Мотив РНК wcaG - Википедия - wcaG RNA motif
| wcaG РНК-мотив | |
|---|---|
 Консенсусная вторичная структура wcaG РНК | |
| Идентификаторы | |
| Символ | wcaG РНК |
| Рфам | RF01761 |
| Прочие данные | |
| РНК тип | СНГ-регулирующий элемент |
| Домен (ы) | Цианобактерии |
| PDB структуры | PDBe |
В wcaG Мотив РНК является РНК структура сохраняется в некоторых бактерии что было обнаружено биоинформатика.[1] wcaG РНК встречаются в некоторых фаги это заразить цианобактерии. Самый известный wcaG РНК были обнаружены в последовательностях ДНК извлекается из невозделываемых морские бактерии. wcaG РНК могут функционировать как цис-регуляторные элементы, ввиду их последовательного расположения в возможных 5 'непереведенные регионы из гены. Было предложено wcaG РНК могут в дальнейшем функционировать как рибопереключатели.
Предполагается, что гены регулируются wcaG РНК участвуют в синтезе экзополисахариды, или вызваны большим количеством свет. Эти последние гены предположительно связаны с цианобактериальными фотосинтез. Обнаруженный wcaG РНК в очищенных фагах расположены выше выделенных индуцированных генов. Хотя эти гены не считаются типичными для фагов, ранее было замечено, что фаги, инфицирующие цианобактерии, обычно включают такие гены.[2][3][4]
Рекомендации
- ^ Вайнберг З., Ван Дж. Х, Бог Дж. И др. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика обнаруживает 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Геном Биол. 11 (3): R31. Дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. ЧВК 2864571. PMID 20230605.
- ^ Салливан МБ, Коулман М.Л., Вейгеле П., Ровер Ф., Чизхолм С.В. (май 2005 г.). «Три генома Prochlorococcus cyanophage: характерные особенности и экологическая интерпретация». PLoS Biol. 3 (5): e144. Дои:10.1371 / journal.pbio.0030144. ЧВК 1079782. PMID 15828858.
- ^ Ровер Ф., Тербер Р.В. (май 2009 г.). «Вирусы манипулируют морской средой». Природа. 459 (7244): 207–212. Дои:10.1038 / природа08060. PMID 19444207.
- ^ Линделл Д., Джаффе Дж. Д., Коулман М.Л. и др. (Сентябрь 2007 г.). «Полногеномная динамика экспрессии морского вируса и хозяина обнаруживает особенности совместной эволюции». Природа. 449 (7158): 83–86. Дои:10.1038 / природа06130. PMID 17805294.