Прикладная математика - Applied Maths

Прикладная математика
Промышленность	Биоинформатика, Биотехнологии
Основан	1992
Штаб-квартира	Синт-Мартенс-Латем, Бельгия
Товары	BioNumerics, GelCompar II, Сервер BioNumeris
Интернет сайт	www.applied-maths.com

Прикладная математика NV является биоинформатика компания со штаб-квартирой в Синт-Мартенс-Латем, Бельгия, разработка программного обеспечения для бионаук.

История

Компания Applied Maths была основана в 1992 году и получила всемирное признание благодаря программному обеспечению GelCompar, используемому в качестве стандартного инструмента для нормализации и сравнительного анализа электрофорез узоры (PFGE, AFLP, RAPD, REP-PCR и варианты и др.).^[1]^[2]

GelCompar II был выпущен в 1998 году для обработки постоянно растущего объема информации после успеха и распространения электрофореза и других методов снятия отпечатков пальцев в различных областях применения в микробиология, вирусология и микология. После введения концепций полифазной таксономии ^[3] и растущая потребность сочетать генотипический, фенотипический, электрофорез и информация о последовательностях, Applied Maths выпустила в 1996 году программный пакет BioNumerics которая до сих пор является платформой для управления, хранения и (статистического) анализа всех типов биологических данных.^[4] BioNumerics и GelCompar II используются несколькими сетями по всему миру, такими как Pulsenet и Calicinet для обмена и идентификации информации о штаммах.^[5]^[6]

В январе 2016 года компанию Applied Maths приобрела bioMérieux.^[7]

Товары

BioNumerics: BioNumerics - это коммерческий набор из 10 программных модулей, используемых для анализа всех основных приложений в биоинформатике: Гели для одномерного электрофореза, хроматографический и спектрометрический профили, фенотип символы, микрочипы, последовательности, так далее.

GelCompar II: GelCompar II - это набор из 5 модулей, разработанных для анализа шаблонов отпечатков пальцев, включая нормализацию, импорт в реляционную базу данных и сравнительный анализ.

BNServer: BNserver - это веб-платформа, обычно устанавливаемая между централизованно обслуживаемой базой данных и распределенными клиентами с использованием BioNumerics, GelCompar II или веб-браузера для обмена биологической информацией и результатами анализа. BNServer используется с девяностых годов для обнаружения пищевых вспышек.^[8]

Прием

Более 15000 рецензируемых научных статей упоминают использование программных пакетов прикладной математики BioNumerics или Gelcompar II.^[9]

внешняя ссылка

Рекомендации

^ Dijkshoorn L., Towner K. J., Struelens M., 2001. Новые подходы к созданию и анализу данных микробного типирования. Эльзевир, ISBN 0-444-50740-X, ISBN 978-0-444-50740-2.
^ Воутерин Л. и Воутерин П. 1992. Компьютерное объективное сравнение образцов электрофореза для группировки и идентификации микроорганизмов. Евро. Microbiol. 1: 37-41.
^ [1] Vandamme et al., Polyphasic taxonomy, консенсусный подход к бактериальной систематике. Microbiol. Мол. Биол. Ред. Июнь 1996 г., т. 60 ч. 2 407-438.
^ Воутерин Л., Вотерин П. Интегрированные базы данных и анализ. В: Молекулярная идентификация, систематика и популяционная структура прокариот (под ред. Эрко Стакебрандта). Спрингер, 2006. ISBN 978-3-540-23155-4
^ Хантер С.Б., Вотерин П., Ламберт-Фэйр М.А., Ван Дайн М.С., Кубота К., Грейвс Л., Ригли Д., Барретт Т., Рибо Э (2005). «Создание универсального стандартного штамма для использования со стандартизованными протоколами импульсного гель-электрофореза PulseNet: преобразование национальных баз данных в новый стандарт размера». J. Clin. Микробиол. 43 (3): 1045–1050. Дои:10.1128 / JCM.43.3.1045-1050.2005. ЧВК 1081233. PMID 15750058.
^ Vega E .; Barclay L .; Gregoricus N .; Уильямс К .; Lee D .; Винже Дж. (2011). «Новая сеть эпиднадзора за вспышками норовирусного гастроэнтерита, США». Emerg Infect Dis. 17 (8): 1389–95. Дои:10.3201 / eid1708.101837. ЧВК 3381557. PMID 21801614.
^ bioMérieux приобретает Applied Maths и расширяет свои возможности в области биоинформатики с помощью передового опыта и решений для интеллектуального использования сложных биологических данных
^ Сваминатан Б., Гернер-Смидт П., Нг Л.К., Лукинмаа С., Кам К.М., Роландо С., Гутьеррес Е.П., Бинштейн Н., 2006. «Строительство PulseNet International: Взаимосвязанная система лабораторных сетей для облегчения своевременного распознавания и реагирования со стороны общественного здравоохранения на вспышки болезней пищевого происхождения и возникающие болезни пищевого происхождения ". Пищевые патогены и болезни. Весна 2006 г., 3 (1): 36-50. Дои:10.1089 / fpd.2006.3.36
^ Научные статьи с использованием программных продуктов Applied Maths Проверено 20 июня 2014 г.

[1] Dijkshoorn L., Towner K. J., Struelens M., 2001. Новые подходы к созданию и анализу данных микробного типирования. Эльзевир, ISBN 0-444-50740-X, ISBN 978-0-444-50740-2.

[2] Воутерин Л. и Воутерин П. 1992. Компьютерное объективное сравнение образцов электрофореза для группировки и идентификации микроорганизмов. Евро. Microbiol. 1: 37-41.

[3] [1] Vandamme et al., Polyphasic taxonomy, консенсусный подход к бактериальной систематике. Microbiol. Мол. Биол. Ред. Июнь 1996 г., т. 60 ч. 2 407-438.

[4] Воутерин Л., Вотерин П. Интегрированные базы данных и анализ. В: Молекулярная идентификация, систематика и популяционная структура прокариот (под ред. Эрко Стакебрандта). Спрингер, 2006. ISBN 978-3-540-23155-4

[5] Хантер С.Б., Вотерин П., Ламберт-Фэйр М.А., Ван Дайн М.С., Кубота К., Грейвс Л., Ригли Д., Барретт Т., Рибо Э (2005). «Создание универсального стандартного штамма для использования со стандартизованными протоколами импульсного гель-электрофореза PulseNet: преобразование национальных баз данных в новый стандарт размера». J. Clin. Микробиол. 43 (3): 1045–1050. Дои:10.1128 / JCM.43.3.1045-1050.2005. ЧВК 1081233. PMID 15750058.

[6] Vega E .; Barclay L .; Gregoricus N .; Уильямс К .; Lee D .; Винже Дж. (2011). «Новая сеть эпиднадзора за вспышками норовирусного гастроэнтерита, США». Emerg Infect Dis. 17 (8): 1389–95. Дои:10.3201 / eid1708.101837. ЧВК 3381557. PMID 21801614.

[7] Mérieux приобретает Applied Maths и расширяет свои возможности в области биоинформатики с помощью передового опыта и решений для интеллектуального использования сложных биологических данных

[8] Сваминатан Б., Гернер-Смидт П., Нг Л.К., Лукинмаа С., Кам К.М., Роландо С., Гутьеррес Е.П., Бинштейн Н., 2006. «Строительство PulseNet International: Взаимосвязанная система лабораторных сетей для облегчения своевременного распознавания и реагирования со стороны общественного здравоохранения на вспышки болезней пищевого происхождения и возникающие болезни пищевого происхождения ". Пищевые патогены и болезни. Весна 2006 г., 3 (1): 36-50. Дои:10.1089 / fpd.2006.3.36

[9] Научные статьи с использованием программных продуктов Applied Maths Проверено 20 июня 2014 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]