TRIM23 - TRIM23

TRIM23
Идентификаторы
ПсевдонимыTRIM23, ARD1, ARFD1, RNF46, трехчастный мотив, содержащий 23
Внешние идентификаторыOMIM: 601747 MGI: 1933161 ГомолоГен: 1251 Генные карты: TRIM23
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение TRIM23
Геномное расположение TRIM23
Группа5q12.3Начинать65,589,690 бп[1]
Конец65,625,975 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TRIM23 210994 x at fs.png

PBB GE TRIM23 204732 s в формате fs.png

PBB GE TRIM23 210995 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001656
NM_033227
NM_033228

NM_030731
NM_001361538
NM_001361539

RefSeq (белок)

NP_001647
NP_150230
NP_150231

NP_001348467
NP_001348468

Расположение (UCSC)Chr 5: 65,59 - 65,63 МбChr 13: 104,18 - 104,2 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

GTP-связывающий белок ARD-1 это белок что у людей кодируется TRIM23 ген.[5][6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства трехчастных мотивов (TRIM). Мотив TRIM включает три цинк-связывающих домена, RING, B-бокс типа 1 и B-бокса типа 2, а также область спиральной спирали. Этот белок также является членом семейства факторов рибозилирования АДФ семейства белков, связывающих гуанин-нуклеотид. Его карбокси-конец содержит домен фактора ADP-рибозилирования и сайт связывания гуанинового нуклеотида, в то время как амино-конец содержит домен белка, активирующего GTPase, который действует на сайт связывания гуанинового нуклеотида. Белок находится в лизосомах и аппарате Гольджи. Он играет роль в образовании внутриклеточных транспортных пузырьков, их перемещении из одного компартмента в другой и фосфолипаза D активация. Были описаны три альтернативно сплайсированных варианта транскрипта для этого гена.[6]

Взаимодействия

TRIM23 был показан взаимодействовать с TRIM31,[7] TRIM29[7] и PSCD1.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113595 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021712 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Мисима К., Цучия М., Соловей М.С., Мосс Дж., Воган М. (апрель 1993 г.). «ARD 1, гуанин-нуклеотидсвязывающий белок массой 64 кДа с карбоксильным концевым доменом фактора ADP-рибозилирования». Журнал биологической химии. 268 (12): 8801–7. PMID  8473324.
  6. ^ а б "Entrez Gene: TRIM23, содержащий трехкомпонентный мотив 23".
  7. ^ а б Реймонд А., Мерони Дж., Фантоцци А., Мерла Дж., Каир С., Лузи Л., Риганелли Д., Занария Е., Мессали С., Кайнарка С., Гуффанти А., Минуччи С., Пеликчи П. Г., Баллабио А. (май 2001 г.). «Семейство трехчастных мотивов идентифицирует клеточные компартменты». Журнал EMBO. 20 (9): 2140–51. Дои:10.1093 / emboj / 20.9.2140. ЧВК  125245. PMID  11331580.
  8. ^ Витале Н., Пачеко-Родригес Дж., Ферранс В. Дж., Рименшнайдер В., Мосс Дж., Воган М. (июль 2000 г.). «Специфическое функциональное взаимодействие человеческого цитохезина-1 и белка домена фактора ADP-рибозилирования (ARD1)». Журнал биологической химии. 275 (28): 21331–9. Дои:10.1074 / jbc.M909642199. PMID  10748148.

дальнейшее чтение