CDKAL1 - Википедия - CDKAL1
CDKAL1 (Cdk5 регуляторный ассоциированный белок 1-подобный 1) является геном семейства метилтиотрансфераз. Полная физиологическая функция и последствия этого полностью не определены. CDKAL1, как известно, кодирует CDK5, белок 1, связанный с регуляторной субъединицей.[6] Этот белок CDK5 Связанный с регуляторной субъединицей белок 1 широко обнаруживается в тканях различных типов, включая нейрональные ткани и бета-клетки поджелудочной железы.[7] Предполагается, что CDKAL1 участвует в пути CDK5 / p35, в котором p35 является активатором CDK5, который регулирует несколько нейрональных функций.[8]
Структура и функции
Структурно CDKAL1 содержит два кластера железа (Fe) серы (S), поэтому его функция может быть снижена путем ингибирования биосинтеза кластеров Fe-S.[9] Ферментативно CDKAL1 катализирует метилтиолирование N6-треонилкарбамоиладенозин 37 (t6A37) в цитозольной тРНК, которая, как было установлено, стабилизирует взаимодействия антикодон-кодон во время трансляции.[10][11]
Клиническое значение
У людей CDKAL1 участвует в сахарный диабет II типа. CDKAL1 и TCF7L2 было показано, что снижает выработку инсулина.[12] Некоторые исследования показывают, что варианты CDKAL1 модифицируют тРНК, что приводит к повышенному риску сахарный диабет II типа а также ожирение.[13] Вариация CDKAL1 также объяснялась различиями в регуляции энергии. Однонуклеотидный полиморфизм Анализ привел к открытию механизма реакций глюкозы и инсулина, показанных на рисунке. Исходя из этой взаимосвязи, было выдвинуто предположение, что регуляторные гены CDKAL1 и GIP (глюкозозависимый инсулинотропный полипептид) связаны с селективностью окружающей среды и адаптивным иммунитетом.[1]
Полногеномные исследования ассоциации связали однонуклеотидный полиморфизм в интрон на хромосоме 6 с восприимчивостью к диабет 2 типа `. [предоставлено RefSeq, май 2010 г.].[14]
Исследования на животных
У мышей нарушение CDKAL1 снижает способность мышей поддерживать гомеостаз глюкозы и вызывает гипертрофию островков поджелудочной железы или поражения поджелудочной железы.[15]
Рекомендации
- ^ а б Чанг С.Л., Цай Дж.Дж., Хуанг С.И., Ченг П.Дж., Чуэ Х.Й., Сюй С.Ю. (15.09.2014). «Адаптивные варианты CDKAL1 человека лежат в основе вариаций гормонального ответа на энтероинсулярной оси». PLOS ONE. 9 (9): e105410. Bibcode:2014PLoSO ... 9j5410C. Дои:10.1371 / journal.pone.0105410. ЧВК 4164438. PMID 25222615.
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000145996 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000006191 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Чинг Ю.П., Пан А.С., Лам У.Х., Ци Р.З., Ван Дж.Х. (май 2002 г.). «Идентификация нейронального белка, связывающего активатор Cdk5, в качестве ингибитора Cdk5». Журнал биологической химии. 277 (18): 15237–40. Дои:10.1074 / jbc.C200032200. PMID 11882646.
- ^ Вэй Ф.Й., Нагашима К., Охшима Т., Сахеки Й., Лу Ю.Ф., Мацусита М. и др. (Октябрь 2005 г.). «Cdk5-зависимая регуляция глюкозо-стимулированной секреции инсулина». Природа Медицина. 11 (10): 1104–8. Дои:10,1038 / нм 1299. PMID 16155576. S2CID 23702471.
- ^ Такасуги Т., Минегиси С., Асада А., Сайто Т., Кавахара Х., Хисанага С. (февраль 2016 г.). «Два пути деградации субъединицы активации p35 Cdk5 (циклин-зависимая киназа), зависимые и независимые от убиквитинирования». Журнал биологической химии. 291 (9): 4649–57. Дои:10.1074 / jbc.M115.692871. ЧВК 4813488. PMID 26631721.
- ^ Сантос М.С., Андерсон С.П., Нешен С., Зумбреннен-Буллоу К.Б., Ромни С.Дж., Кале-Стефан М. и др. (Январь 2020 г.). «Irp2 регулирует выработку инсулина посредством опосредованной железом модификации тРНК, катализируемой Cdkal1». Nature Communications. 11 (1): 296. Bibcode:2020NatCo..11..296S. Дои:10.1038 / s41467-019-14004-5. ЧВК 6962211. PMID 31941883.
- ^ Сантос М.С., Андерсон С.П., Нешен С., Зумбреннен-Буллоу К.Б., Ромни С.Дж., Кале-Стефан М. и др. (Январь 2020 г.). «Irp2 регулирует выработку инсулина посредством опосредованной железом модификации тРНК, катализируемой Cdkal1». Nature Communications. 11 (1): 296. Bibcode:2020NatCo..11..296S. Дои:10.1038 / s41467-019-14004-5. ЧВК 6962211. PMID 31941883.
- ^ Харрис К.А., Бобай Б.Г., Сарахан К.Л., Симс А.Ф., Билбиль Ю., Дойч С. и др. (Август 2015 г.). «Структурный анализ треонилкарбамоил-АМФ-синтазы и ее взаимодействия с субстратом» на основе ЯМР ». Журнал биологической химии. 290 (33): 20032–43. Дои:10.1074 / jbc.M114.631242. ЧВК 4536411. PMID 26060251.
- ^ Кирхгоф К., Мачикао Ф., Хаупт А., Шефер С.А., Тшриттер О, Штайгер Х. и др. (Апрель 2008 г.). «Полиморфизмы в генах TCF7L2, CDKAL1 и SLC30A8 связаны с нарушением конверсии проинсулина». Диабетология. 51 (4): 597–601. Дои:10.1007 / s00125-008-0926-у. PMID 18264689.
- ^ Палмер С.Дж., Брукнер Р.Дж., Пауло Дж.А., Казак Л., Лонг Дж.З., Мина А.И. и др. (Октябрь 2017 г.). «Cdkal1, ген предрасположенности к диабету 2 типа, регулирует функцию митохондрий в жировой ткани». Молекулярный метаболизм. 6 (10): 1212–1225. Дои:10.1016 / j.molmet.2017.07.013. ЧВК 5641635. PMID 29031721.
- ^ «Ген Entrez: белок 1-подобный 1, связанный с регуляторной субъединицей CDK5». Получено 2012-03-12.
- ^ Вэй Ф.Й., Сузуки Т., Ватанабе С., Кимура С., Кайцука Т., Фудзимура А. и др. (Сентябрь 2011 г.). «Дефицит модификации тРНК (Lys) с помощью Cdkal1 вызывает развитие диабета 2 типа у мышей». Журнал клинических исследований. 121 (9): 3598–608. Дои:10.1172 / JCI58056. ЧВК 3163968. PMID 21841312.
внешняя ссылка
- Человек CDKAL1 расположение генома и CDKAL1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
дальнейшее чтение
- Zeggini E, Weedon MN, Lindgren CM, Frayling TM, Elliott KS, Lango H, et al. (Июнь 2007 г.). Консорциум Wellcome Trust Case Control (WTCCC). «Репликация сигналов ассоциации по всему геному в образцах Великобритании выявляет локусы риска диабета 2 типа». Наука. 316 (5829): 1336–41. Bibcode:2007 Наука ... 316.1336Z. Дои:10.1126 / science.1142364. ЧВК 3772310. PMID 17463249.
- Паско Л., Тура А., Патель С.К., Ибрагим И.М., Ферраннини Э., Зеггини Э. и др. (Декабрь 2007 г.). «Общие варианты новых генов диабета 2 типа CDKAL1 и HHEX / IDE связаны со снижением функции бета-клеток поджелудочной железы». Сахарный диабет. 56 (12): 3101–4. Дои:10.2337 / db07-0634. PMID 17804762.
- Хорикоши М., Хара К., Ито С., Седзима Н., Нагаи Р., Уэки К. и др. (Декабрь 2007 г.). «Вариации гена HHEX связаны с повышенным риском диабета 2 типа у населения Японии». Диабетология. 50 (12): 2461–6. Дои:10.1007 / s00125-007-0827-5. PMID 17928989.
- Вольф Н., Кваранта М., Прескотт Н.Дж., Аллен М., Смит Р., Бёрден А.Д. и др. (Февраль 2008 г.). «Псориаз связан с локусами плейотропной восприимчивости, идентифицированными при диабете II типа и болезни Крона». Журнал медицинской генетики. 45 (2): 114–6. Дои:10.1136 / jmg.2007.053595. PMID 17993580. S2CID 23285801.
- Омори С., Танака И., Такахаши А., Хиросе Х., Кашиваги А., Каку К. и др. (Март 2008 г.). «Ассоциация CDKAL1, IGF2BP2, CDKN2A / B, HHEX, SLC30A8 и KCNJ11 с предрасположенностью к диабету 2 типа в популяции Японии». Сахарный диабет. 57 (3): 791–5. Дои:10.2337 / db07-0979. PMID 18162508.
- Cauchi S, Proença C, Choquet H, Gaget S, De Graeve F, Marre M и др. (Март 2008 г.). «Анализ новых локусов риска диабета 2 типа в общей французской популяции: исследование D.E.S.I.R.». Журнал молекулярной медицины. 86 (3): 341–8. Дои:10.1007 / s00109-007-0295-х. PMID 18210030. S2CID 21785287.
Эта статья о ген на хромосома человека 6 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |