VALBOND - VALBOND
В молекулярная механика, VALBOND - это метод вычисления энергии углового изгиба, основанный на теория валентной связи.[1] Он основан на орбитальные силовые функции, которые максимизируются, когда гибридные орбитали на атоме ортогональный. Гибридизация связывающих орбиталей получается из эмпирических формул, основанных на Правило Бента, что связывает предпочтение p-характера с электроотрицательностью.
Функции VALBOND подходят для описания энергии искажения валентных углов не только вокруг равновесных углов, но и при очень больших искажениях. Это дает преимущество перед более простыми гармонический осциллятор приближение, используемое многими силовыми полями, и позволяет методу VALBOND обрабатывать гипервалентные молекулы[2] и комплексы переходных металлов.[3][4] Энергетический термин VALBOND был объединен с силовые поля такие как Очарование[5] и UFF для обеспечения полной функциональной формы, которая также включает растяжение связей, скручивание и несвязанные взаимодействия.
Функциональная форма
Негипервалентные молекулы
Для угла α между нормальными (негипервалентными) связями с участием spмdп гибридная орбиталь, вклад энергии равен
- ,
куда k - эмпирический масштабный коэффициент, который зависит от элементов, входящих в связь, SМаксимум, то функция максимальной силы, является
и S (α) это силовая функция
что зависит от интеграл неортогональности Δ:
Энергетический вклад добавляется дважды, по одному разу на каждую из связывающих орбиталей, участвующих в угле (которые могут иметь разные гибридизации и разные значения для k).
Для негипервалентных атомов p-блока значение гибридизации п равен нулю (без d-орбитального вклада), и м получается как% p (1-% p), где% p - p-характер орбитали, полученный из
где сумма больше j включает все лиганды, неподеленные пары и радикалы на атоме, пп «грубая гибридизация» (например, для «sp2"атом, пп = 2). Вес веся зависит от двух элементов, участвующих в связи (или только одного для неподеленной пары или радикалов), и представляет собой предпочтение p-характера различных элементов. Значения весов являются эмпирическими, но могут быть рационализированы с помощью правила Бента.
Гипервалентные молекулы
Для гипервалентных молекул энергия представлена как комбинация конфигураций VALBOND, которые сродни резонансным структурам, которые размещают трехцентровые четырехэлектронные связи (3c4e) по-разному. Например, ClF3 представлен как имеющий одну "нормальную" двухцентровую связь и одну связь 3c4e. Есть три различных конфигурации для ClF3, каждый из которых использует другую связь Cl-F в качестве двухцентровой связи. Для более сложных систем количество комбинаций быстро увеличивается; SF6 имеет 45 конфигураций.
где сумма по всем конфигурациям j, а коэффициент cj определяется функцией
где «ажиотаж» относится к связям 3c4e. Эта функция гарантирует, что предпочтение отдается конфигурациям, в которых связи 3c4e являются линейными.
Энергетические члены модифицируются путем умножения их на коэффициент порядка связи, BOF, который является произведением формальных порядков связи двух связей, участвующих в угле (для связей 3c4e порядок связи равен 0,5). Для связей 3c4e энергия рассчитывается как
где Δ - снова функция неортогональности, но здесь угол α смещен на 180 градусов (π радиан).
Наконец, чтобы обеспечить воспроизведение аксиального и экваториального предпочтения различных лигандов в гипервалентных соединениях, вычитается термин «энергия смещения». Он имеет вид
где члены EN зависят от электроотрицательность разница между лигандом и центральным атомом следующая:
куда SS равен 1, если разность электроотрицательностей положительна, и 2, если она отрицательна.
Для гипервалентных молекул p-блока d-орбитали не используются, поэтому п = 0. Вклад p м оценивается из ab initio методы квантовой химии и анализ орбиталей естественных облигаций (NBO).
Расширение
Более свежие расширения, доступные в Очарование набор кодов, включая транс-влияние (или транс эффект ) в VALBOND-TRANS[5] и возможность запускать реактивную молекулярную динамику[6] с "Многогосударственным VALBOND"[7] .
Рекомендации
- ^ Рут, Д. М .; Landis, C. R .; Кливленд, Т. Валенс. Концепции связи, применяемые к описанию молекулярной механики молекулярных форм. 1. Приложение к негипервалентным молекулам Р-блока. Варенье. Chem. Soc. 1993, 115, 4201-4209.
- ^ Кливленд, Т .; Ландис, К. Р. Валенс. Концепции Бонда, применяемые к описанию молекулярной механики молекулярных форм. 2. Приложение к гипервалентным молекулам Р-блока. Варенье. Chem. Soc. 1996, 118, 6020-6030. Дои:10.1021 / ja9506521
- ^ Landis, C. R .; Кливленд, Т .; Фирман; Т. К. Валентные концепции связи, применяемые к молекулярно-механическому описанию молекулярных форм. 3. Применение к алкилам и гидридам переходных металлов. Варенье. Chem. Soc. 1998, 120, 2641-2649. Дои:10.1021 / ja9734859
- ^ Фирман; Т. К .; Ландис, К. Р. Валенс. Концепции Бонда, применяемые к описанию молекулярной механики молекулярных форм. 4. Переходные металлы с π-связями. Варенье. Chem. Soc. 2001, 123, 11728-11742. Дои:10.1021 / ja002586v
- ^ а б I. Tubert-Brohman, M. Schmid и M. Meuwly (2009). «Силовое поле молекулярной механики для октаэдрических металлоорганических соединений с учетом транс-влияния». J. Chem. Тео. Chem. 5: 530–539.CS1 maint: несколько имен: список авторов (ссылка на сайт)
- ^ Т. Надь, Дж. Йоса и М. Мьюли. «Многоповерхностная адиабатическая реактивная молекулярная динамика». J. Chem. Тео. Chem. 10: 1366–1375.CS1 maint: несколько имен: список авторов (ссылка на сайт)
- ^ М. Шмид, А. К. Дас, К. Р. Ландис и М. Мьюли (2018). "Multi-State VALBOND для атомистического моделирования гипервалентных молекул, металлических комплексов и реакций". J. Chem. Тео. Chem. 14: 3565–3578.CS1 maint: несколько имен: список авторов (ссылка на сайт)