TPD52L2 - Википедия - TPD52L2

TPD52L2
Идентификаторы
ПсевдонимыTPD52L2, D54, TPD54, опухолевый белок D52 как 2, TPD52 как 2
Внешние идентификаторыOMIM: 603747 MGI: 1913564 ГомолоГен: 2469 Генные карты: TPD52L2
Расположение гена (человек)
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человек)[1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение TPD52L2
Геномное расположение TPD52L2
Группа20q13.33Начинать63,865,228 бп[1]
Конец63,891,545 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TPD52L2 201379 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

7165

66314

Ансамбль

ENSG00000101150

ENSMUSG00000000827

UniProt

O43399
Q6FGS1

Q9CYZ2

RefSeq (мРНК)
RefSeq (белок)
Расположение (UCSC)Chr 20: 63,87 - 63,89 МбChr 2: 181,5 - 181,52 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Опухолевый белок D54 это белок что у людей кодируется TPD52L2 ген.[5][6]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции TPD52L2. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Tpd52l2tm1a (КОМП) Wtsi[11][12] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse Программа - проект мутагенеза с высокой пропускной способностью, направленный на создание и распространение животных моделей болезней среди заинтересованных ученых.[13][14][15]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[9][16]

Было проведено двадцать два испытания на мутант мышей, и наблюдалась одна значительная аномалия: гомозиготный взрослые самки показали уменьшение длины тела на DEXA.[9]

Взаимодействия

TPD52L2 был показан взаимодействовать с TPD52L1[5] и TPD52.[5]

Клеточная функция

TPD52L2 играет роль в мембранный трафик[17]. TPD52L2 обнаруживается на небольших транспортных пузырьках, называемых внутриклеточными нанопузырьками, которые переносят белки между различными клеточными компартментами. Когда TPD52L2 истощается из клеток HeLa, нарушаются следующие пути трафика: антероградный трафик, переработка груза и целостность Гольджи.[17]. Протеомный анализ показывает, что TPD52L2 является одним из наиболее распространенных белков, экспрессируемых в клетках HeLa.[18].

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101150 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000827 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c Бирн Дж. А., Норс К. Р., Бассет П., Ганнинг П. (март 1998 г.). «Идентификация гомо- и гетеромерных взаимодействий между членами семейства белков D52, связанных с карциномой груди, с использованием дрожжевой двугибридной системы». Онкоген. 16 (7): 873–81. Дои:10.1038 / sj.onc.1201604. PMID  9484778.
  6. ^ «Ген Entrez: опухолевый белок TPD52L2 D52-подобный 2».
  7. ^ "Данные DEXA для Tpd52l2". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  8. ^ "Сальмонелла данные о заражении Tpd52l2 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  9. ^ а б c Гердин, АК (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 0. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  10. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  11. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  12. ^ "Информатика генома мыши".
  13. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт АФ, Брэдли А (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  14. ^ Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  15. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  16. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.
  17. ^ а б Ларок Дж., Ла-Борд П. Дж., Кларк Н. И., Картер Нью-Джерси, Ройл С. Дж. (2019). «Опухолевый белок D54 определяет новый класс внутриклеточных транспортных пузырьков». J Cell Biol. 219. Дои:10.1083 / jcb.201812044. PMID  31672706.
  18. ^ Hein MY, Hubner NC, Poser I, Cox J, Nagaraj N, Toyoda Y, Gak IA, Weisswange I, Mansfeld J, Buchholz F, Hyman AA, Mann M (2017). «Человеческий интерактом в трех количественных измерениях, организованных стехиометрией и изобилием». Клетка. 163 (3): 712–23. Дои:10.1016 / j.cell.2015.09.053. PMID  26496610.

дальнейшее чтение

  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Бирн Дж. А., Маттей М. Г., Бассет П. (1996). «Определение семейства генов опухолевого белка D52 (TPD52) посредством клонирования гомологов D52 у человека (hD53) и мыши (mD52)». Геномика. 35 (3): 523–32. Дои:10.1006 / geno.1996.0393. PMID  8812487.
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
  • Nourse CR, Маттей М.Г., Ганнинг П., Бирн Дж. А. (1998). «Клонирование третьего члена семейства генов D52 указывает на использование альтернативной кодирующей последовательности в D52-подобных транскриптах». Биохим. Биофиз. Acta. 1443 (1–2): 155–68. Дои:10.1016 / S0167-4781 (98) 00211-5. PMID  9838088.
  • Уилсон С.Х., Бейли А.М., Норс С.Р., Маттей М.Г., Бирн Дж.А. (2001). «Идентификация MAL2, нового члена семейства mal протеолипидов, посредством взаимодействия с TPD52-подобными белками в дрожжевой двугибридной системе». Геномика. 76 (1–3): 81–8. Дои:10.1006 / geno.2001.6610. PMID  11549320.
  • Бутрос Р., Бирн Дж. А. (2005). «D53 (TPD52L1) представляет собой белок регулируемого клеточного цикла, максимально экспрессируемый при переходе G2-M в клетках рака груди». Exp. Cell Res. 310 (1): 152–65. Дои:10.1016 / j.yexcr.2005.07.009. PMID  16112108.
  • Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
  • Варварский Д., Байт К., Далла-Поцца Л., Бирн Дж. А. (2006). «Экспрессия опухолевого белка D52-подобных генов при лейкемии у детей при диагностике: клинические и образцы». Лейк. Res. 30 (11): 1355–63. Дои:10.1016 / j.leukres.2006.03.009. PMID  16620967.
  • Цао Ц., Чен Дж., Чжу Л., Лю И, Чжоу З., Ша Дж, Ван С., Ли Дж. (2006). «Яичко-специфический и регулируемый в процессе развития яичка опухолевый белок D52 (TPD52) -подобный белок TPD52L3 / hD55 взаимодействует с белками семейства TPD52». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 344 (3): 798–806. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.03.208. PMID  16631610.
  • Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.