Коннекограмма - Connectogram
Коннекограммы графические представления коннектомика, область исследований, посвященная отображению и интерпретации всех белое вещество волоконно-оптические связи в человеческом мозге. Эти круговые графики основаны на диффузная МРТ данные использовать теория графов продемонстрировать связи белого вещества и корковый характеристики отдельных структур, отдельных субъектов или популяций.
Структура
Предпосылки и описание
В коннектограмма, как графическое изображение мозга коннектомика, был предложен в 2012 году.[1]
Круговые представления связей использовались в ряде дисциплин; примеры включают представление аспектов эпидемий,[2] географические сети,[3] музыкальные ритмы,[4] разнообразие популяций птиц,[5] и геномные данные.[6] Коннекограммы также были названы источником вдохновения для стиля отображения хедз-ап шлема Тони Старка в Железный человек 3.[7]
Коннекограммы круглые, левая половина изображает левое полушарие, а правая половина - правое полушарие. Полушария далее разбиваются на лобная доля, островковая кора, лимбическая доля, височная доля, теменная доля, затылочная доля, подкорковые структуры и мозжечок. Внизу между двумя полушариями также изображен ствол мозга. Внутри этих долей каждая корковая область помечена аббревиатурой и ей присвоен свой цвет, который можно использовать для обозначения тех же кортикальных областей на других рисунках, таких как разбитые поверхности мозга на соседнем изображении, чтобы читатель мог найти соответствующие области коры головного мозга на геометрически точной поверхности, и вы увидите, насколько разными могут быть соединенные области. Внутри кольца корковой поверхности концентрические круги представляют разные атрибуты соответствующих областей коры. Эти метрические кольца в порядке от внешнего к внутреннему представляют собой серое вещество объем, площадь поверхности, толщина коры, кривизна и степень связности (относительная доля волокон, начинающихся или заканчивающихся в данной области, по сравнению со всем мозгом). Внутри этих кругов линии соединяют области, которые оказались структурно связанными. Относительная плотность (количество волокон) этих соединений отражается в непрозрачности линий, так что можно легко сравнивать различные соединения и их структурное значение. В фракционная анизотропия каждого соединения отражается в его цвете.[1]
Использует
Картирование мозга
Благодаря недавним согласованным усилиям по отображению всего человеческого мозга и его связей,[8][9] становится все более важным найти способы графического представления больших объемов данных, связанных с коннектомика. Большинство других представлений коннектома используют 3 измерения и, следовательно, требуют интерактивного графического интерфейса пользователя.[1] Коннекограмма может отображать 83 кортикальных области в каждом полушарии и визуально отображать, какие области структурно связаны, и все это на плоской поверхности. Поэтому его удобно хранить в картах пациентов или отображать в печати. Графики изначально были разработаны с использованием инструмента визуализации под названием Circos ,.[10][11]
Клиническое использование
На индивидуальном уровне коннекограммы могут использоваться для информирования о лечении пациентов с нейроанатомическими аномалиями. Коннекограммы использовались для наблюдения за прогрессированием неврологического восстановления пациентов, перенесших травматическое повреждение мозга (TBI).[12] Их также применяли к известным пациентам. Финеас Гейдж, оценить ущерб его нейронная сеть (а также повреждение на корковом уровне - основное внимание в более ранних исследованиях Гейджа).[13]
Эмпирическое исследование
Коннекограммы могут представлять средние показатели коры головного мозга (объем серого вещества, площадь поверхности, толщина коры, кривизна и степень связности), а также трактография данные, такие как средняя плотность и фракционная анизотропия соединений, для популяций любого размера. Это позволяет проводить визуальное и статистическое сравнение между группами, такими как мужчины и женщины,[14] разные возрастные группы или здоровые контрольные группы и пациенты. Некоторые версии использовались для анализа разбиения сетей на группы пациентов.[15] или относительный баланс между межполушарными и внутриполушарными связями.[16]
Измененные версии
Есть много возможностей, для которых меры включаются в кольца коннекограммы. Иримиа и Ван Хорн (2012) опубликовали коннектограммы, которые исследуют корреляционные отношения между регионами и используют цифры для сравнения подходов теории графов и коннектомики.[17]Некоторые из них были опубликованы без учета корковых показателей.[18] Другие включают дополнительные меры, касающиеся нейронные сети,[19] которые могут быть добавлены как дополнительные кольца внутрь для отображения показателей теория графов, как в расширенной коннектограмме:
Регионы и их сокращения
Акроним | Регион в коннекограмме |
---|---|
ACgG / S | Передняя часть поясная извилина и борозда |
ACIRINS | Передний сегмент круговая борозда островка |
ALSHorp | Горизонтальная ветвь переднего отрезка боковая борозда (или трещина) |
ALSVerp | Вертикальная ветвь переднего сегмента боковой борозды (или щели) |
AngG | Угловая извилина |
AOcS | Передняя затылочная борозда и преокципитальная вырезка (височно-затылочная вырезка) |
ATrCoS | Передняя поперечная коллатеральная борозда |
CcS | Калькариновая борозда |
CgSMarp | Маргинальная ветвь (или часть) поясной борозды |
CoS / LinS | Медиальная затылочно-височная борозда (коллатеральная борозда) и язычная борозда |
CS | Центральная борозда (Трещина Роландо) |
Cun | Cuneus |
FMarG / S | Лобно-краевая извилина (Вернике) и борозда |
FuG | Боковая затылочно-височная извилина (веретенообразная извилина ) |
HG | Извилина Гешля (передняя поперечная височная извилина) |
ИнфСиРы | Нижний сегмент круговой борозды островка |
InfFGOpp | Оперкулярная часть нижней лобной извилины |
InfFGOrp | Орбитальная часть нижней лобной извилины |
InfFGTrip | Треугольная часть нижней лобной извилины |
InfFS | Нижняя лобная борозда |
InfOcG / S | Нижняя затылочная извилина и борозда |
InfPrCS | Нижняя часть прецентральной борозды |
IntPS / TrPS | Интрапериетальная борозда (межпариетальная борозда) и поперечные теменные борозды |
InfTG | Нижняя височная извилина |
InfTS | Нижняя височная борозда |
JS | Sulcus intermediateus primus (Дженсена) |
LinG | Лингвальная извилина, язычная часть медиальной затылочно-височной извилины |
ЛОКТЫ | Боковая затылочно-височная борозда |
ПОДСТАВКА / CINS | Длинная островковая извилина и центральная островковая борозда |
LOrS | Боковая орбитальная борозда |
MACgG / S | Средне-передняя часть поясной извилины и борозды |
МЕДОРС | Медиальная орбитальная борозда (обонятельная борозда) |
MFG | Средняя лобная извилина |
MFS | Средняя лобная борозда |
МОКГ | Средняя затылочная извилина, боковая затылочная извилина |
MOcS / LuS | Средняя затылочная борозда и лунная борозда |
MPosCgG / S | Средне-задняя часть поясной извилины и борозды |
MTG | Средняя височная извилина |
OcPo | Затылочный полюс |
OrG | Орбитальные извилины |
OrS | Орбитальные борозды (Н-образные борозды) |
PaCL / S | Парацентральная долька и борозда |
PaHipG | Парагиппокампальная извилина, парагиппокампальная часть медиальной затылочно-височной извилины |
PerCaS | Периклозальная борозда (S мозолистого тела) |
POcS | Теменно-затылочная борозда (или трещина) |
PoPl | Полярная плоскость верхней височной извилины |
PosCG | Постцентральная извилина |
PosCS | Постцентральная борозда |
PosDCgG | Задне-дорсальная часть поясной извилины |
PosLS | Задняя ветвь (или сегмент) боковой борозды (или щели) |
PosTrCoS | Задняя поперечная коллатеральная борозда |
PosVCgG | Задне-вентральная часть поясной извилины (перешеек поясной извилины) |
PrCG | Прецентральная извилина |
PrCun | Precuneus |
RG | Прямая извилина (прямая извилина) |
SbCaG | Субкаллозальная область, подкаллозальная извилина |
SbCG / S | Субцентральная извилина (центральная покрышка) и борозды |
SbOrS | Суборбитальная борозда (sulcus rostrales, супраорбитальная борозда) |
SbPS | Под теменная борозда |
ShoInG | Короткие островные извилины |
СУМАРГ | Супрамаргинальная извилина |
ПОДДЕРЖКА | Верхний сегмент круговой борозды островка |
SupFG | Верхняя лобная извилина |
SupFS | Верхняя лобная борозда |
SupOcG | Верхняя затылочная извилина |
SupPrCS | Верхняя часть прецентральной борозды |
ПОДДЕРЖКА / TROCS | Верхняя затылочная борозда и поперечная затылочная борозда |
SupPL | Верхняя теменная долька |
SupTGLp | Боковой аспект верхней височной извилины |
ПОДДЕРЖКА | Верхняя височная борозда |
TPl | Височная плоскость верхней височной извилины |
TPo | Височный полюс |
TrFPoG / S | Поперечные лобные извилины и борозды |
ТрТС | Поперечная височная борозда |
Amg | Миндалевидное тело |
Может | Хвостатое ядро |
Бедро | Гиппокамп |
NAcc | Nucleus accumbens |
Приятель | Паллидум |
Пу | Путамен |
Tha | Таламус |
CeB | Мозжечок |
BStem | Мозговой ствол |
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c Иримия, Андрей; Chambers, M.C .; Torgerson, C.M .; Ван Хорн, Дж. Д. (2 апреля 2012 г.). «Круговое представление корковых сетей человека для коннектомической визуализации на уровне субъектов и популяции». NeuroImage. 60 (2): 1340–51. Дои:10.1016 / j.neuroimage.2012.01.107. ЧВК 3594415. PMID 22305988.
- ^ Го, Чжэньян; и другие. (Январь 2013). «Национальные границы эффективно останавливают распространение бешенства: текущая эпидемия бешенства в Китае смещена с случаями в соседних странах». PLoS забытые тропические болезни. 7 (1): e2039. Дои:10.1371 / journal.pntd.0002039. ЧВК 3561166. PMID 23383359.
- ^ Хеннеманн, Стефан (2013). «Информационно-насыщенная визуализация плотных географических сетей». Журнал карт. 9 (1): 1–8. Дои:10.1080/17445647.2012.753850.
- ^ Ламере, Пол (2012-11-12). "Бесконечный музыкальный автомат". Музыкальное оборудование.
- ^ Jetz, W .; Г. Х. Томас; Дж. Б. Джой; К. Хартманн; А. О. Муерс (15 ноября 2012 г.). «Глобальное разнообразие птиц в пространстве и времени». Природа. 491 (7424): 444–448. Bibcode:2012Натура.491..444J. Дои:10.1038 / природа11631. PMID 23123857.
- ^ Ип, Кевин; и другие. (26 сентября 2012 г.). «Классификация участков генома человека на основе экспериментально определенных сайтов связывания более 100 факторов, связанных с транскрипцией». Геномная биология. 13 (9): R48. Дои:10.1186 / gb-2012-13-9-r48. ЧВК 3491392. PMID 22950945.
- ^ Барбас, Хелен (октябрь 2017 г.). Пауло Дж. Гонсалвес (ред.). VR, AR, MR МОДЕЛИРОВАНИЕ И ВДОХНОВЕНИЕ ИЗ "IRON MAN 3" (PDF). Европейская конференция по моделированию и моделированию. Получено 6 ноября 2017.
- ^ «Проект Human Connectome». НАЦИОНАЛЬНЫЕ ИНСТИТУТЫ ЗДРАВООХРАНЕНИЯ США.
- ^ "Hard Cell". Экономист. 9 марта 2013 г.. Получено 11 марта 2013.
- ^ "Введение в циркулярные данные, особенности и использование // Циркулярная визуализация геномных данных CIRCOS".
- ^ Krzywinski, M; Schein, J; Бироль, I; Коннорс, Дж; Гаскойн, Р. Хорсман, Д; Джонс, SJ; Марра, Массачусетс (28 мая 2009 г.). "Circos: информационная эстетика для сравнительной геномики". Геномные исследования. 19 (9): 1639–1645. Дои:10.1101 / гр.092759.109. ЧВК 2752132. PMID 19541911.
- ^ Иримия, Андрей; Chambers, M.C .; Torgerson, C.M .; Filippou, M .; Hovda, D.A .; Alger, J.R .; Gerig, G .; Toga, A.W .; Vespa, PM; Kikinis, R .; Ван Хорн, Дж. Д. (6 февраля 2012 г.). «Индивидуальная визуализация коннектомики для оценки атрофии белого вещества при черепно-мозговой травме». Границы неврологии. 3: 10. Дои:10.3389 / fneur.2012.00010. ЧВК 3275792. PMID 22363313.
- ^ Ван Хорн, Джон Д .; Irimia, A .; Torgerson, C.M .; Chambers, M.C .; Kikinis, R .; Тога, А. (16 мая 2012 г.). Sporns, Олаф (ред.). «Картирование нарушений связи в случае Финеаса Гейджа». PLoS ONE. 7 (5): e37454. Bibcode:2012PLoSO ... 737454V. Дои:10.1371 / journal.pone.0037454. ЧВК 3353935. PMID 22616011.
- ^ Ингалхаликар, Мадхура; Алекс Смит; Дрю Паркер; Теодор Саттертуэйт; Марк Эллиотт; Коша Рупарел; Хакон Хаконарсон; Ракель Гур; Рагини Верма (декабрь 2013 г.). «Половые различия в структурном коннектоме человеческого мозга». Труды Национальной академии наук. 111 (2): 823–8. Bibcode:2014ПНАС..111..823И. Дои:10.1073 / pnas.1316909110. ЧВК 3896179. PMID 24297904.
- ^ Мессе, Арно; Софи Каплен; Мелани Пелегрини-Иссак; Софи Бланчо; Ричард Леви; Нозар Агахани; Мишель Монтрей; Хабиб Бенали; Стефан Лехериси (6 июня 2013 г.). «Специфические и развивающиеся изменения сети состояния покоя при постконтузионном синдроме после легкой травматической травмы головного мозга». PLoS ONE. 8 (6): e65470. Bibcode:2013PLoSO ... 865470M. Дои:10.1371 / journal.pone.0065470. ЧВК 3675039. PMID 23755237.
- ^ Ви, Чонг-Яу; Пью-Тиан Яп; Даоцян Чжан; Лихонг Ван; Динган Шен (7 марта 2013 г.). «Моделирование связности разреженных фМРТ с ограничениями по группе для выявления умеренных когнитивных нарушений». Структура и функции мозга. 219 (2): 641–656. Дои:10.1007 / s00429-013-0524-8. ЧВК 3710527. PMID 23468090.
- ^ Иримия, Андрей; Джек Ван Хорн (29 октября 2012 г.). «Структурная, коннектомическая и сетевая ковариация человеческого мозга». NeuroImage. 66: 489–499. Дои:10.1016 / j.neuroimage.2012.10.066. ЧВК 3586751. PMID 23116816.
- ^ Pandit, A.S .; Робинсон Э; Aljabar P; Ball G; Гусиас И.С. Ван З; Hajnal JV; Rueckert D; Counsell SJ; Montana G; Эдвардс AD (31 марта 2013 г.). «Картирование структурных связей у младенцев с помощью всего мозга выявляет измененную силу связи, связанную с ростом и преждевременными родами». Кора головного мозга. 24 (9): 2324–2333. Дои:10.1093 / cercor / bht086. PMID 23547135.
- ^ Sporns, Олаф (2011). Сети мозга. MIT Press. ISBN 978-0-262-01469-4.
дальнейшее чтение
[далее 1][далее 2][далее 3][далее 4]
- ^ Петрелла, Джеффри; П. Мурали Дорайсвами (9 апреля 2013 г.). «От мостов Кенигсберга до полей Альцгеймера». Неврология. 80 (15): 1360–2. Дои:10.1212 / WNL.0b013e31828c3062. PMID 23486887.
- ^ Крэддок, Р. Кэмерон; Саад Джбабди; Чао-Гань Янь; Джошуа Т. Фогельштейн; Ф. Ксавье Кастелланос; Адриана Ди Мартино; Клэр Келли; Кейт Хеберлейн; Стэн Колкомб; Майкл П. Милхэм (июнь 2013 г.). «Визуализация человеческих коннектомов на макроуровне». Методы природы. 10 (6): 524–39. Дои:10.1038 / nmeth.2482. ЧВК 4096321. PMID 23722212.
- ^ Маргулис, Дэниел; Иоахим Бёттгер; Айми Ватанабе; Кшиштоф Й. Горголевски (15 октября 2013 г.). «Визуализация человеческого коннектома». NeuroImage. 80: 445–61. Дои:10.1016 / j.neuroimage.2013.04.111. PMID 23660027.
- ^ Карунакаран, Суганья; Мэтью Дж. Ролло; Камин Ким; Джессика А. Джонсон; Гридхар П. Каламангалам; Бехнаам Аажанг; Нитин Тандон (5 декабря 2017 г.). «Сеть межприступной мезиальной височной эпилепсии». Эпилепсия. 59 (1): 244–258. Дои:10.1111 / epi.13959. PMID 29210066.