Трансактивирующая crRNA - Trans-activating crRNA

В молекулярная биология, трансактивирующая crispr РНК (tracrRNA) - небольшой транскодированный РНК. Впервые он был обнаружен в человек возбудитель Streptococcus pyogenes.[1] В бактерии и археи; CRISPR -Cas (сгруппированные, регулярно расположенные короткие палиндромные повторы / ассоциированные с CRISPR белки) составляют РНК-опосредованную систему защиты, которая защищает от вирусы и плазмиды. Этот защитный путь состоит из трех шагов. Сначала копия вторжения нуклеиновая кислота интегрирован в CRISPR локус. Далее, CRISPR РНК (crRNAs ) находятся записано из этого локуса CRISPR. Затем crРНК включаются в эффекторный комплексы, где crRNA направляет комплекс к вторгающейся нуклеиновой кислоте, а белки Cas разрушают эту нуклеиновую кислоту.[2] Существует несколько подтипов систем CRISPR.

Системы CRISPR-Cas типа II требуют tracrRNA, которая играет роль в созревании crRNA.[3]ТракрРНК частично дополнительный к и пар оснований с пре-crРНК, образующей Дуплекс РНК. Это расщеплено РНКаза III, специфичный для РНК рибонуклеаза, чтобы сформировать гибрид crRNA / tracrRNA. Этот гибрид действует как ориентир для эндонуклеаза Cas9, который расщепляет вторгающуюся нуклеиновую кислоту.[1][4][5]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б Дельчева Э., Чилински К., Шарма С.М., Гонсалес К., Чао Й., Пирзада З.А. и др. (2011). «Созревание РНК CRISPR с помощью транскодируемой малой РНК и фактора хозяина РНКазы III». Природа. 471 (7340): 602–607. Bibcode:2011Натура.471..602D. Дои:10.1038 / природа09886. ЧВК  3070239. PMID  21455174.
  2. ^ Крачки М.П., ​​Крачки Р.М. (2011). «Адаптивные иммунные системы на основе CRISPR». Curr Opin Microbiol. 14 (3): 321–327. Дои:10.1016 / j.mib.2011.03.005. ЧВК  3119747. PMID  21531607.
  3. ^ Шарпантье Э, Рихтер Х, ван дер Ост Дж, Уайт МФ (2015). «Пути биогенеза РНК-проводников в адаптивном иммунитете CRISPR-Cas архей и бактерий». Обзор микробиологии FEMS. 39 (3): 428–441. Дои:10.1093 / femsre / fuv023. ЧВК  5965381. PMID  25994611.
  4. ^ Джинек М., Чилински К., Фонфара И., Хауэр М., Дудна Дж. А., Шарпантье Е. (2012). "Программируемая ДНК-эндонуклеаза, управляемая двойной РНК, в адаптивном бактериальном иммунитете". Наука. 337 (6096): 816–821. Bibcode:2012Sci ... 337..816J. Дои:10.1126 / наука.1225829. ЧВК  6286148. PMID  22745249.
  5. ^ Браунс SJ (2012). «Швейцарский армейский нож неприкосновенности». Наука. 337 (6096): 808–809. Bibcode:2012Sci ... 337..808B. Дои:10.1126 / science.1227253. PMID  22904002.

дальнейшее чтение