Коннекограмма - Connectogram

Коннекограммы графические представления коннектомика, область исследований, посвященная отображению и интерпретации всех белое вещество волоконно-оптические связи в человеческом мозге. Эти круговые графики основаны на диффузная МРТ данные использовать теория графов продемонстрировать связи белого вещества и корковый характеристики отдельных структур, отдельных субъектов или популяций.

Структура

Коннекограмма, показывающая средние связи и размеры коры 110 нормальных правшей мужчин в возрасте 25-36 лет.
Легенда для метаданных, представленных в различных кольцах коннектограммы.

Предпосылки и описание

В коннектограмма, как графическое изображение мозга коннектомика, был предложен в 2012 году.[1]

Круговые представления связей использовались в ряде дисциплин; примеры включают представление аспектов эпидемий,[2] географические сети,[3] музыкальные ритмы,[4] разнообразие популяций птиц,[5] и геномные данные.[6] Коннекограммы также были названы источником вдохновения для стиля отображения хедз-ап шлема Тони Старка в Железный человек 3.[7]

Мозги окрашены в соответствии с внешним кольцом коннектограммы.

Коннекограммы круглые, левая половина изображает левое полушарие, а правая половина - правое полушарие. Полушария далее разбиваются на лобная доля, островковая кора, лимбическая доля, височная доля, теменная доля, затылочная доля, подкорковые структуры и мозжечок. Внизу между двумя полушариями также изображен ствол мозга. Внутри этих долей каждая корковая область помечена аббревиатурой и ей присвоен свой цвет, который можно использовать для обозначения тех же кортикальных областей на других рисунках, таких как разбитые поверхности мозга на соседнем изображении, чтобы читатель мог найти соответствующие области коры головного мозга на геометрически точной поверхности, и вы увидите, насколько разными могут быть соединенные области. Внутри кольца корковой поверхности концентрические круги представляют разные атрибуты соответствующих областей коры. Эти метрические кольца в порядке от внешнего к внутреннему представляют собой серое вещество объем, площадь поверхности, толщина коры, кривизна и степень связности (относительная доля волокон, начинающихся или заканчивающихся в данной области, по сравнению со всем мозгом). Внутри этих кругов линии соединяют области, которые оказались структурно связанными. Относительная плотность (количество волокон) этих соединений отражается в непрозрачности линий, так что можно легко сравнивать различные соединения и их структурное значение. В фракционная анизотропия каждого соединения отражается в его цвете.[1]

Использует

Картирование мозга

Благодаря недавним согласованным усилиям по отображению всего человеческого мозга и его связей,[8][9] становится все более важным найти способы графического представления больших объемов данных, связанных с коннектомика. Большинство других представлений коннектома используют 3 измерения и, следовательно, требуют интерактивного графического интерфейса пользователя.[1] Коннекограмма может отображать 83 кортикальных области в каждом полушарии и визуально отображать, какие области структурно связаны, и все это на плоской поверхности. Поэтому его удобно хранить в картах пациентов или отображать в печати. Графики изначально были разработаны с использованием инструмента визуализации под названием Circos ,.[10][11]

Клиническое использование

Коннекограмма, типичная для клинического применения, демонстрирующая предполагаемое повреждение соединения в Финеас Гейдж, который в 1848 году выжил, когда через его череп и мозг проткнули большой железный пруток. На коннекограмме показаны только те соединения, которые предположительно были повреждены.

На индивидуальном уровне коннекограммы могут использоваться для информирования о лечении пациентов с нейроанатомическими аномалиями. Коннекограммы использовались для наблюдения за прогрессированием неврологического восстановления пациентов, перенесших травматическое повреждение мозга (TBI).[12] Их также применяли к известным пациентам. Финеас Гейдж, оценить ущерб его нейронная сеть (а также повреждение на корковом уровне - основное внимание в более ранних исследованиях Гейджа).[13]

Эмпирическое исследование

Коннекограммы могут представлять средние показатели коры головного мозга (объем серого вещества, площадь поверхности, толщина коры, кривизна и степень связности), а также трактография данные, такие как средняя плотность и фракционная анизотропия соединений, для популяций любого размера. Это позволяет проводить визуальное и статистическое сравнение между группами, такими как мужчины и женщины,[14] разные возрастные группы или здоровые контрольные группы и пациенты. Некоторые версии использовались для анализа разбиения сетей на группы пациентов.[15] или относительный баланс между межполушарными и внутриполушарными связями.[16]

Измененные версии

Есть много возможностей, для которых меры включаются в кольца коннекограммы. Иримиа и Ван Хорн (2012) опубликовали коннектограммы, которые исследуют корреляционные отношения между регионами и используют цифры для сравнения подходов теории графов и коннектомики.[17]Некоторые из них были опубликованы без учета корковых показателей.[18] Другие включают дополнительные меры, касающиеся нейронные сети,[19] которые могут быть добавлены как дополнительные кольца внутрь для отображения показателей теория графов, как в расширенной коннектограмме:

Коннектограмма здорового контрольного субъекта, включающая 5 дополнительных узловых измерений, не включенных в стандартную коннектограмму. Снаружи внутрь кольца представляют собой область коры, объем серого вещества, площадь поверхности, толщину коры, кривизну, степень связности, прочность узлов, центральность между узлами, эксцентриситет, эффективность узлов и центральность собственных векторов. Между степенью связи и мощностью узла было добавлено пустое кольцо в качестве заполнителя.

Регионы и их сокращения

АкронимРегион в коннекограмме
ACgG / SПередняя часть поясная извилина и борозда
ACIRINSПередний сегмент круговая борозда островка
ALSHorpГоризонтальная ветвь переднего отрезка боковая борозда (или трещина)
ALSVerpВертикальная ветвь переднего сегмента боковой борозды (или щели)
AngGУгловая извилина
AOcSПередняя затылочная борозда и преокципитальная вырезка (височно-затылочная вырезка)
ATrCoSПередняя поперечная коллатеральная борозда
CcSКалькариновая борозда
CgSMarpМаргинальная ветвь (или часть) поясной борозды
CoS / LinSМедиальная затылочно-височная борозда (коллатеральная борозда) и язычная борозда
CSЦентральная борозда (Трещина Роландо)
CunCuneus
FMarG / SЛобно-краевая извилина (Вернике) и борозда
FuGБоковая затылочно-височная извилина (веретенообразная извилина )
HGИзвилина Гешля (передняя поперечная височная извилина)
ИнфСиРыНижний сегмент круговой борозды островка
InfFGOppОперкулярная часть нижней лобной извилины
InfFGOrpОрбитальная часть нижней лобной извилины
InfFGTripТреугольная часть нижней лобной извилины
InfFSНижняя лобная борозда
InfOcG / SНижняя затылочная извилина и борозда
InfPrCSНижняя часть прецентральной борозды
IntPS / TrPSИнтрапериетальная борозда (межпариетальная борозда) и поперечные теменные борозды
InfTGНижняя височная извилина
InfTSНижняя височная борозда
JSSulcus intermediateus primus (Дженсена)
LinGЛингвальная извилина, язычная часть медиальной затылочно-височной извилины
ЛОКТЫБоковая затылочно-височная борозда
ПОДСТАВКА / CINSДлинная островковая извилина и центральная островковая борозда
LOrSБоковая орбитальная борозда
MACgG / SСредне-передняя часть поясной извилины и борозды
МЕДОРСМедиальная орбитальная борозда (обонятельная борозда)
MFGСредняя лобная извилина
MFSСредняя лобная борозда
МОКГСредняя затылочная извилина, боковая затылочная извилина
MOcS / LuSСредняя затылочная борозда и лунная борозда
MPosCgG / SСредне-задняя часть поясной извилины и борозды
MTGСредняя височная извилина
OcPoЗатылочный полюс
OrGОрбитальные извилины
OrSОрбитальные борозды (Н-образные борозды)
PaCL / SПарацентральная долька и борозда
PaHipGПарагиппокампальная извилина, парагиппокампальная часть медиальной затылочно-височной извилины
PerCaSПериклозальная борозда (S мозолистого тела)
POcSТеменно-затылочная борозда (или трещина)
PoPlПолярная плоскость верхней височной извилины
PosCGПостцентральная извилина
PosCSПостцентральная борозда
PosDCgGЗадне-дорсальная часть поясной извилины
PosLSЗадняя ветвь (или сегмент) боковой борозды (или щели)
PosTrCoSЗадняя поперечная коллатеральная борозда
PosVCgGЗадне-вентральная часть поясной извилины (перешеек поясной извилины)
PrCGПрецентральная извилина
PrCunPrecuneus
RGПрямая извилина (прямая извилина)
SbCaGСубкаллозальная область, подкаллозальная извилина
SbCG / SСубцентральная извилина (центральная покрышка) и борозды
SbOrSСуборбитальная борозда (sulcus rostrales, супраорбитальная борозда)
SbPSПод теменная борозда
ShoInGКороткие островные извилины
СУМАРГСупрамаргинальная извилина
ПОДДЕРЖКАВерхний сегмент круговой борозды островка
SupFGВерхняя лобная извилина
SupFSВерхняя лобная борозда
SupOcGВерхняя затылочная извилина
SupPrCSВерхняя часть прецентральной борозды
ПОДДЕРЖКА / TROCSВерхняя затылочная борозда и поперечная затылочная борозда
SupPLВерхняя теменная долька
SupTGLpБоковой аспект верхней височной извилины
ПОДДЕРЖКАВерхняя височная борозда
TPlВисочная плоскость верхней височной извилины
TPoВисочный полюс
TrFPoG / SПоперечные лобные извилины и борозды
ТрТСПоперечная височная борозда
AmgМиндалевидное тело
МожетХвостатое ядро
БедроГиппокамп
NAccNucleus accumbens
ПриятельПаллидум
ПуПутамен
ThaТаламус
CeBМозжечок
BStemМозговой ствол

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c Иримия, Андрей; Chambers, M.C .; Torgerson, C.M .; Ван Хорн, Дж. Д. (2 апреля 2012 г.). «Круговое представление корковых сетей человека для коннектомической визуализации на уровне субъектов и популяции». NeuroImage. 60 (2): 1340–51. Дои:10.1016 / j.neuroimage.2012.01.107. ЧВК  3594415. PMID  22305988.
  2. ^ Го, Чжэньян; и другие. (Январь 2013). «Национальные границы эффективно останавливают распространение бешенства: текущая эпидемия бешенства в Китае смещена с случаями в соседних странах». PLoS забытые тропические болезни. 7 (1): e2039. Дои:10.1371 / journal.pntd.0002039. ЧВК  3561166. PMID  23383359.
  3. ^ Хеннеманн, Стефан (2013). «Информационно-насыщенная визуализация плотных географических сетей». Журнал карт. 9 (1): 1–8. Дои:10.1080/17445647.2012.753850.
  4. ^ Ламере, Пол (2012-11-12). "Бесконечный музыкальный автомат". Музыкальное оборудование.
  5. ^ Jetz, W .; Г. Х. Томас; Дж. Б. Джой; К. Хартманн; А. О. Муерс (15 ноября 2012 г.). «Глобальное разнообразие птиц в пространстве и времени». Природа. 491 (7424): 444–448. Bibcode:2012Натура.491..444J. Дои:10.1038 / природа11631. PMID  23123857.
  6. ^ Ип, Кевин; и другие. (26 сентября 2012 г.). «Классификация участков генома человека на основе экспериментально определенных сайтов связывания более 100 факторов, связанных с транскрипцией». Геномная биология. 13 (9): R48. Дои:10.1186 / gb-2012-13-9-r48. ЧВК  3491392. PMID  22950945.
  7. ^ Барбас, Хелен (октябрь 2017 г.). Пауло Дж. Гонсалвес (ред.). VR, AR, MR МОДЕЛИРОВАНИЕ И ВДОХНОВЕНИЕ ИЗ "IRON MAN 3" (PDF). Европейская конференция по моделированию и моделированию. Получено 6 ноября 2017.
  8. ^ «Проект Human Connectome». НАЦИОНАЛЬНЫЕ ИНСТИТУТЫ ЗДРАВООХРАНЕНИЯ США.
  9. ^ "Hard Cell". Экономист. 9 марта 2013 г.. Получено 11 марта 2013.
  10. ^ "Введение в циркулярные данные, особенности и использование // Циркулярная визуализация геномных данных CIRCOS".
  11. ^ Krzywinski, M; Schein, J; Бироль, I; Коннорс, Дж; Гаскойн, Р. Хорсман, Д; Джонс, SJ; Марра, Массачусетс (28 мая 2009 г.). "Circos: информационная эстетика для сравнительной геномики". Геномные исследования. 19 (9): 1639–1645. Дои:10.1101 / гр.092759.109. ЧВК  2752132. PMID  19541911.
  12. ^ Иримия, Андрей; Chambers, M.C .; Torgerson, C.M .; Filippou, M .; Hovda, D.A .; Alger, J.R .; Gerig, G .; Toga, A.W .; Vespa, PM; Kikinis, R .; Ван Хорн, Дж. Д. (6 февраля 2012 г.). «Индивидуальная визуализация коннектомики для оценки атрофии белого вещества при черепно-мозговой травме». Границы неврологии. 3: 10. Дои:10.3389 / fneur.2012.00010. ЧВК  3275792. PMID  22363313.
  13. ^ Ван Хорн, Джон Д .; Irimia, A .; Torgerson, C.M .; Chambers, M.C .; Kikinis, R .; Тога, А. (16 мая 2012 г.). Sporns, Олаф (ред.). «Картирование нарушений связи в случае Финеаса Гейджа». PLoS ONE. 7 (5): e37454. Bibcode:2012PLoSO ... 737454V. Дои:10.1371 / journal.pone.0037454. ЧВК  3353935. PMID  22616011.
  14. ^ Ингалхаликар, Мадхура; Алекс Смит; Дрю Паркер; Теодор Саттертуэйт; Марк Эллиотт; Коша Рупарел; Хакон Хаконарсон; Ракель Гур; Рагини Верма (декабрь 2013 г.). «Половые различия в структурном коннектоме человеческого мозга». Труды Национальной академии наук. 111 (2): 823–8. Bibcode:2014ПНАС..111..823И. Дои:10.1073 / pnas.1316909110. ЧВК  3896179. PMID  24297904.
  15. ^ Мессе, Арно; Софи Каплен; Мелани Пелегрини-Иссак; Софи Бланчо; Ричард Леви; Нозар Агахани; Мишель Монтрей; Хабиб Бенали; Стефан Лехериси (6 июня 2013 г.). «Специфические и развивающиеся изменения сети состояния покоя при постконтузионном синдроме после легкой травматической травмы головного мозга». PLoS ONE. 8 (6): e65470. Bibcode:2013PLoSO ... 865470M. Дои:10.1371 / journal.pone.0065470. ЧВК  3675039. PMID  23755237.
  16. ^ Ви, Чонг-Яу; Пью-Тиан Яп; Даоцян Чжан; Лихонг Ван; Динган Шен (7 марта 2013 г.). «Моделирование связности разреженных фМРТ с ограничениями по группе для выявления умеренных когнитивных нарушений». Структура и функции мозга. 219 (2): 641–656. Дои:10.1007 / s00429-013-0524-8. ЧВК  3710527. PMID  23468090.
  17. ^ Иримия, Андрей; Джек Ван Хорн (29 октября 2012 г.). «Структурная, коннектомическая и сетевая ковариация человеческого мозга». NeuroImage. 66: 489–499. Дои:10.1016 / j.neuroimage.2012.10.066. ЧВК  3586751. PMID  23116816.
  18. ^ Pandit, A.S .; Робинсон Э; Aljabar P; Ball G; Гусиас И.С. Ван З; Hajnal JV; Rueckert D; Counsell SJ; Montana G; Эдвардс AD (31 марта 2013 г.). «Картирование структурных связей у младенцев с помощью всего мозга выявляет измененную силу связи, связанную с ростом и преждевременными родами». Кора головного мозга. 24 (9): 2324–2333. Дои:10.1093 / cercor / bht086. PMID  23547135.
  19. ^ Sporns, Олаф (2011). Сети мозга. MIT Press. ISBN  978-0-262-01469-4.

дальнейшее чтение

[далее 1][далее 2][далее 3][далее 4]

  1. ^ Петрелла, Джеффри; П. Мурали Дорайсвами (9 апреля 2013 г.). «От мостов Кенигсберга до полей Альцгеймера». Неврология. 80 (15): 1360–2. Дои:10.1212 / WNL.0b013e31828c3062. PMID  23486887.
  2. ^ Крэддок, Р. Кэмерон; Саад Джбабди; Чао-Гань Янь; Джошуа Т. Фогельштейн; Ф. Ксавье Кастелланос; Адриана Ди Мартино; Клэр Келли; Кейт Хеберлейн; Стэн Колкомб; Майкл П. Милхэм (июнь 2013 г.). «Визуализация человеческих коннектомов на макроуровне». Методы природы. 10 (6): 524–39. Дои:10.1038 / nmeth.2482. ЧВК  4096321. PMID  23722212.
  3. ^ Маргулис, Дэниел; Иоахим Бёттгер; Айми Ватанабе; Кшиштоф Й. Горголевски (15 октября 2013 г.). «Визуализация человеческого коннектома». NeuroImage. 80: 445–61. Дои:10.1016 / j.neuroimage.2013.04.111. PMID  23660027.
  4. ^ Карунакаран, Суганья; Мэтью Дж. Ролло; Камин Ким; Джессика А. Джонсон; Гридхар П. Каламангалам; Бехнаам Аажанг; Нитин Тандон (5 декабря 2017 г.). «Сеть межприступной мезиальной височной эпилепсии». Эпилепсия. 59 (1): 244–258. Дои:10.1111 / epi.13959. PMID  29210066.