TRIM3 - TRIM3

TRIM3
Идентификаторы
ПсевдонимыTRIM3, BERP, HAC1, RNF22, RNF97, трехчастный мотив, содержащий 3
Внешние идентификаторыOMIM: 605493 MGI: 1860040 ГомолоГен: 21290 Генные карты: TRIM3
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение TRIM3
Геномное расположение TRIM3
Группа11п15.4Начинать6,448,613 бп[1]
Конец6,474,459 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TRIM3 204910 s в формате fs.png

PBB GE TRIM3 204911 s в формате fs.png

PBB GE TRIM3 213884 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001248006
NM_001248007
NM_006458
NM_033278

NM_001285870
NM_001285871
NM_001285873
NM_018880
NM_001360425

RefSeq (белок)

NP_001234935
NP_001234936
NP_006449
NP_150594

NP_001272799
NP_001272800
NP_001272802
NP_061368
NP_001347354

Расположение (UCSC)Chr 11: 6.45 - 6.47 МбChr 7: 105,6 - 105,63 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок 3, содержащий трехчастный мотив это белок что у людей кодируется TRIM3 ген.[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства трехчастных мотивов (TRIM), также называемого подгруппой RING-B-box-coiled-coil (RBCC) белков пальца RING. Мотив TRIM включает три цинк-связывающих домена, RING, B-бокс типа 1 и B-бокса типа 2, а также область спиральной спирали. Этот белок локализуется в цитоплазматических филаментах. Он похож на белок крысы, который является специфическим партнером хвостового домена миозина V, класса миозинов, которые участвуют в целевом транспорте органелл. Белок крысы также может взаимодействовать с альфа-актинином-4. Таким образом, предполагается, что этот человеческий белок может играть роль в транспорте грузов, опосредованном миозином V. Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие ту же изоформу.[6]

Взаимодействия

TRIM3 был показан взаимодействовать с Актинин альфа 4.[7]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000110171 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036989 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Эль-Хусейни А.Е., Винсент С.Р. (июль 1999 г.). «Клонирование и характеристика нового белка пальца RING, который взаимодействует с миозинами класса V». Журнал биологической химии. 274 (28): 19771–7. Дои:10.1074 / jbc.274.28.19771. PMID  10391919.
  6. ^ а б "Entrez Gene: TRIM3 трехкомпонентный мотив, содержащий 3".
  7. ^ Эль-Хусейни А.Е., Квасницка Д., Ямада Т., Хирохаши С., Винсент С.Р. (январь 2000 г.). «BERP, новый белок безымянного пальца, связывается с альфа-актинином-4». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 267 (3): 906–11. Дои:10.1006 / bbrc.1999.2045. PMID  10673389.

дальнейшее чтение