TPD52L1 - Википедия - TPD52L1

TPD52L1
Идентификаторы
ПсевдонимыTPD52L1, D53, hD53, опухолевый белок D52-подобный 1, опухолевый белок D52 подобный 1, TPD52 подобный 1, TPD53
Внешние идентификаторыOMIM: 604069 MGI: 1298386 ГомолоГен: 2468 Генные карты: TPD52L1
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение TPD52L1
Геномное расположение TPD52L1
Группа6q22.31Начинать125,119,049 бп[1]
Конец125,264,407 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TPD52L1 210372 s в формате fs.png

PBB GE TPD52L1 203786 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

7164

21987

Ансамбль

ENSG00000111907

ENSMUSG00000000296

UniProt

Q16890

O54818

RefSeq (мРНК)

NM_009413
NM_001359364
NM_001359365
NM_001359366

RefSeq (белок)

NP_033439
NP_001346293
NP_001346294
NP_001346295

Расположение (UCSC)Chr 6: 125,12 - 125,26 МбChr 10: 31.33 - 31.45 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Опухолевый белок D52 это белок что у людей кодируется TPD52L1 ген.[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует член семейства опухолевых белков D52 (TPD52). Кодируемый белок содержит домен спиральной спирали и может образовывать гомо- или гетеродимер с членами семейства TPD52. Сообщается, что белок участвует в пролиферации клеток и передаче сигналов кальция. Он также взаимодействует с митоген-активируемой протеинкиназной киназой 5 (MAP3K5 / ASK1) и положительно регулирует апоптоз, индуцированный MAP3K5. Наблюдали множественные альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, но полноразмерная природа некоторых вариантов еще не была определена.[7]

Взаимодействия

TPD52L1 был показан взаимодействовать с TPD52L2[8] и TPD52.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111907 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000296 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Бирн Дж. А., Маттей М. Г., Бассет П. (декабрь 1996 г.). «Определение семейства генов опухолевого белка D52 (TPD52) посредством клонирования гомологов D52 у человека (hD53) и мыши (mD52)». Геномика. 35 (3): 523–532. Дои:10.1006 / geno.1996.0393. PMID  8812487.
  6. ^ Бутрос Р., Бирн Дж. А. (октябрь 2005 г.). «D53 (TPD52L1) представляет собой белок регулируемого клеточного цикла, максимально экспрессируемый при переходе G2-M в клетках рака груди». Exp. Cell Res. 310 (1): 152–165. Дои:10.1016 / j.yexcr.2005.07.009. PMID  16112108.
  7. ^ а б «Ген Entrez: опухолевый белок TPD52L1, подобный D52 1».
  8. ^ а б Бирн Дж. А., Норс К. Р., Бассет П., Ганнинг П. (февраль 1998 г.). «Идентификация гомо- и гетеромерных взаимодействий между членами семейства белков D52, связанных с карциномой груди, с использованием дрожжевой двугибридной системы». Онкоген. 16 (7): 873–881. Дои:10.1038 / sj.onc.1201604. PMID  9484778.

дальнейшее чтение

  • Бирн Дж. А., Томазетто С., Гарнье Дж. М., Руйе Н., Маттей М. Г., Беллок Дж. П., Рио МС, Бассет П. (1995). «Метод скрининга для выявления генов, обычно сверхэкспрессируемых в карциномах, и идентификация новой комплементарной последовательности ДНК». Рак Res. 55 (13): 2896–2903. PMID  7796418.
  • Бирн Дж. А., Норс К. Р., Бассет П., Ганнинг П. (1998). «Идентификация гомо- и гетеромерных взаимодействий между членами семейства белков D52, связанных с карциномой груди, с использованием дрожжевой двугибридной системы». Онкоген. 16 (7): 873–881. Дои:10.1038 / sj.onc.1201604. PMID  9484778.
  • Бирн Дж. А., Маттей М. Г., Бассет П., Ганнинг П. (1998). «Идентификация и картирование гибридизации in situ ортолога мышиного Tpd52l1 (D53) на хромосоме 10A4-B2». Cytogenet. Cell Genet. 81 (3–4): 199–201. Дои:10.1159/000015029. PMID  9730602. S2CID  46742110.
  • Уилсон С.Х., Бейли А.М., Норс С.Р., Маттей М.Г., Бирн Дж.А. (2001). «Идентификация MAL2, нового члена семейства mal протеолипидов, посредством взаимодействия с TPD52-подобными белками в дрожжевой двугибридной системе». Геномика. 76 (1–3): 81–88. Дои:10.1006 / geno.2001.6610. PMID  11549320.
  • Сатхасивам П., Бейли А.М., Кроссли М., Бирн Дж. А. (2001). «Роль мотива coiled-coil во взаимодействиях, опосредованных TPD52». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 288 (1): 56–61. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5721. PMID  11594751.
  • Бутрос Р., Бейли А.М., Уилсон С.Х., Бирн Дж. А. (2003). «Альтернативный сплайсинг как механизм регулирования связывания 14-3-3: взаимодействия между hD53 (TPD52L1) и белками 14-3-3». J. Mol. Биол. 332 (3): 675–687. Дои:10.1016 / S0022-2836 (03) 00944-6. PMID  12963375.
  • Чо С., Ко Х. М., Ким Дж. М., Ли Дж. А., Пак Дж. Э., Чан М. С., Пак С. Г., Ли Д.Х., Рю С.Е., Парк BC (2004). «Положительная регуляция киназы 1, регулирующей сигнал апоптоза, с помощью hD53L1». J. Biol. Chem. 279 (16): 16050–16056. Дои:10.1074 / jbc.M305758200. PMID  14761963.
  • Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–1178. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Варварский Д., Байт К., Далла-Поцца Л., Бирн Дж. А. (2006). «Экспрессия опухолевого белка D52-подобных генов при лейкемии у детей при диагностике: клинические и образцы». Лейк. Res. 30 (11): 1355–1363. Дои:10.1016 / j.leukres.2006.03.009. PMID  16620967.
  • Цао Ц., Чен Дж., Чжу Л., Лю И, Чжоу З., Ша Дж, Ван С., Ли Дж. (2006). «Яичко-специфический и регулируемый в процессе развития яичка опухолевый белок D52 (TPD52) -подобный белок TPD52L3 / hD55 взаимодействует с белками семейства TPD52». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 344 (3): 798–806. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.03.208. PMID  16631610.