VPS29 - Википедия - VPS29
VPS29 человек ген кодирование сортировки вакуолярного белка белок Vps29, компонент ретромер сложный.[5]
Гомолог дрожжей
Гомологичный белок (тот, который выполняет ту же функцию) в дрожжах: Вакуолярный гомолог сортировки белков 29 (S. cerevisiae).[6]
Функция
VPS29 принадлежит к группе генов, кодирующих белки вакуолярной сортировки белков (VPS), которые при функциональном нарушении нарушают эффективную доставку вакуолярный гидролазы.[7] Белок, кодируемый этим геном, Vps29, является компонентом большого мультимерного комплекса, называемого ретромер комплекс, который участвует в ретроградном транспорте белков от эндосом к сеть транс-Гольджи. Vps29 может участвовать в формировании внутренней оболочки ретромерной оболочки ретроградных пузырьков, покидающих предвакуолярный компартмент.[8] Альтернативный стык варианты, кодирующие разные изоформы, и использование нескольких полиаденилирование были найдены сайты для этого гена.[6]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111237 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029462 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Эдгар AJ, Полак JM (ноябрь 2000 г.). «Человеческие гомологи дрожжевого вакуолярного белка сортировки 29 и 35». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 277 (3): 622–30. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3727. PMID 11062004.
- ^ а б «Ген Entrez: гомолог 29 вакуолярного сортировочного белка VPS29 (S. cerevisiae)».
- ^ Haft CR, de la Luz Sierra M, Bafford R, Lesniak MA, Barr VA, Taylor SI (декабрь 2000 г.). «Ортологи дрожжевых белков, сортирующих вакуумный белок Vps26, 29 и 35: сборка в мультимерные комплексы». Мол. Биол. Клетка. 11 (12): 4105–16. Дои:10.1091 / mbc.11.12.4105. ЧВК 15060. PMID 11102511.
- ^ Бонифачино Дж. С., Херли Дж. Х. (август 2008 г.). «Ретромер». Curr. Мнение. Cell Biol. 20 (4): 427–36. Дои:10.1016 / j.ceb.2008.03.009. ЧВК 2833274. PMID 18472259.
дальнейшее чтение
- Матрос М.Н., Маккаффри Дж. М., Эмр С. Д. (1998). «Комплекс мембранной оболочки, необходимый для ретроградного транспорта от эндосомы к Гольджи в дрожжах». J. Cell Biol. 142 (3): 665–81. Дои:10.1083 / jcb.142.3.665. ЧВК 2148169. PMID 9700157.
- Эдгар AJ, Полак JM (2000). «Человеческие гомологи дрожжевого вакуолярного белка сортировки 29 и 35». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 277 (3): 622–30. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3727. PMID 11062004.
- Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
- Haft CR, de la Luz Sierra M, Bafford R, et al. (2001). «Ортологи дрожжевых белков, сортирующих вакуумный белок Vps26, 29 и 35: сборка в мультимерные комплексы». Мол. Биол. Клетка. 11 (12): 4105–16. Дои:10.1091 / mbc.11.12.4105. ЧВК 15060. PMID 11102511.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК 311072. PMID 11230166.
- Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК 1083732. PMID 11256614.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Верже М., Лутон Ф., Грубер С. и др. (2004). «Ретромер млекопитающих регулирует трансцитоз полимерного рецептора иммуноглобулина». Nat. Cell Biol. 6 (8): 763–9. Дои:10.1038 / ncb1153. PMID 15247922. S2CID 22296469.
- Mingot JM, Bohnsack MT, Jäkle U, Görlich D (2005). «Exportin 7 определяет новый общий путь ядерного экспорта». EMBO J. 23 (16): 3227–36. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600338. ЧВК 514512. PMID 15282546.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК 528930. PMID 15489336.
- Ван Д., Го М., Лян З. и др. (2005). «Кристаллическая структура человеческого белка 29, сортирующего вакуолярные белки, выявляет фосфодиэстеразу / нуклеазоподобную складку и два сайта белок-белкового взаимодействия». J. Biol. Chem. 280 (24): 22962–7. Дои:10.1074 / jbc.M500464200. PMID 15788412.
- Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК 1347501. PMID 16381901.
- Дамен Э., Кригер Э., Нильсен Дж. Э. и др. (2006). «Ретромерный компонент человеческого Vps29 представляет собой металлофосфоэстеразу для катион-независимого пептида субстрата маннозо-6-фосфатного рецептора». Biochem. J. 398 (3): 399–409. Дои:10.1042 / BJ20060033. ЧВК 1559457. PMID 16737443.
- Рохас Р., Каметака С., Хафт С. Р., Бонифачино Дж. С. (2007). «Взаимозаменяемые, но важные функции SNX1 и SNX2 в ассоциации ретромера с эндосомами и торговле маннозо-6-фосфатными рецепторами». Мол. Клетка. Биол. 27 (3): 1112–24. Дои:10.1128 / MCB.00156-06. ЧВК 1800681. PMID 17101778.
- Йерро А., Рохас А.Л., Рохас Р. и др. (2007). «Функциональная архитектура ретромерного комплекса распознавания грузов». Природа. 449 (7165): 1063–7. Дои:10.1038 / природа06216. ЧВК 2377034. PMID 17891154.
PDB галерея | |
|---|---|
|
 | Эта статья о ген на хромосома человека 12 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |