Уберон - Uberon

Уберон
Database.png
Содержание
ОписаниеUberon, интегративная онтология многовидовой анатомии.
Типы данных
захвачен
Анатомические структуры
ОрганизмыMetazoa
Контакт
Основное цитированиеMungall & al. (2012)[1]
Дата выхода2012
Доступ
Формат данныхСОВА и ОБО
Интернет сайтhttp://uberon.org
Скачать URLhttp://purl.obolibrary.org/obo/uberon/merged.owl
Sparql конечная точкаhttp://sparql.hegroup.org/sparql
Разное
Лицензияоткрыто

Уберон это сравнительная анатомия онтология представляющие различные структуры, найденные в животные, Такие как легкие, мышцы, кости, перья и плавники. Эти структуры связаны с другими структурами такими отношениями, как часть и складывается из.[1] Одно из применений этой онтологии - интеграция данных из разных биологические базы данных, и другие видоспецифические онтологии, такие как Базовая модель анатомии.[2][3][4]

Рекомендации

  1. ^ а б Мунгалл, Кристофер Дж; Торняй Карло; Гкоутос Георгиос V; Льюис Сюзанна Э; Хендель Мелисса А (2012). «Уберон, интегративная онтология многовидовой анатомии». Геном Биол. Англия. 13 (1): R5. Дои:10.1186 / gb-2012-13-1-r5. ЧВК  3334586. PMID  22293552.
  2. ^ Вашингтон, Н. Л .; Гендель, М.А.; Mungall, C.J .; Ashburner, M .; Westerfield, M .; Льюис, С. Э. (2009). Buetow, Kenneth H (ред.). «Связывание болезней человека с моделями животных с использованием аннотации фенотипа на основе онтологии». PLoS Биология. 7 (11): e1000247. Дои:10.1371 / journal.pbio.1000247. ЧВК  2774506. PMID  19956802.
  3. ^ Hoehndorf, R .; Schofield, P.N .; Гкоутос, Г. В. (2011). «PhenomeNET: комплексный подход к открытию генов болезней». Исследования нуклеиновых кислот. 39 (18): e119. Дои:10.1093 / nar / gkr538. ЧВК  3185433. PMID  21737429.
  4. ^ Chen, C.K .; Mungall, C.J .; Gkoutos, G.V .; Doelken, S.C .; Köhler, S .; Ruef, B.J .; Smith, C .; Westerfield, M .; Робинсон, П. Н .; Lewis, S.E .; Schofield, P.N .; Смедли, Д. (2012). «MouseFinder: гены-кандидаты болезней по данным фенотипа мышей». Человеческая мутация. 33 (5): 858–866. Дои:10.1002 / humu.22051. ЧВК  3327758. PMID  22331800.

внешняя ссылка