Белок, связывающий витамин D - Vitamin D-binding protein

GC
Протеин GC PDB 1j78.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыGC, DBP, DBP / GRD3, HEL-S-51, VDBG, VDBP, Gc-MAF, GcMAF, белок, связывающий витамин D, DBP-maf, VDB, GC, белок, связывающий витамин D
Внешние идентификаторыOMIM: 139200 MGI: 95669 ГомолоГен: 486 Генные карты: GC
Расположение гена (человек)
Хромосома 4 (человек)
Chr.Хромосома 4 (человек)[1]
Хромосома 4 (человек)
Геномное расположение для GC
Геномное расположение для GC
Группа4q13.3Начните71,741,696 бп[1]
Конец71,804,041 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE GC 204965 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_000583
NM_001204306
NM_001204307

NM_008096

RefSeq (белок)

NP_000574
NP_001191235
NP_001191236

NP_032122

Расположение (UCSC)Chr 4: 71,74 - 71,8 МбChr 5: 89.42 - 89.46 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок, связывающий витамин D (DBP), также / первоначально известный как gc-глобулин (гспецифичный для группы cкомпонент), является белок что у людей кодируется GC ген.[5][6]

Структура

Человеческий GC представляет собой гликозилированный альфа-глобулин размером ~ 58 кДа. Его 458 аминокислот кодируются 1690 нуклеотидами на хромосоме 4 (4q11 – q13). Первичная структура содержит 28 остатков цистеина, образующих множественные дисульфидные связи. GC содержит 3 домена. Домен 1 состоит из 10 альфа-спиралей, домен 2 из 9 и домен 3 из 4.[7]

Функция

Белок, связывающий витамин D, относится к альбумин генная семья, вместе с человеческий сывороточный альбумин и альфа-фетопротеин. Это многофункциональный белок, содержащийся в плазме, асцитическая жидкость, спинномозговая жидкость и на поверхности многих типов клеток.

Он способен связывать различные формы Витамин Д в том числе эргокальциферол (Витамин Д2) и холекальциферол (Витамин Д3), 25-гидроксилированные формы (кальцифедиол ) и активный гормональный продукт 1,25-дигидроксивитамин D (кальцитриол ). Основная часть витамина D в крови связана с этим белком. Он переносит метаболиты витамина D между кожей, печенью и почками, а затем к различным тканям-мишеням.[6][8]

Так как Фактор активации макрофагов, производный от белка Gc это Фактор активации макрофагов (MAF), который был протестирован для использования в качестве лечения рака, которое активирует макрофаги против раковых клеток.[9]

Интерактивная карта проезда

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. [§ 1]

[[Файл:
ВитаминDSynthesis_WP1531К статьеК статьеК статьеК статьеперейти к статьеК статьеК статьеК статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеК статьеК статьеперейти к статьеК статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеК статьеперейти к статье
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
ВитаминDSynthesis_WP1531К статьеК статьеК статьеК статьеперейти к статьеК статьеК статьеК статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеК статьеК статьеперейти к статьеК статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеК статьеперейти к статье
| {{{bSize}}} px | alt = Путь синтеза витамина D (Посмотреть / редактировать )]]
Путь синтеза витамина D (Посмотреть / редактировать )
  1. ^ Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «VitaminDSynthesis_WP1531».

Производство

Он синтезируется печеночные паренхиматозные клетки и спрятан в кровь тираж.[8]

Генетическая изменчивость

Многие генетические варианты GC ген известны. Производят 6 основных гаплотипы и 3 основных варианта белка (Gc1S, Gc1F и Gc2).[10] Генетические вариации связаны с различиями в уровнях циркулирующего 25-гидроксивитамина D.[11] Они были предложены для объяснения некоторых различий в статусе витамина D у разных этнических групп,[12] и было обнаружено, что они коррелируют с реакцией на добавку витамина D.[10]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000145321 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035540 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Миккельсен М., Якобсен П., Хеннингсен К. (июль 1977 г.). «Возможная локализация Gc-системы на хромосоме 4. Потеря материала длинной руки 4, связанная с несовместимостью отца и ребенка внутри Gc-системы». Человеческая наследственность. 27 (2): 105–7. Дои:10.1159/000152857. PMID  558959.
  6. ^ а б «Ген Entrez: компонент, специфичный для группы GC (белок, связывающий витамин D)».
  7. ^ Verboven C, Rabijns A, De Maeyer M, Van Baelen H, Bouillon R, De Ranter C (февраль 2002 г.). «Структурная основа уникальных свойств связывания человеческого витамин D-связывающего белка». Структурная биология природы. 9 (2): 131–6. Дои:10.1038 / nsb754. PMID  11799400. S2CID  38990672.
  8. ^ а б Норман А.В. (август 2008 г.). «От витамина D к гормону D: основы эндокринной системы витамина D, необходимые для хорошего здоровья». Американский журнал клинического питания. 88 (2): 491S – 499S. Дои:10.1093 / ajcn / 88.2.491S. PMID  18689389.
  9. ^ Ямамото Н., Суяма Н., Ямамото Н. (июль 2008 г.). «Иммунотерапия рака простаты с использованием фактора активации макрофагов, производного от белка Gc, GcMAF» ([PDF]). Трансляционная онкология. 1 (2): 65–72. Дои:10.1593 / tlo.08106. ЧВК  2510818. PMID  18633461.
  10. ^ а б Малик С., Фу Л., Джурас Д.Д., Кармали М., Вонг Б.И., Гоздзик А., Коул Д.Е. (январь – февраль 2013 г.). «Общие варианты гена белка, связывающего витамин D, и неблагоприятные последствия для здоровья». Критические обзоры в клинических лабораторных науках. 50 (1): 1–22. Дои:10.3109/10408363.2012.750262. ЧВК  3613945. PMID  23427793.
  11. ^ МакГрат Дж. Дж., Саха С., Берн Т. Х., Эйлс Д. В. (июль 2010 г.). «Систематический обзор связи между общими однонуклеотидными полиморфизмами и концентрациями 25-гидроксивитамина D». Журнал стероидной биохимии и молекулярной биологии. 121 (1–2): 471–7. Дои:10.1016 / j.jsbmb.2010.03.073. PMID  20363324. S2CID  20057294.
  12. ^ Powe CE, Evans MK, Wenger J, Zonderman AB, Berg AH, Nalls M., Tamez H, Zhang D, Bhan I., Karumanchi SA, Powe NR, Thadhani R (ноябрь 2013 г.). «Витамин D-связывающий белок и статус витамина D у чернокожих американцев и белых американцев». Медицинский журнал Новой Англии. 369 (21): 1991–2000. Дои:10.1056 / NEJMoa1306357. ЧВК  4030388. PMID  24256378.

дальнейшее чтение

внешние ссылки

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P02774 (Витамин D-связывающий белок) в PDBe-KB.