Комплекс TRAPP - TRAPP complex

TRAPP (частица белка транспорта) это белок участвует в переносе частиц между органеллы.

Сворачивание белка и эндоплазматический ретикулум (ЭР)

Белки которые предназначены для плазматическая мембрана или экспорт во внеклеточную среду в эукариотический ячейки переведены на рибосомы которые сидят на шероховатой эндоплазматической сети (RER). Большинство белков ко-трансляционно транспортируются в ЭПР (т. Е. Пока рибосома транслирует мРНК код в полипептид полипептид одновременно вставляется через Translocon поры в ER). ER обеспечивает среду, которая помогает возникающим полипептидам складываться и становиться функциональными или частично функциональными белками. ER предоставляет окисляющий среда (для образования дисульфидных связей) и необходимые шапероны (агенты, способствующие сворачиванию, которые не являются частью конечного белка). Многочисленные экспортируемые белки образуют дисульфидные связи —ковалентные связи которые стабилизируют структуру белка в суровых внеклеточных условиях. Классическим примером являются полипептиды тяжелой и легкой цепи с дисульфидной связью антитела секретно В-клетки из иммунная система.

Еще одно ключевое событие, которое происходит в ER, - это N-связанное гликозилирование. В этом процессе полипептиды, которые имеют уникальный участок из 3 аминокислот (аспарагин - X - серин / треонин, где X представляет собой любую аминокислота Кроме пролин ) модифицированы сложным сахарным фрагментом амидной группы аспарагина. Другие типы гликозилирования включают S-связанные (через остатки цистеина), C-связанные (через триптофан) и O-связанные (через серин или треонин). Безусловно, N-связанное гликозилирование является наиболее распространенным посттрансляционная модификация обнаружен в эукариотических клетках.

Экспорт белка из ER и оболочки COP II

Как только белки свернуты и готовы к транспортировке из ER, считается, что они собираются в определенном месте внутри ER, называемом «сайтами выхода ER». Эти участки могут быть временными, но, скорее всего, расположены в ER, где ER находится близко к следующему транспортному отсеку, пузырно-трубчатый кластер (VTC) (также называемый промежуточным отсеком ER-Golgi (ERGIC)). Детали того, как белки концентрируются или локализуются в месте выхода, неясны (некоторые аспекты появляются!), Но реальный процесс подающий надежды а везикул содержащие эти белки, начинаются с белка, называемого Sec12. Этот белок привлекает небольшую GTPase называется Sar1 (подумайте о Sar1 как о переключателе, он активен, когда привязан к GTP и неактивен, когда гидролизует GTP до ВВП ). Это, в свою очередь, приводит к привлечению белкового комплекса Sec23 / Sec24 и комплекса Sec13 / Sec31 (также известного как COPII Пальто). Вкратце, эти белки формируют сетку в месте выхода ER, а сетка из-за механической кривизны образует небольшой «шарик», который отделяется от ER с белками внутри (представьте себе пластилин как ER, а вашу руку как Sec сложное отщипывание мелочей). Сетка отделяется от бутонизированного пузырька, когда Sar1 гидролизует GTP до GDP. Эта активность Sar1 усиливается Sec23 / 24.

Транспорт и привязка везикул

Как только везикулы отделяются от ER, они переносятся пассивно (за счет распространение ) или активно (внутриклеточными двигателями, которые работают по дорожкам цитоскелета). Кажется, что на вид транспорта влияет расстояние. Короткие расстояния могут иметь тенденцию к пассивному транспорту, тогда как большие расстояния имеют тенденцию активный транспорт. Как только эти пузырьки достигают места назначения, их сначала необходимо физически связать со своим акцепторным отделением (иначе они могут уплыть). Этому процессу способствует "привязи Тетеры бывают двух видов: длинные белки с доменами, называемыми "спиральная катушка," или же комплексы многих подразделений, которые по большей части шаровидный. Связка, которая функционирует, чтобы связать везикулы, полученные из ER, с VTC (или аппарат Гольджи в случае низших эукариот) следующим компартментом на пути транспорта является частица транспортного белка (TRAPP).

TRAPP как привязь

TRAPP также бывает двух видов: TRAPP I и II. TRAPP I представляет собой мультисубъединичный комплекс, который состоит из семи субъединиц (Bet5, Bet3, Trs20, Trs23, Trs31, Trs33, Trs85). TRAPPII имеет три дополнительных субъединицы (Trs65, Trs120 и Trs130) и функционирует как связующее звено на последних стадиях транспортного пути. TRAPP I связывает эти везикулы, происходящие из ER, и приближает везикулу к акцепторной мембране. Такое близкое расположение двух мембран позволяет взаимодействовать между SNARE (рецептор белка прикрепления растворимого NSF (фактора, чувствительного к N-этилмалеимиду)) в обоих отсеках. Затем взаимодействующие SNARE закрывают мембраны и позволяют слиться.

Недавний отчет^[1] показали, что начальное взаимодействие между TRAPP и везикулами, происходящими из ER, опосредуется посредством взаимодействия между субъединицей TRAPP Bet3 и субъединицей оболочки COPII, Sec23. Традиционный взгляд на связывание / слияние предполагает, что оболочка везикул сбрасывается до связывания и слияния, но в этом отчете приводится аргумент в пользу модели, в которой начальный этап связывания происходит на покрытой или частично покрытой везикуле. Комплекс TRAPPI минус субъединица Trs85 был недавно кристаллизован в виде двух субкомплексов, которые затем были смоделированы на основе данных ЭМ травления, чтобы выявить возможную кристаллическую структуру для всего комплекса. Предполагаемый сайт связывания ypt / rab был указан на кристаллической структуре с участием субъединиц Trs23 и Bet5. Между прочим, все 5 основных малых субъединиц (Trs31, Trs20, Bet3, Bet5 и Trs23) необходимы для восстановления эффективной обменной активности на ypt1 in vitro. Следовательно, еще неизвестно, ограничен ли интерфейс между ypt1 и TRAPPI только Trs23 и Bet5 и как другая субъединица влияет на обменную активность.

Клиническое значение

Мутации в системе TRAPP были связаны с неврологическим дефицитом.^[2]

дальнейшее чтение

• TRAPP - начало
• Отзыв о привязке пузырьков из лаборатории Шона Манро
• Взаимодействие TRAPP с покрытием COPII
• Кристаллическая структура TRAPPI

Рекомендации