Ясс (программное обеспечение) - Yass (software)
Стабильный выпуск | 1.14 |
---|---|
Репозиторий | |
Операционная система | Linux, Mac, MS-Windows |
Тип | Биоинформатика инструмент |
Лицензия | GPLv2 CeCILL |
Интернет сайт | https://bioinfo.cristal.univ-lille.fr/yass/ |
ЯСС[1][2] это бесплатно программное обеспечение,[3] попарно программное обеспечение для выравнивания последовательностей за нуклеотид последовательности, то есть он может искать сходства между ДНК или же РНК последовательности. YASS принимает нуклеотидные последовательности в виде простого текста или Формат FASTA а выходной формат включает ВЗРЫВ табличный вывод. ЯСС использует несколько ограниченный переходом посевной материал k-mers, что позволяет значительно повысить чувствительность. YASS можно использовать локально на машине пользователя или как SaaS на Веб-сервер YASS, который создает браузер на основе точечный график.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Ной Л., Кучеров. Г. (2005). «ЯСС: повышение чувствительности поиска сходства ДНК». Исследования нуклеиновых кислот. 33 (2): W540 – W543. Дои:10.1093 / nar / gki478. ЧВК 1160238. PMID 15980530.
- ^ Ной Л., Кучеров. Г. (2004). «Улучшенные критерии попадания для локального выравнивания ДНК». BMC Bioinformatics. 5: 149. Дои:10.1186/1471-2105-5-149. ЧВК 526756. PMID 15485572.
- ^ "ПРОЧТИ МЕНЯ". Получено 7 апреля 2015.
внешняя ссылка
Эта статья по биоинформатике заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |