StarBase (база данных) - StarBase (database)
 | |
|---|---|
| Содержание | |
| Описание | микроРНК -мРНК карты взаимодействия из данных Argonaute CLIP-Seq и Degradome-Seq. |
| Контакт | |
| Исследовательский центр | Университет Сунь Ятсена |
| Лаборатория | Ключевая лаборатория генной инженерии Министерства образования |
| Авторы | Цзянь-Хуа Ян |
| Основное цитирование | Ян и др. (2011)[1] |
| Дата выхода | 2010 |
| Доступ | |
| Интернет сайт | http://starbase.sysu.edu.cn/ |
StarBase это база данных для расшифровки miRNA -мРНК, miRNA-lncRNA, miRNA -sncRNA, miRNA-circRNA, miRNA-псевдоген, белок-днРНК, белок-нкРНК, взаимодействия белок-мРНК и сети ceRNA из CLIP-Seq (ХИТС-КЛИП, PAR-CLIP, iCLIP, СТОЛКНОВЕНИЕ) и секвенирование деградома данные.[1][2] starBase предоставляет веб-инструменты miRFunction и ceRNAFunction для прогнозирования функции ncRNA (miRNA, lncRNA, псевдогены) и генов, кодирующих белок из miRNA и ceRNA регуляторные сети.
starBase также развернула платформу Pan-Cancer Analysis Platform, чтобы расшифровать Пан-рак анализ Сети lncRNA, miRNA, ceRNA и РНК-связывающие белки (RBP) путем анализа клинических профилей и профилей экспрессии 14 типов рака (> 6000 образцов) из Атлас генома рака (TCGA) Портал данных.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б Ян, Цзянь-Хуа; Ли Цзюнь-Хао; Шао Пэн; Чжоу Хуэй; Чэнь Юэ-Цинь; Цюй Лян-Ху (январь 2011 г.). «starBase: база данных для изучения карт взаимодействия микроРНК-мРНК из данных Argonaute CLIP-Seq и Degradome-Seq». Нуклеиновые кислоты Res. Англия. 39 (Проблема с базой данных): D202-9. Дои:10.1093 / nar / gkq1056. ЧВК 3013664. PMID 21037263.
- ^ Ли, JH; Лю, S; Чжоу, H; Qu, LH; Ян, Дж. Х. (1 декабря 2013 г.). «starBase v2.0: расшифровка сетей взаимодействия miRNA-ceRNA, miRNA-ncRNA и белок-РНК из крупномасштабных данных CLIP-Seq». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (1): D92-7. Дои:10.1093 / нар / gkt1248. ЧВК 3964941. PMID 24297251.
внешняя ссылка
 | Этот Биологическая база данных -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |