BRD2 - BRD2

BRD2
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1X0J, 2DVQ, 2DVR, 2DVS, 2DVV, 2E3K, 2Г4А, 2YDW, 2YEK, 3AQA, 3ONI, 4A9E, 4A9F, 4A9H, 4A9I, 4A9J, 4А9М, 4A9N, 4A9O, 4АКН, 4ALG, 4ALH, 4J1P, 4МР5, 4MR6, 4QEU, 4QEV, 4QEW, 4UYF, 4UYG, 4UYH, 5BT5, 5DFD, 5HEM, 5DFB, 5HEL, 5HFQ, 5HEN, 5DFC, 5IG6, 5IBN, 5DW1
Идентификаторы
Псевдонимы	BRD2, D6S113E, FSH, FSRG1, NAT, RING3, RNF3, O27.1.1, бромодомен, содержащий 2, BRD2-IT1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601540 MGI: 99495 ГомолоГен: 74540 Генные карты: BRD2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 6 (человек)
Конец	32,981,505 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 17 (мышь)
Конец	34,122,634 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание хроматина; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание лизин-ацетилированного гистона;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • ядро клетки; • нуклеоплазма; • ядерное пятнышко;
Биологический процесс	• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • сборка нуклеосом; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • транскрипция, ДНК-шаблон; • сперматогенез; • организация хроматина; • GO: 0022415 вирусный процесс;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6046
	14312
ENSG00000215077; ENSG00000234507; ENSG00000230678; ENSG00000204256; ENSG00000235307;
	ENSG00000236227; ENSG00000234704
	ENSMUSG00000024335
	P25440
	Q7JJ13
	NM_001113182; NM_001199455; NM_001199456; NM_001291986; NM_005104
	NM_001025387; NM_001204973; NM_010238
	NP_001106653; NP_001186384; NP_001186385; NP_001278915; NP_005095
	NP_001191902; NP_034368
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Бромодомен-содержащий белок 2 это белок что у людей кодируется BRD2 ген. BRD2 является частью семейства белков бромодоменов и экстратерминальных мотивов (BET), которые также содержат BRD3, BRD4, и BRDT у млекопитающих ^[5]^[6]^[7]

Ранние описания продемонстрировали, что продукт гена BRD2 представляет собой митоген-активированную киназу, которая локализуется в ядре. Ген отображается на главный комплекс гистосовместимости (MHC) класса II регион на хромосома 6p21.3 но сравнение последовательностей предполагает, что белок не участвует в иммунном ответе. Гомология Дрозофила ген женской стерильности гомеотик предполагает, что этот человеческий ген может быть частью путь передачи сигнала участвует в контроле роста.^[7]

Функции

BRD2 участвует в развитии рака.^[5]^[8]
Потеря BRD2 у мышей по неизвестным причинам вызывает ожирение без диабета.^[5]
BRD2 может иметь функциональное перекрытие с близким гомологом BRD3.^[9]
Функция BRD2 заблокирована Ингибиторы БЭТ.

Взаимодействия

BRD2 был показан взаимодействовать с участием E2F2,^[10]^[11] и многие факторы транскрипции, включая GATA1.^[9]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ENSG00000234507, ENSG00000230678, ENSG00000204256, ENSG00000235307, ENSG00000236227, ENSG00000234704 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000215077, ENSG00000234507, ENSG470002000234507, ENSG7002000, ENSG60020002 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024335 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ^а ^б ^c Белкина, А. Ц .; Денис, Г. В. (2012). «Корегуляторы BET-домена при ожирении, воспалении и раке». Обзоры природы Рак. 12 (7): 465–77. Дои:10.1038 / nrc3256. ЧВК 3934568. PMID 22722403.
^ Торп К.Л., Абдулла С., Кауфман Дж., Троусдейл Дж., Бек С. (октябрь 1996 г.). «Филогения и структура гена RING3». Иммуногенетика. 44 (5): 391–6. Дои:10.1007 / BF02602785. PMID 8781126. S2CID 44613743.
^ ^а ^б «Бромодомен BRD2, содержащий 2 [Homo sapiens (человек)]».
^ Ши, Дж; Вакоч, К. Р. (2014). «Механизмы терапевтического действия ингибирования бромодомена BET». Молекулярная клетка. 54 (5): 728–36. Дои:10.1016 / j.molcel.2014.05.016. ЧВК 4236231. PMID 24905006.
^ ^а ^б Stonestrom, A.J .; Hsu, S.C .; Jahn, K. S .; Хуанг, П; Keller, C.A .; Giardine, B.M .; Кадауке, S; Кэмпбелл, А. Э .; Evans, P; Hardison, R.C .; Блобель Г. А. (2015). «Функции белков BET в экспрессии эритроидных генов». Кровь. 125 (18): 2825–34. Дои:10.1182 / кровь-2014-10-607309. ЧВК 4424630. PMID 25696920.
^ Кроули, Томас Э; Кейн Эмили М; Ёсида Манабу; Нанди Аниндита; Wolgemuth Debra J (август 2002 г.). «Регуляция репродуктивного цикла ядерного импорта, эухроматической локализации и ассоциации с компонентами медиатора Pol II двойного бромодоменного белка млекопитающих». Мол. Эндокринол. Соединенные Штаты. 16 (8): 1727–37. Дои:10.1210 / me.2001-0353. ISSN 0888-8809. PMID 12145330.
^ Денис, Г. В; Вазири С; Guo N; Фаллер Д. В. (август 2000 г.). «Киназа RING3 трансактивирует промоторы регуляторных генов клеточного цикла через E2F». Рост клеток отличается. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 11 (8): 417–24. ISSN 1044-9523. ЧВК 3968681. PMID 10965846.

внешние ссылки

Человек BRD2 расположение генома и BRD2 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

Хейнс С.Р., Доллард С., Уинстон Ф. и др. (1992). «Бромодомен: консервативная последовательность, обнаруженная в белках человека, дрозофилы и дрожжей». Нуклеиновые кислоты Res. 20 (10): 2603. Дои:10.1093 / nar / 20.10.2603. ЧВК 312404. PMID 1350857.
Окамото Н., Андо А., Каваи Дж. И др. (1992). «Ориентация гена HLA-ДНК и идентификация гена, связанного с островком CpG, смежного с ДНК в области класса II главного комплекса гистосовместимости человека». Гм. Иммунол. 32 (3): 221–8. Дои:10.1016 / 0198-8859 (91) 90059-И. PMID 1663500.
Денис Г.В., Грин М.Р. (1996). «Новая митоген-активируемая ядерная киназа связана с регулятором развития дрозофилы». Genes Dev. 10 (3): 261–71. Дои:10.1101 / gad.10.3.261. PMID 8595877.
Торп К.Л., Горман П., Томас С. и др. (1997). «Хромосомная локализация, структура гена и образец транскрипции гена ORFX, гомолога гена RING3, связанного с MHC». Ген. 200 (1–2): 177–83. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00415-0. PMID 9373153.
Танигучи Ю., Мацудзака Ю., Фудзимото Х. и др. (1998). «Нуклеотидная последовательность гена ring3 в области класса II MHC мыши и ее обильная экспрессия в половых клетках семенников». Геномика. 51 (1): 114–23. Дои:10.1006 / geno.1998.5262. PMID 9693039.
Го Н, Фаллер Д.В., Денис Г.В. (2000). "Ядерная транслокация RING3, вызванная активацией". J. Cell Sci. 113 (17): 3085–91. ЧВК 3936601. PMID 10934046.
Денис Г.В., Вазири С., Го Н., Фаллер Д.В. (2001). «Киназа RING3 трансактивирует промоторы регуляторных генов клеточного цикла через E2F». Рост клеток отличается. 11 (8): 417–24. ЧВК 3968681. PMID 10965846.
BelAiba RS, Baril P, Chebloune Y, et al. (2001). «Идентификация и клонирование белка массой 85 кДа, гомологичного RING3, который активируется в пролиферирующих эндотелиальных клетках». Евро. J. Biochem. 268 (16): 4398–407. Дои:10.1046 / j.1432-1327.2001.02355.x. PMID 11502199.
Кроули Т.Э., Кейн Е.М., Йошида М. и др. (2003). «Регуляция репродуктивного цикла ядерного импорта, эухроматической локализации и ассоциации с компонентами медиатора Pol II двойного бромодоменного белка млекопитающих». Мол. Эндокринол. 16 (8): 1727–37. Дои:10.1210 / me.2001-0353. PMID 12145330.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Чжоу М., Пэн С., Не Х.М. и др. (2003). «[Экспрессия BRD7-взаимодействующих белков, BRD2 и BRD3, в тканях карциномы носоглотки]». AI Чжэн. 22 (2): 123–7. PMID 12600283.
Пал Д.К., Евграфов О.В., Табарес П. и др. (2003). "BRD2 (RING3) - вероятный главный ген предрасположенности к распространенной ювенильной миоклонической эпилепсии". Am. J. Hum. Genet. 73 (2): 261–70. Дои:10.1086/377006. ЧВК 1180366. PMID 12830434.
Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID 14574404.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Канно Т., Канно И., Сигель Р.М. и др. (2004). «Селективное распознавание ацетилированных гистонов белками бромодомена, визуализированных в живых клетках». Мол. Ячейка. 13 (1): 33–43. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00482-9. PMID 14731392.
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК 514446. PMID 15302935.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Беневоленская Е.В., Мюррей Х.Л., Брантон П. и др. (2005). «Связывание pRB с белком PHD RBP2 способствует клеточной дифференцировке». Мол. Ячейка. 18 (6): 623–35. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.05.012. PMID 15949438.

Эта белок -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ENSG00000234507, ENSG00000230678, ENSG00000204256, ENSG00000235307, ENSG00000236227, ENSG00000234704 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000215077, ENSG00000234507, ENSG470002000234507, ENSG7002000, ENSG60020002 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024335 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid22722403-5] а ^б ^c Белкина, А. Ц .; Денис, Г. В. (2012). «Корегуляторы BET-домена при ожирении, воспалении и раке». Обзоры природы Рак. 12 (7): 465–77. Дои:10.1038 / nrc3256. ЧВК 3934568. PMID 22722403.

[pmid8781126-6] Торп К.Л., Абдулла С., Кауфман Дж., Троусдейл Дж., Бек С. (октябрь 1996 г.). «Филогения и структура гена RING3». Иммуногенетика. 44 (5): 391–6. Дои:10.1007 / BF02602785. PMID 8781126. S2CID 44613743.

[entrez-7] а ^б «Бромодомен BRD2, содержащий 2 [Homo sapiens (человек)]».

[8] Ши, Дж; Вакоч, К. Р. (2014). «Механизмы терапевтического действия ингибирования бромодомена BET». Молекулярная клетка. 54 (5): 728–36. Дои:10.1016 / j.molcel.2014.05.016. ЧВК 4236231. PMID 24905006.

[pmid25696920-9] а ^б Stonestrom, A.J .; Hsu, S.C .; Jahn, K. S .; Хуанг, П; Keller, C.A .; Giardine, B.M .; Кадауке, S; Кэмпбелл, А. Э .; Evans, P; Hardison, R.C .; Блобель Г. А. (2015). «Функции белков BET в экспрессии эритроидных генов». Кровь. 125 (18): 2825–34. Дои:10.1182 / кровь-2014-10-607309. ЧВК 4424630. PMID 25696920.

[pmid12145330-10] Кроули, Томас Э; Кейн Эмили М; Ёсида Манабу; Нанди Аниндита; Wolgemuth Debra J (август 2002 г.). «Регуляция репродуктивного цикла ядерного импорта, эухроматической локализации и ассоциации с компонентами медиатора Pol II двойного бромодоменного белка млекопитающих». Мол. Эндокринол. Соединенные Штаты. 16 (8): 1727–37. Дои:10.1210 / me.2001-0353. ISSN 0888-8809. PMID 12145330.

[pmid10965846-11] Денис, Г. В; Вазири С; Guo N; Фаллер Д. В. (август 2000 г.). «Киназа RING3 трансактивирует промоторы регуляторных генов клеточного цикла через E2F». Рост клеток отличается. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 11 (8): 417–24. ISSN 1044-9523. ЧВК 3968681. PMID 10965846.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]