TRIM29 - TRIM29

TRIM29
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2CSV
Идентификаторы
Псевдонимы	TRIM29, ATDC, трехчастный мотив, содержащий 29
Внешние идентификаторы	OMIM: 610658 MGI: 1919419 ГомолоГен: 8100 Генные карты: TRIM29
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 11 (человек)
Конец	120,185,529 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 9 (мышь)
Конец	43,336,115 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • связывание ионов цинка; • связывание p53; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание ионов металлов; • связывание кадгерина, участвующее в межклеточной адгезии; • идентичное связывание с белками;
Сотовый компонент	• внутриклеточный; • цитоплазма; • лизосома;
Биологический процесс	• отрицательная регуляция локализации белка в ядре; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • межклеточная адгезия; • иммунная система; • врожденная иммунная система;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	23650
	72169
	ENSG00000137699
	ENSMUSG00000032013
	Q14134
	Q8R2Q0
	NM_012101; NM_058193; NM_001330382
	NM_023655
	NP_001317311; NP_036233
	NP_076144
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Белок, содержащий трехкомпонентный мотив 29 это белок что у людей кодируется TRIM29 ген.^[5]^[6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к Семейство белков TRIM. Имеет несколько цинковый палец мотивы и лейциновая молния мотив. Было предложено образовывать гомо- или гетеродимеры, которые участвуют в связывании нуклеиновых кислот. Таким образом, он может действовать как фактор регуляции транскрипции, участвующий в канцерогенезе и / или дифференцировке. Он также может подавлять радиочувствительность, поскольку связан с атаксия – телеангиэктазия фенотип.^[6]

Взаимодействия

TRIM29 был показан взаимодействовать с участием TRIM23^[5] и GCC1.^[7]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000137699 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032013 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ^а ^б Реймонд А., Мерони Дж., Фантоцци А., Мерла Дж., Каир С., Лузи Л., Риганелли Д., Занария Е., Мессали С., Кайнарка С., Гуффанти А., Минуччи С., Пеликчи П. Г., Баллабио А. (май 2001 г.). «Семейство трехчастных мотивов идентифицирует клеточные компартменты». EMBO J. 20 (9): 2140–51. Дои:10.1093 / emboj / 20.9.2140. ЧВК 125245. PMID 11331580.
^ ^а ^б "Entrez Gene: TRIM29, содержащий трехкомпонентный мотив 29".
^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

дальнейшее чтение

Капп Л.Н., Художник РБ, Ю.Л.К., ван Лун Н., Ричард К.В., Джеймс М.Р., Кокс Д.Р., Мурнейн Дж.П. (1992). «Клонирование гена-кандидата на атаксию-телеангиэктазию группы D». Am. J. Hum. Genet. 51 (1): 45–54. ЧВК 1682873. PMID 1609804.
Хосой Ю., Капп Л.Н. (1994). «Экспрессия кандидата гена группы D атаксии-телеангиэктазии в культивируемых линиях клеток фибробластов и тканях человека». Int. J. Radiat. Биол. 66 (6 Прил.): S71-6. Дои:10.1080/09553009414551891. PMID 7530755.
Brzoska PM, Chen H, Zhu Y, Levin NA, Disatnik MH, Mochly-Rosen D, Murnane JP, Christman MF (1995). "Продукт гена, комплементарного группы D атаксии-телеангиэктазии, ATDC, взаимодействует с субстратом и ингибитором протеинкиназы C". Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (17): 7824–8. Дои:10.1073 / пнас.92.17.7824. ЧВК 41238. PMID 7644499.
Murnane JP, Zhu Y, Young BR, Christman MF (1994). «Экспрессия гена-кандидата ATDC не обнаруживается в линии клеток человека с нормальным ответом на ионизирующее излучение». Int. J. Radiat. Биол. 66 (6 Прил.): С77-84. Дои:10.1080/09553009414551901. PMID 7836856.
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Леонхардт Э.А., Капп Л.Н., Янг Б.Р., Мурнейн Дж.П. (1994). «Анализ нуклеотидной последовательности гена-кандидата для атаксии-телеангиэктазии группы D (ATDC)». Геномика. 19 (1): 130–6. Дои:10.1006 / geno.1994.1022. PMID 8188213.
Ричард К.В., Кокс Д.Р., Капп Л., Мурнейн Дж., Корнелис Ф., Джулиер С., Латроп Г.М., Джеймс М.Р. (1993). «Радиационная гибридная карта хромосомы человека 11q22-q23, содержащая локус болезни атаксия-телеангиэктазия». Геномика. 17 (1): 1–5. Дои:10.1006 / geno.1993.1275. PMID 8406440.
Laderoute KR, Knapp AM, Green CJ, Sutherland RM, Kapp LN (1996). «Экспрессия гена ATDC (группа D-комплементарной атаксии телеангиэктазии) в клетках плоскоклеточной карциномы человека A431». Int. J. Рак. 66 (6): 772–8. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0215 (19960611) 66: 6 <772 :: AID-IJC11> 3.0.CO; 2-5. PMID 8647648.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Таучи Х., Грин С., Кнапп М., Ладерут К., Капп Л. (2000). «Измененный сплайсинг сообщения ATDC в клетках группы D с телеангиэктазией атаксии приводит к отсутствию функционального белка». Мутагенез. 15 (2): 105–8. Дои:10.1093 / mutage / 15.2.105. PMID 10719033.
Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А, Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК 442148. PMID 15231748.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Хосой Ю., Капп Л.Н., Мурнейн Дж. П., Мацумото Ю., Эномото А., Оно Т., Миягава К. (2006). «Подавление независимого от закрепления роста путем экспрессии гена, комплементарного группы D атаксии-телеангиэктазии, ATDC». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 348 (2): 728–34. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.07.115. PMID 16890201.
Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.

Эта статья о ген на хромосома человека 11 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000137699 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032013 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid11331580-5] а ^б Реймонд А., Мерони Дж., Фантоцци А., Мерла Дж., Каир С., Лузи Л., Риганелли Д., Занария Е., Мессали С., Кайнарка С., Гуффанти А., Минуччи С., Пеликчи П. Г., Баллабио А. (май 2001 г.). «Семейство трехчастных мотивов идентифицирует клеточные компартменты». EMBO J. 20 (9): 2140–51. Дои:10.1093 / emboj / 20.9.2140. ЧВК 125245. PMID 11331580.

[entrez-6] а ^б "Entrez Gene: TRIM29, содержащий трехкомпонентный мотив 29".

[pmid16189514-7] Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]