Анти-Q РНК - Anti-Q RNA

Анти-Q РНК
RF00388.jpg
Идентификаторы
СимволАнти-Q_RNA
Альт. СимволыQaRNA
РфамRF00388
Прочие данные
РНК типГен; антисмысловой
Домен (ы)Бактерии
ТАКТАК: 0000644
PDB структурыPDBe

Анти-Q РНК (ранее Qa RNA) представляет собой небольшой нкРНК от супружеского плазмида pCF10 из Enterococcus faecalis. Он закодирован в СНГ своей нормативной цели, prgQ, но также может действовать в транс. Известно, что анти-Q взаимодействует с зарождающимися транскриптами prgQ, позволяя формировать внутренний терминатор, или же аттенюатор, тем самым предотвращая транскрипцию нижестоящих генов.[1][2] Этот режим регулирования по существу такой же, как у аттенюаторов, управляемых контртранскриптом, которые контролируют количество копий в pT181,[3] pAMbeta1[4] и pIP501[5] и родственные стафилококковые плазмиды.

Anti-Q транскрибируется с того же сегмента ДНК, что и prgQ, за исключением противоположной цепи, что делает его полностью комплементарным части prgQ. Дальнейшие эксперименты экспериментально подтвердили исходную консенсусную вторичную структуру и продемонстрировали, что только определенные области Anti-Q взаимодействуют с prgQ.[6]

Anti-Q происходит от 5 ’конца более длинного транскрипта. 3 ’конец этого транскрипта кодирует PrgX, репрессор транскрипции prgQ.

Рекомендации

  1. ^ Бэ, Т; Козлович Б.К .; Данни GM (2004). «Характеристика цис-действующих мутантов prgQ: доказательства двух различных механизмов репрессии Qa РНК и белка PrgX в феромон-индуцируемой энтерококковой плазмиде pCF10». Мол Микробиол. 51 (1): 271–281. Дои:10.1046 / j.1365-2958.2003.03832.x. PMID  14651627.
  2. ^ Джонсон С.М., Маниас Д.А., Хемиг Н.А., Шокин С., Уивер К.Э., Хенкин TM, Данни Г.М. (2010). «Прямое доказательство контроля феромон-индуцируемого оперона prgQ плазмиды pCF10 Enterococcus faecalis с помощью механизма ослабления, управляемого контртранскриптом». J Бактериол. 192 (6): 1634–1642. Дои:10.1128 / JB.01525-09. ЧВК  2832536. PMID  20097859.
  3. ^ Новик Р.П., Иорданеску С., Проян С.Дж., Корнблюм Дж., Эдельман И. (1989). «Репликация плазмиды pT181 регулируется аттенюатором транскрипции, управляемым контртранскриптом». Клетка. 59 (2): 395–404. Дои:10.1016/0092-8674(89)90300-0. PMID  2478296.
  4. ^ Le Chatelier E, Ehrlich SD, Jannière L (1996). «Управляемая контртранскриптом система ослабления гена repE pAM beta 1». Мол Микробиол. 20 (5): 1099–1112. Дои:10.1111 / j.1365-2958.1996.tb02550.x. PMID  8809762.
  5. ^ Брантл С., Берч-Хиршфельд Э, Бенке Д. (1993). «Экспрессия белка RepR на плазмиде pIP501 контролируется антисмысловым РНК-опосредованным механизмом ослабления транскрипции». J Бактериол. 175 (13): 4052–4061. ЧВК  204834. PMID  8320221.
  6. ^ Шокин С., Джонсон С.М., Гринфилд Т.Дж., Маниас Д.А., Данни Г.М., Э. Уивер К. (2010). «Структурный анализ взаимодействия Anti-Q-Qs: РНК-опосредованная регуляция конъюгации плазмиды E. faecalis с pCF10». Плазмида. 64 (1): 26–35. Дои:10.1016 / j.plasmid.2010.03.002. ЧВК  2892192. PMID  20332003.

внешняя ссылка