APOBEC3B - APOBEC3B
Вероятный ДНК dC-> dU-редактирующий фермент APOBEC-3B это белок что у людей кодируется APOBEC3B ген.[5][6][7]
Этот ген является членом цитидин дезаминаза генная семья. Это один из семи родственных генов или псевдогены найдено в кластер, считается результатом дупликация гена, на хромосома 22. Члены кластера кодируют белки, которые структурно и функционально связаны с цитидиндезаминазой, редактирующей РНК от C до U. APOBEC1. Считается, что белки могут редактировать РНК. ферменты и играть роль в росте или клеточный цикл контроль. Этот ген вместе с APOBEC3A в последние годы был обнаружен как связанный с мутагенезом нескольких видов рака. Белки APOBEC3A и APOBEC3B могут вызывать специфические мутации в геномах рака, называемые мутагенезом APOBEC, и несколько факторов, включая генетические и экологические, влияют на этот паттерн мутаций у пациентов, особенно при раке мочевого пузыря и груди.[7] Этот ген также сверхэкспрессируется в множественная миелома, возможно, способствуя его формированию.[8]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000179750 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000009585 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Джармуз А., Честер А., Бейлисс Дж., Гисборн Дж., Данхэм И., Скотт Дж., Наваратнам Н. (февраль 2002 г.). «Антропоид-специфический локус орфанных C to U ферментов, редактирующих РНК, на хромосоме 22». Геномика. 79 (3): 285–96. Дои:10.1006 / geno.2002.6718. PMID 11863358.
- ^ Мэдсен П., Анант С., Расмуссен Х. Х., Громов П., Ворум Х., Думански Дж. П., Томмеруп Н., Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Данхэм И., МакГиннити А. Дж., Дэвидсон Н. О., Селис Дж. Э. (сентябрь 1999 г.). «Форболин-1, активированный псориазом, имеет структурное, но не функциональное сходство с мРНК-редактирующим белком апобек-1». J Invest Dermatol. 113 (2): 162–9. Дои:10.1046 / j.1523-1747.1999.00682.x. PMID 10469298.
- ^ а б «Ген Entrez: фермент редактирования мРНК аполипопротеина B APOBEC3B, каталитический полипептидоподобный 3B».
- ^ Ямазаки, Хироюки; Сиракава, Котаро; Мацумото, Тадахико; Хирабаяси, Шигеки; Муракава, Ясухиро; Кобаяси, Масаюки; Сарка, Анамария Даниэла; Казума, Ясухиро; Мацуи, Хироюки; Маруяма, Ватару; Фукуда, Хирофуми; Сиракава, Рютаро; Синдо, Кейсуке; Ри, Масаки; Иида, Синсукэ; Такаори-Кондо, Акифуми (9 мая 2019 г.). «Эндогенная сверхэкспрессия APOBEC3B постоянно вызывает замены и делеции ДНК в клетках миеломы». Научные отчеты. 9 (1). Дои:10.1038 / с41598-019-43575-у.
внешняя ссылка
- Человек APOBEC3B расположение генома и APOBEC3B страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
дальнейшее чтение
- Ведекинд JE, Dance GS, Соуден MP, Смит HC (2003). «Редактирование матричной РНК у млекопитающих: новые члены семьи APOBEC ищут роли в семейном бизнесе». Тенденции Genet. 19 (4): 207–16. Дои:10.1016 / S0168-9525 (03) 00054-4. PMID 12683974.
- Данэм И., Шимицу Н., Роу Б.А. и др. (1999). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID 10591208.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Мариани Р., Чен Д., Шрёфельбауэр Б. и др. (2003). «Видоспецифическое исключение APOBEC3G из вирионов ВИЧ-1 с помощью Vif». Клетка. 114 (1): 21–31. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00515-4. PMID 12859895.
- Сойер С.Л., Эмерман М., Малик Х.С. (2006). "Древняя адаптивная эволюция антивирусного фермента, редактирующего ДНК приматов APOBEC3G". PLoS Biol. 2 (9): E275. Дои:10.1371 / journal.pbio.0020275. ЧВК 479043. PMID 15269786.
- Ю Кью, Чен Д., Кениг Р. и др. (2005). «APOBEC3B и APOBEC3C являются мощными ингибиторами репликации вируса иммунодефицита обезьян». J. Biol. Chem. 279 (51): 53379–86. Дои:10.1074 / jbc.M408802200. PMID 15466872.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Роза К.М., Марин М., Козак С.Л., Кабат Д. (2005). «Регулируемая продукция и активность против ВИЧ типа 1 цитидиндезаминаз APOBEC3B, 3F и 3G». AIDS Res. Гм. Ретровирусы. 21 (7): 611–9. Дои:10.1089 / помощь.2005.21.611. PMID 16060832.
- Bogerd HP, Wiegand HL, Doehle BP и др. (2006). «APOBEC3A и APOBEC3B являются мощными ингибиторами функции LTR-ретротранспозона в клетках человека». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (1): 89–95. Дои:10.1093 / нар / gkj416. ЧВК 1326241. PMID 16407327.
- Стенглейн, доктор медицины, Харрис, Р.С. (2006). «APOBEC3B и APOBEC3F ингибируют ретротранспозицию L1 с помощью независимого от дезаминирования механизма ДНК». J. Biol. Chem. 281 (25): 16837–41. Дои:10.1074 / jbc.M602367200. PMID 16648136.
- Хаката Y, Ландау Н.Р. (2007). «Обратная функциональная организация доменов цитидиндезаминазы APOBEC3 мыши и человека». J. Biol. Chem. 281 (48): 36624–31. Дои:10.1074 / jbc.M604980200. PMID 17020885.
- Кидд Дж. М., Ньюман Т. Л., Тузун Э. и др. (2007). «Стратификация населения общего полиморфизма делеции гена APOBEC». PLoS Genet. 3 (4): e63. Дои:10.1371 / journal.pgen.0030063. ЧВК 1853121. PMID 17447845.
- Паттерн мутагенеза цитидиндезаминазы APOBEC широко распространен при раковых заболеваниях человека.
Стивен А. Робертс, Майкл С. Лоуренс, Лешек Дж. Климчак, Сара А. Гримм, Дэвид Фарго, Петар Стоянов, Адам Кизун, Грегори В. Крюков, Скотт Л. Картер, Гордон Саксена, Шон Харрис, Ручир Р. Шах, Майкл А. Резник, Гэд Гетц и Дмитрий А Горденин
- Кэндис Д. Миддлбрукс, А. Руф Бандай, Коничи Мацуда и др. Связь вариантов зародышевой линии в области APOBEC3 с риском рака и обогащением с помощью сигнатурных мутаций APOBEC в опухолях. Выйти. Природа Генетики 2016.
 | Эта статья о ген на хромосома человека 22 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |