TFDP1 - TFDP1

TFDP1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2AZE
Идентификаторы
Псевдонимы	TFDP1, DP1, DRTF1, Dp-1, DILC, фактор транскрипции Dp-1
Внешние идентификаторы	OMIM: 189902 MGI: 101934 ГомолоГен: 38276 Генные карты: TFDP1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 13 (человек)
Конец	113,641,473 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 8 (мышь)
Конец	13,378,448 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК; • специфическое связывание белкового домена; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • GO: 0001948 связывание с белками; • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции; • связывание фактора транскрипции; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• комплекс регуляторов транскрипции; • ядро клетки; • митохондрия; • нуклеоплазма; • цитозоль; • цитоплазма; • Комплекс факторов транскрипции РНК-полимеразы II;
Биологический процесс	• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • положительная регуляция вставки белка в митохондриальную мембрану, участвующую в сигнальном пути апоптоза; • клеточный цикл; • клеточная пролиферация; • Ответ на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53, приводящая к остановке клеточного цикла; • транскрипция, ДНК-шаблон; • регуляция транскрипции, вовлеченная в G1 / S переход митотического клеточного цикла; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • отрицательное регулирование перехода G0 на G1; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • отрицательное регулирование пролиферации жировых клеток; • развитие эпидермиса; • Anoikis; • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • регуляция клеточного цикла; • регуляция процесса биосинтеза ДНК;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7027
	21781
	ENSG00000198176
	ENSMUSG00000038482
	Q14186
	Q08639
	NM_007111
	NM_001291765; NM_001291766; NM_001291768; NM_009361; NM_001358991
	NP_009042
	NP_001278694; NP_001278695; NP_001278697; NP_033387; NP_001345920
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции Dp-1 это белок что у людей кодируется TFDP1 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Семейство факторов транскрипции E2F (см. MIM 189971) регулирует экспрессию различных клеточных промоторов, особенно тех, которые участвуют в клеточном цикле. Факторы E2F связываются с ДНК как гомодимеры или гетеродимеры в ассоциации с партнером по димеризации DP1. TFDP1 может быть первым примером семейства родственных факторов транскрипции; увидеть TFDP2 (MIM 602160). [Поставляется OMIM]^[7]

Взаимодействия

TFDP1 показал взаимодействовать с участием:

E2F1,^[8]^[9]^[10]^[11]
E2F5,^[8]^[12] и
P53.^[13]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198176 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038482 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Гирлинг Р., Партридж Дж. Ф., Бандара Л. Р., Бэрден Н., Тотти Н. Ф., Сюань Дж. Дж., Ла Танге Н. Б. (ноябрь 1993 г.). «Новый компонент фактора транскрипции DRTF1 / E2F». Природа. 365 (6445): 468. Дои:10.1038 / 365468d0. PMID 8413592.
^ Чжан Ю., Венкатрадж В.С., Фишер С.Г., Уорбертон Д., Челлаппан С.П. (март 1997 г.). «Геномное клонирование и хромосомное присвоение семейства генов TFDP партнера по димеризации E2F». Геномика. 39 (1): 95–8. Дои:10.1006 / geno.1996.4473. PMID 9027491.
^ ^а ^б «Ген Entrez: фактор транскрипции TFDP1 Dp-1».
^ ^а ^б Сардет К., Видал М., Кобриник Д., Гэн Й., Онуфрик С., Чен А., Вайнберг Р.А. (март 1995 г.). «E2F-4 и E2F-5, два члена семейства E2F, экспрессируются на ранних фазах клеточного цикла». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (6): 2403–7. Дои:10.1073 / пнас.92.6.2403. ЧВК 42492. PMID 7892279.
^ Сузуки М., Окуяма С., Окамото С., Ширасуна К., Накадзима Т., Хачия Т., Нодзима Х., Секия С., Ода К. (август 1998 г.). «Новый связывающий E2F белок с мотивом HLH Myc-типа стимулирует E2F-зависимую транскрипцию путем образования гетеродимера». Онкоген. 17 (7): 853–65. Дои:10.1038 / sj.onc.1202163. PMID 9780002.
^ Ву С.Л., Цукерберг Л.Р., Нгву К., Харлоу Е., Лис Дж. А. (май 1995 г.). «Связь in vivo белков семейства E2F и DP». Мол. Cell. Биол. 15 (5): 2536–46. Дои:10.1128 / mcb.15.5.2536. ЧВК 230484. PMID 7739537.
^ Хелин К., Ву К.Л., Фаттей А.Р., Лис Дж. А., Динлахт Б. Д., Нгву С., Харлоу Э. (октябрь 1993 г.). «Гетеродимеризация факторов транскрипции E2F-1 и DP-1 приводит к совместной трансактивации». Genes Dev. 7 (10): 1850–61. Дои:10.1101 / gad.7.10.1850. PMID 8405995.
^ Хиджманс Э.М., Вурхове П.М., Бейерсберген Р.Л., ван'т Вир Л.Дж., Бернардс Р. (июнь 1995 г.). «E2F-5, новый член семейства E2F, который взаимодействует с p130 in vivo». Мол. Cell. Биол. 15 (6): 3082–9. Дои:10.1128 / mcb.15.6.3082. ЧВК 230539. PMID 7760804.
^ Соренсен Т.С., Гирлинг Р., Ли К. В., Ганнон Дж., Бандара Л. Р., Ла Танге Н. Б. (октябрь 1996 г.). «Функциональное взаимодействие между DP-1 и p53». Мол. Cell. Биол. 16 (10): 5888–95. Дои:10.1128 / mcb.16.10.5888. ЧВК 231590. PMID 8816502.

дальнейшее чтение

Ву С.Л., Цукерберг Л.Р., Нгву К., Харлоу Е., Лис Дж. А. (1995). «Связь in vivo белков семейства E2F и DP». Мол. Cell. Биол. 15 (5): 2536–46. Дои:10.1128 / mcb.15.5.2536. ЧВК 230484. PMID 7739537.
Хиджманс Э.М., Вурхове П.М., Бейерсберген Р.Л., ван 'Вир Л.Дж., Бернардс Р. (1995). «E2F-5, новый член семейства E2F, который взаимодействует с p130 in vivo». Мол. Cell. Биол. 15 (6): 3082–9. Дои:10.1128 / mcb.15.6.3082. ЧВК 230539. PMID 7760804.
Сардет К., Видаль М., Кобриник Д., Гэн Й., Онуфрик С., Чен А., Вайнберг Р.А. (1995). «E2F-4 и E2F-5, два члена семейства E2F, экспрессируются на ранних фазах клеточного цикла». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (6): 2403–7. Дои:10.1073 / пнас.92.6.2403. ЧВК 42492. PMID 7892279.
Гинзберг Д., Вайро Дж., Читтенден Т., Сяо З. X, Сюй Дж., Виднер К. Л., Де Каприо Дж. А., Лоуренс Дж. Б., Ливингстон Д. М. (1994). «E2F-4, новый член семейства факторов транскрипции E2F, взаимодействует с p107». Genes Dev. 8 (22): 2665–79. Дои:10.1101 / gad.8.22.2665. PMID 7958924.
Бейерсберген Р.Л., Керховен Р.М., Жу Л., Карле Л., Вурхув П.М., Бернардс Р. (1994). «E2F-4, новый член семейства генов E2F, обладает онкогенной активностью и ассоциируется с p107 in vivo». Genes Dev. 8 (22): 2680–90. Дои:10.1101 / gad.8.22.2680. PMID 7958925.
Бандара Л. Р., Лам Е. В., Соренсен Т. С., Заманиан М., Гирлинг Р., Ла Танге Н. Б. (1994). «DP-1: регулируемый клеточный цикл и фосфорилированный компонент фактора транскрипции DRTF1 / E2F, который функционально важен для распознавания pRb и белком 6/7 аденовируса E4 orf». EMBO J. 13 (13): 3104–14. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06609.x. ЧВК 395201. PMID 8039504.
Хелин К., Ву К.Л., Фаттей А.Р., Лис Дж.А., Динлахт Б.Д., Нгву К., Харлоу Э. (1993). «Гетеродимеризация факторов транскрипции E2F-1 и DP-1 приводит к совместной трансактивации». Genes Dev. 7 (10): 1850–61. Дои:10.1101 / gad.7.10.1850. PMID 8405995.
Роджерс К.Т., Хиггинс П.Д., Милла М.М., Филлипс Р.С., Хоровиц Дж. М. (1996). «DP-2, гетеродимерный партнер E2F: идентификация и характеристика белков DP-2, экспрессируемых in vivo». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (15): 7594–9. Дои:10.1073 / пнас.93.15.7594. ЧВК 38791. PMID 8755520.
Соренсен Т.С., Гирлинг Р., Ли К.В., Ганнон Дж., Бандара Л.Р., Ла Танге Н.Б. (1996). «Функциональное взаимодействие между DP-1 и p53». Мол. Cell. Биол. 16 (10): 5888–95. Дои:10.1128 / mcb.16.10.5888. ЧВК 231590. PMID 8816502.
Видал М., Браун П., Чен Э, Боке Дж. Д., Харлоу Э (1996). «Генетическая характеристика домена белок-белкового взаимодействия млекопитающих с использованием дрожжевой обратной двугибридной системы». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (19): 10321–6. Дои:10.1073 / пнас.93.19.10321. ЧВК 38382. PMID 8816798.
Magae J, Wu CL, Illenye S, Harlow E, Heintz NH (1997). «Ядерная локализация факторов транскрипции DP и E2F гетеродимерными партнерами и членами семейства белков ретинобластомы». J. Cell Sci. 109. (Pt 7): 1717–26. PMID 8832394.
Хофманн Ф., Ливингстон Д.М. (1996). «Дифференциальные эффекты cdk2 и cdk3 на управление функцией pRb и E2F во время выхода из G1». Genes Dev. 10 (7): 851–61. Дои:10.1101 / gad.10.7.851. PMID 8846921.
Тримарчи Дж. М., Фэйрчайлд Б., Верона Р., Моберг К., Андон Н., Лис Дж. А. (1998). «E2F-6, член семейства E2F, который может вести себя как репрессор транскрипции». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (6): 2850–5. Дои:10.1073 / пнас.95.6.2850. ЧВК 19658. PMID 9501179.
Картрайт П., Мюллер Х, Вагенер С., Холм К., Хелин К. (1998). «E2F-6: новый член семейства E2F является ингибитором E2F-зависимой транскрипции». Онкоген. 17 (5): 611–23. Дои:10.1038 / sj.onc.1201975. PMID 9704927.
Тимченко Н.А., Уайльд М., Дарлингтон Г.Дж. (1999). «C / EBPalpha регулирует образование комплексов E2F-p107, специфичных для S-фазы, в печени новорожденных мышей». Мол. Cell. Биол. 19 (4): 2936–45. Дои:10.1128 / mcb.19.4.2936. ЧВК 84088. PMID 10082561.
Лам Э.В., Глассфорд Дж., Ван дер Сман Дж., Банерджи Л., Пицзи А.Р., Шон Н., Томас Б., Клаус Г.Г. (1999). «Модуляция активности E2F в первичных В-клетках мыши после стимуляции через поверхностные рецепторы IgM и CD40». Евро. J. Immunol. 29 (10): 3380–9. Дои:10.1002 / (SICI) 1521-4141 (199910) 29:10 <3380 :: AID-IMMU3380> 3.0.CO; 2-C. PMID 10540350.
Sansal I, Dupont E, Toru D, Evrard C, Rouget P (2000). «NPDC-1, регулятор пролиферации и дифференцировки нервных клеток, взаимодействует с E2F-1, снижает его связывание с ДНК и модулирует его транскрипционную активность». Онкоген. 19 (43): 5000–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1203843. PMID 11042687.
Сюй С.И., Ян С.М., Сим К.Г., Хентшель Д.М., О'Лири Э., Бонвентре СП (2001). «TRIP-Br: новое семейство PHD, взаимодействующих с цинковыми пальцами и бромодоменами белков, которые регулируют транскрипционную активность E2F-1 / DP-1». EMBO J. 20 (9): 2273–85. Дои:10.1093 / emboj / 20.9.2273. ЧВК 125435. PMID 11331592.

Эта белок -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198176 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038482 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8413592-5] Гирлинг Р., Партридж Дж. Ф., Бандара Л. Р., Бэрден Н., Тотти Н. Ф., Сюань Дж. Дж., Ла Танге Н. Б. (ноябрь 1993 г.). «Новый компонент фактора транскрипции DRTF1 / E2F». Природа. 365 (6445): 468. Дои:10.1038 / 365468d0. PMID 8413592.

[pmid9027491-6] Чжан Ю., Венкатрадж В.С., Фишер С.Г., Уорбертон Д., Челлаппан С.П. (март 1997 г.). «Геномное клонирование и хромосомное присвоение семейства генов TFDP партнера по димеризации E2F». Геномика. 39 (1): 95–8. Дои:10.1006 / geno.1996.4473. PMID 9027491.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: фактор транскрипции TFDP1 Dp-1».

[pmid7892279-8] а ^б Сардет К., Видал М., Кобриник Д., Гэн Й., Онуфрик С., Чен А., Вайнберг Р.А. (март 1995 г.). «E2F-4 и E2F-5, два члена семейства E2F, экспрессируются на ранних фазах клеточного цикла». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (6): 2403–7. Дои:10.1073 / пнас.92.6.2403. ЧВК 42492. PMID 7892279.

[pmid9780002-9] Сузуки М., Окуяма С., Окамото С., Ширасуна К., Накадзима Т., Хачия Т., Нодзима Х., Секия С., Ода К. (август 1998 г.). «Новый связывающий E2F белок с мотивом HLH Myc-типа стимулирует E2F-зависимую транскрипцию путем образования гетеродимера». Онкоген. 17 (7): 853–65. Дои:10.1038 / sj.onc.1202163. PMID 9780002.

[pmid7739537-10] Ву С.Л., Цукерберг Л.Р., Нгву К., Харлоу Е., Лис Дж. А. (май 1995 г.). «Связь in vivo белков семейства E2F и DP». Мол. Cell. Биол. 15 (5): 2536–46. Дои:10.1128 / mcb.15.5.2536. ЧВК 230484. PMID 7739537.

[pmid8405995-11] Хелин К., Ву К.Л., Фаттей А.Р., Лис Дж. А., Динлахт Б. Д., Нгву С., Харлоу Э. (октябрь 1993 г.). «Гетеродимеризация факторов транскрипции E2F-1 и DP-1 приводит к совместной трансактивации». Genes Dev. 7 (10): 1850–61. Дои:10.1101 / gad.7.10.1850. PMID 8405995.

[pmid7760804-12] Хиджманс Э.М., Вурхове П.М., Бейерсберген Р.Л., ван'т Вир Л.Дж., Бернардс Р. (июнь 1995 г.). «E2F-5, новый член семейства E2F, который взаимодействует с p130 in vivo». Мол. Cell. Биол. 15 (6): 3082–9. Дои:10.1128 / mcb.15.6.3082. ЧВК 230539. PMID 7760804.

[pmid8816502-13] Соренсен Т.С., Гирлинг Р., Ли К. В., Ганнон Дж., Бандара Л. Р., Ла Танге Н. Б. (октябрь 1996 г.). «Функциональное взаимодействие между DP-1 и p53». Мол. Cell. Биол. 16 (10): 5888–95. Дои:10.1128 / mcb.16.10.5888. ЧВК 231590. PMID 8816502.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]