китагава М., Кудо Ю., Иидзука С. (2006). «Влияние F-спондина на цементобластную дифференцировку клеток периодонтальной связки человека» (PDF). Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 349 (3): 1050–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.08.142. PMID 16965763.

внешняя ссылка

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9HCB6 (Спондин-1) на PDBe-KB.

Эта статья о ген на хромосома человека 11 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000262655 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038156 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid9872452-5] Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (апрель 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (5): 277–86. Дои:10.1093 / днарес / 5.5.277. PMID 9872452.

[entrez-6] «Энтрез Ген: SPON1 спондин 1, белок внеклеточного матрикса».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Спондин 1 - Википедия - Spondin 1

Рекомендации

дальнейшее чтение

внешняя ссылка