Аллохерпесвириды - Alloherpesviridae

Аллохерпесвириды
CSIRO ScienceImage 2039 Pilchard Herpesvirus.jpg
ТЕМ микрофотография аллохерпесвируса 'Pilchard herpesvirus'
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Дуплоднавирия
Королевство:Heunggongvirae
Тип:Пепловирикота
Учебный класс:Herviviricetes
Заказ:Herpesvirales
Семья:Аллохерпесвириды
Роды

См. Текст

Аллохерпесвириды это семейство вирусов в порядок Herpesvirales. В это семейство входят виды, поражающие рыб и амфибий. Филогенетические исследования подтвердили валидность этого семейства и предполагают, что его можно разделить на две клады: одна состоит из вирусов от хозяев карповых и ангиллид, а другая - из вирусов от хозяев икталурид, лососевых, аципенсерид и ранид.[1] В настоящее время в этом семействе 13 видов, разделенных на четыре рода. Заболевание, связанное с этим семейством, включает болезнь канального сома.[2][3]

Таксономия

Аллохерпесвириды была основана как семья в 2005 году.

Роды

Семейство включает следующие четыре рода:[3]

Структура

Вирусы в Аллохерпесвириды окутаны, с икосаэдрической и сферической или плеоморфной геометриями и симметрией T = 16. Диаметр около 150-200 нм. Геномы бывают линейными и несегментированными, длиной около 134–248 килобайт. [2]

РодСтруктураСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
ИкталуривирусСферический плеоморфныйТ = 16ОкутанныйКруговойОдночастный
CyprinivirusСферический плеоморфныйТ = 16ОкутанныйЛинейныйОдночастный
БатраховирусСферический плеоморфныйТ = 16ОкутанныйЛинейныйОдночастный
СальмонивирусСферический плеоморфныйТ = 16ОкутанныйЛинейныйОдночастный

Жизненный цикл

Репликация вируса является ядерной и лизогенной. Проникновение в хозяйскую клетку достигается прикреплением вирусных гликопротеинов к рецепторам хозяина, что опосредует эндоцитоз. Транскрипция с использованием ДНК-шаблона - это метод транскрипции. Рыба служит естественным хозяином. Пути передачи - пассивное распространение.[2]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
ИкталуривирусРыбыНиктоГликопротеиныПочкованиеЯдроЯдроПассивная диффузия
CyprinivirusПресноводный угорьНиктоГликопротеиныПочкованиеЦитоплазмаЦитоплазмаПассивная диффузия
БатраховирусЛягушкиНиктоГликопротеиныПочкованиеЦитоплазмаЦитоплазмаПассивная диффузия
СальмонивирусЛососевыеНиктоГликопротеиныПочкованиеЯдроЯдроПассивная диффузия

Геномика

Секвенировано несколько геномов.[4] Карповые герпесвирусы 1, 2 и 3 (CyHV1, CyHV2 и CyHV3) вызывают заболевание у карпа, золотой рыбки и кои соответственно. Их геномы имеют размер соответственно 291144, 290304 и 295146 пар оснований. Общая организация общая для всех трех и состоит из уникальной центральной области, окаймленной прямым повторением на каждом конце. 137, 150 и 155 уникальных функциональных генов, кодирующих белок, присутствуют в уникальных областях соответственно: из этих шести, четырех и восьми соответственно дублируются в концевом повторе. Геномы имеют 120 ортологичных генов, расположенных в значительной степени коллинеарно. До 55 из этих последних генов также законсервированы у другого члена Cyprinivirus; Ангуиллидный герпесвирус 1. CyHV1, CyHV2 и CyHV3 имеют пять, шесть и пять семейств паралоговых генов соответственно.

Рекомендации

  1. ^ Вальцек ТБ, Келли ГО, Альфаро М.Э., Куробе Т., Дэвисон А.Дж., Хедрик Р.П. (2009). «Филогенетические отношения в семействе Alloherpesviridae». Dis. Акват. Org. 84 (3): 179–94. Дои:10.3354 / dao02023. PMID  19565695.
  2. ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 12 июн 2015.
  3. ^ а б «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.». talk.ictvonline.org. Международный комитет по таксономии вирусов. Получено 9 мая 2020.
  4. ^ Дэвисон А.Дж., Куробе Т., Гатерер Д., Каннингем С., Корф И., Фукуда Х., Хедрик Р.П., Вальцек Т.Б. (2013). «Сравнительная геномика герпесвирусов карпа». Дж. Вирол. 87 (5): 2908–22. Дои:10.1128 / JVI.03206-12. ЧВК  3571366. PMID  23269803.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка