Бокапарвовирус - Bocaparvovirus

Бокапарвовирус
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Моноднавирия
Королевство:Shotokuvirae
Тип:Cossaviricota
Учебный класс:Quintoviricetes
Заказ:Piccovirales
Семья:Parvoviridae
Подсемейство:Parvovirinae
Род:Бокапарвовирус
Типовой вид
Бокапарвовирус копытных 1
Разновидность

см текст

Бокапарвовирус это род вирусы в подсемействе Parvovirinae семейства вирусов Parvoviridae.[1][2] Естественными хозяевами служат люди, крупный рогатый скот и собаки. В настоящее время в этом роду насчитывается 25 видов, включая типовые виды. Бокапарвовирус копытных 1.[3] Заболевания, связанные с этим видом, включают у людей острые респираторные заболевания, а также у крупного рогатого скота, диарею и легкие респираторные симптомы.[4][5]

История

Бокавирусы были впервые описаны у животных в начале 1960-х годов.

Геном

Как и у других членов этого семейства, у бокапарвовирусов есть два открытые рамки для чтения —ORF1 и 2. Уникальные среди парвовирусов бокапарвовирусы содержат третью открытую рамку считывания между неструктурными и структурными кодирующими областями.[6] Этот ген кодирует высоко фосфорилированный неструктурный белок (NP1).

ORF1 кодирует неструктурный белок (NS1), который участвует в репликации вирусного генома. ORF2 кодирует два капсидных белка - VP1 и VP2.

Как и другие парвовирусы, уникальный регион VP1 содержит фосфолипаза Мотив (2) с сохраненным Гистидин –Аспарагиновая кислота -XXY мотив в каталитическом центре.[7]

Таксономия

Группа: ssDNAЗаказ: Piccovirales

[5]

Детали вируса

В ParvoviridaeВ настоящее время виды обычно определяются как кластер вирусов, которые кодируют белки инициатора репликации (называемые NS1), аминокислотные последовательности которых по крайней мере на 85% идентичны последовательностям, кодируемым всеми другими членами этого вида.[8]

В настоящее время существует 25 признанных видов Бокапарвовирус. Это бокапарвовирус плотоядных 1–6, бокапарвовирус рукокрылых 1–4, бокапарвовирус ластоногих 1 и 2, бокаапарвовирус зайцеобразных 1, бокапарвовирус приматов 1 и 2, бокапарвовирус грызунов 1 и 2 и бокапарвовирус копытных животных 1–8. В бокавирусы человека принадлежат к двум видам приматов. Бывший (до 2014 г.) «типовой вид» этого рода, бокавирус крупного рогатого скота, теперь признан основополагающей последовательностью вируса в более широком виде, называемом Бокапарвовирус копытных 1, который является видом нового типа. Собачий минутный вирус теперь классифицируется как вирус вида Бокапарвовирус плотоядных 1.

Сурки также были идентифицированы как хозяева новых бокапарвовирусов.[9]

Вирусология

Бокавирусы крупного рогатого скота используют эндоцитоз в везикулах, покрытых клатрином, для проникновения в клетки; они зависят от подкисления и, по-видимому, связаны с зависимостью от актина и микротрубочек.[10]

Все бокапарвовирусы кодируют новый белок под названием NP1, которого нет в парвовирусах других родов. В Собачий минутный вирус Было показано, что NP1 важен для ранней стадии вирусной репликации, а также необходим для считывания внутреннего сайта полиаденилирования, который необходим для экспрессии белков капсида.[11]

Жизненный цикл

Репликация вируса является ядерной. Проникновение в клетку-хозяин достигается за счет прикрепления к рецепторам хозяина, которые опосредуют клатрин-опосредованный эндоцитоз. Репликация повторяет модель шпильки. ДНК-шаблонная транскрипция с некоторым альтернативным механизмом сплайсинга - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина за счет экспорта ядерной поры. Естественным хозяином служат люди, крупный рогатый скот и собаки. Пути передачи - оральный и респираторный.[4]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
БокапарвовирусЛюди; коровы; собакиНиктоКлатрин-опосредованный эндоцитозраннее высвобождение из жизнеспособных клеток и лизис клетокЯдроЯдроАэрозоль

Клинический

Эти вирусы обычно поражают желудочно-кишечный тракт и дыхательные пути. Некоторые из них могут проникать через плаценту и вызывать врожденное инфицирование плода.

Собачий минутный вирус, впервые выделенный в 1967 г. и связанный с заболеванием в 1970 г., вызывает респираторное заболевание с затруднением дыхания и энтерит с тяжелой диареей, самопроизвольным выкидышем и смертью новорожденных щенков.

Бокавирусы человека были впервые изолированы в 2005 г. Швеция.[12] Они могут вызвать гепатит у хозяина с подавленным иммунитетом.[13]

Бокапарвовирусы были выделены из рака толстой кишки и легких человека.[14] Клиническая важность этого открытия - если таковая имеется - еще предстоит выяснить.

Заболеваемость бокавирусом у больных раком выше, чем у здоровых людей.[15]

Структура

Как и другие парвовирусы, бокапарвовирусы обладают икосаэдр и круглая структура с симметрией T = 1. Капсид не имеет оболочки и состоит из 60 копий до шести типов белков капсида (называемых от VP1 до VP6), которые имеют общую С-концевую область. Структура вирусоподобной частицы, состоящей только из белка VP2, определялась криогенная электронная микроскопия и реконструкция изображения.[16] Диаметр около 21-22 нм. Геномы линейны, длиной около 5,5 КБ.[4]

РодСтруктураСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
БокапарвовирусИкосаэдрТ = 1Без оболочкиЛинейныйНикто

Рекомендации

  1. ^ Котмор, Сан-Франциско; Agbandje-McKenna, M; Канути, М; Chiorini, JA; Эйс-Хубингер, А; Хьюз, Дж; Mietzsch, M; Modha, S; Ольястро, М; Пензес, JJ; Пинтель, диджей; Цю, Дж; Содерлунд-Венермо, М; Tattersall, P; Tijssen, P; и Консорциум отчетов ICTV (2019). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Parvoviridae". Журнал общей вирусологии. 100 (3): 367–368. Дои:10.1099 / jgv.0.001212. ЧВК  6537627. PMID  30672729.
  2. ^ «10-й отчет ICTV (2018)».
  3. ^ "10-й отчет ICTV (2018 г.)Бокапарвовирус".
  4. ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 12 июн 2015.
  5. ^ а б «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.». talk.ictvonline.org. Международный комитет по таксономии вирусов. Получено 5 мая 2020.
  6. ^ Мантефель, Джилл; Труен, Уве (2008). «Бокавирусы животных: краткий обзор». Интервирология. 51 (5): 328–334. Дои:10.1159/000173734. PMID  19023216.
  7. ^ Цюй, Сяо-Ван; Лю, Вэнь-Пей; Ци, Чжэн-Ю; Дуань, Чжао-Цзюнь; Чжэн Ли-Шу; Куанг, Цзы-Чжоу; Чжан Ван-Цзюй; Хоу, Юнь-Де (2008). «Фосфолипазная А2-подобная активность уникальной области VP1 бокавируса человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 365 (1): 158–63. Дои:10.1016 / j.bbrc.2007.10.164. PMID  17981142.
  8. ^ Котмор С.Ф., Маккенна М.А., Чиорини Д.А., Гатерер Д., Муха Д.В., Пинтель Д.В., Цю Дж., Венермо М.С., Таттерсалл П., Тейссен П. (19 июля 2013 г.). «Рационализация и расширение таксономии семейства Parvoviridae» (PDF). Международный комитет по таксономии вирусов. ICTV. Получено 1 сентября 2020.
  9. ^ Ао, Юаньюнь; Ли, Сяоюй; Ли, Лили; Се, Сяолу; Джин, Донг; Ю, Цзиемей; Лу, Шань; Дуань, Чжаоцзюнь (2017). «Два новых вида бокапарвовируса, выявленные у диких гималайских сурков». Наука Китай Науки о жизни. 60 (12): 1348–1356. Дои:10.1007 / s11427-017-9231-4. ЧВК  7089499. PMID  29218438.
  10. ^ Dudleenamjil, E; Lin, C.-Y; Земснаряд, D; Мюррей, Б.К .; Робисон, Р. А; Джонсон, Ф. Б. (2010). «Парвовирус крупного рогатого скота использует клатрин-опосредованный эндоцитоз для проникновения в клетки». Журнал общей вирусологии. 91 (12): 3032–3041. Дои:10.1099 / vir.0.024133-0. PMID  20810750.
  11. ^ Суху, Л; Фасина, О; Бургер, L; Рай, А; Цю, Дж; Пинтель, Д. Дж (2012). "Характеристика неструктурных белков Bocavirus Minute Virus собак". Журнал вирусологии. 87 (2): 1098–1104. Дои:10.1128 / JVI.02627-12. ЧВК  3554049. PMID  23135724.
  12. ^ Allander, T; Tammi, M.T; Эрикссон, М; Бьеркнер, А; Tiveljung-Lindell, A; Андерссон, Б. (2005). «Клонирование парвовируса человека путем молекулярного скрининга образцов дыхательных путей». Труды Национальной академии наук. 102 (36): 12891–6. Bibcode:2005PNAS..10212891A. Дои:10.1073 / pnas.0504666102. ЧВК  1200281. PMID  16118271.
  13. ^ Кайнулайнен, Л; Waris, M; Содерлунд-Венермо, М; Allander, T; Хедман, К; Руусканен, О (2008). «Гепатит и первичная инфекция бокавируса человека у ребенка с дефицитом Т-клеток». Журнал клинической микробиологии. 46 (12): 4104–4105. Дои:10.1128 / JCM.01288-08. ЧВК  2593268. PMID  18842946.
  14. ^ Шильдген, Верена; Малецки, Моника; Тилльманн, Рамона-Лиза; Брокманн, Майкл; Шильдген, Оливер (2013). «Бокавирус человека связан с некоторыми видами рака легких и колоректального рака и сохраняется в солидных опухолях». PLOS ONE. 8 (6): e68020. Bibcode:2013PLoSO ... 868020S. Дои:10.1371 / journal.pone.0068020. ЧВК  3694905. PMID  23826357.
  15. ^ Ли, Яша; Дун, Янмин; Цзян, июнь; Ян, Юнбо; Лю, Кайю; Ли, Ю.И. (2012). «Высокая распространенность [sic] парвовирусной инфекции человека у пациентов со злокачественными опухолями». Письма об онкологии. 3 (3): 635–640. Дои:10.3892 / ол.2012.548. ЧВК  3362544. PMID  22740966.
  16. ^ Гурда, Б. Л; Родитель, К. Н; Bladek, H; Синковиц, Р. С; Диматтия, М. А; Ренс, C; Кастро, А; McKenna, R; Олсон, Н; Браун, К; Бейкер, Т. С; Агбандье-Маккенна, М. (2010). "Структура капсида бокавируса человека: понимание структурного репертуара Parvoviridae". Журнал вирусологии. 84 (12): 5880–9. Дои:10.1128 / JVI.02719-09. ЧВК  2876641. PMID  20375175.

внешняя ссылка